More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3487 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3487  ABC transporter related protein  100 
 
 		 247 aa  490  1e-137  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3869  ABC transporter related  60 
 
 		 235 aa  270  2e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.166635  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4015  ABC transporter related  55.65 
 
 		 235 aa  256  3e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8311  ABC transporter related  57.27 
 
 		 236 aa  243  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.659744  normal  0.571169 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4737  ABC transporter related  50.22 
 
 		 940 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  43.35 
 
 		 234 aa  194  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3056  ABC transporter related  41.53 
 
 		 239 aa  188  5.999999999999999e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0387789  hitchhiker  0.000278383 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3031  ABC transporter related  42.68 
 
 		 247 aa  188  9e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0358479  normal  0.333299 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3016  ABC transporter related  42.28 
 
 		 247 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498705  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3062  ABC transporter related  42.28 
 
 		 247 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  42.92 
 
 		 236 aa  186  4e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3570  ABC transporter related  44.44 
 
 		 247 aa  185  5e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0703152 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0356  ABC transporter related  42.15 
 
 		 242 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0865  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  43.78 
 
 		 240 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0314123  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0296  ABC transporter related  42.44 
 
 		 240 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.280952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  41.7 
 
 		 237 aa  182  3e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1161  ABC transporter related  42.44 
 
 		 240 aa  183  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17309  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1767  ABC transporter related  45.61 
 
 		 238 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.428045  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1696  ABC transporter-related protein  45.61 
 
 		 238 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0250061  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0762  ABC transporter-related protein  42.73 
 
 		 241 aa  182  5.0000000000000004e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000284565 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2137  ABC transporter related protein  47.06 
 
 		 251 aa  182  6e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0427504 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1795  ABC transporter related  42.44 
 
 		 240 aa  181  7e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2845  ABC transporter-related protein  42.56 
 
 		 253 aa  181  7e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0734764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0358  ABC transporter related  40.33 
 
 		 242 aa  181  9.000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  41.63 
 
 		 236 aa  181  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1835  ABC transporter related  39.67 
 
 		 238 aa  180  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3770  ABC transporter related protein  42.49 
 
 		 237 aa  180  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  0.0116376 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3396  ABC transporter related  42.36 
 
 		 229 aa  179  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0796  ABC transporter related  44.4 
 
 		 236 aa  179  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.787877  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  41.45 
 
 		 235 aa  179  4e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  42.37 
 
 		 245 aa  178  7e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3793  ABC transporter related  39.91 
 
 		 238 aa  178  7e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4379  ABC transporter related protein  44.21 
 
 		 240 aa  178  9e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.957322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2585  ABC transporter related  41.13 
 
 		 233 aa  177  1e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3291  hypothetical protein  43.53 
 
 		 237 aa  177  1e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1980  ABC-type branched-chain amino acid transport systems ATPase component-like protein  46.58 
 
 		 898 aa  177  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.755596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2182  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  44.96 
 
 		 238 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1126  putative amino acid ATP-binding ABC transporter protein  42.2 
 
 		 237 aa  177  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  0.0994747 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5343  ABC transporter related  41.28 
 
 		 235 aa  176  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.163228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20640  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  43.48 
 
 		 239 aa  177  2e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.171574  normal  0.883119 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  39.15 
 
 		 234 aa  176  3e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3204  ABC transporter related  39.74 
 
 		 237 aa  176  3e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3169  ABC transporter related  38.3 
 
 		 238 aa  176  4e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0892288  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0838  ABC transporter related  41.03 
 
 		 239 aa  176  4e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1878  ABC transporter-related protein  39.48 
 
 		 242 aa  176  4e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3205  ABC transporter related  39.74 
 
 		 239 aa  175  5e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.689067  normal  0.429117 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0556  ABC transporter-like  41.28 
 
 		 238 aa  175  5e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000214193  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0113  ABC transporter related  38.82 
 
 		 236 aa  175  6e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  41.56 
 
 		 258 aa  175  6e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4486  ABC transporter related  42.04 
 
 		 260 aa  175  7e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.064197  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2705  ABC transporter related  38.2 
 
 		 238 aa  175  7e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0641  ABC transporter related  43.89 
 
 		 234 aa  175  7e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2315  ABC transporter related  38.2 
 
 		 238 aa  175  7e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.129419  hitchhiker  0.000435411 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4112  high-affinity amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.2 
 
 		 233 aa  174  9e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0754039  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  42.65 
 
 		 238 aa  174  9e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3518  ABC transporter related  39.09 
 
 		 240 aa  174  9.999999999999999e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0966406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2725  ABC transporter related  38.3 
 
 		 238 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.605648  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0609  ABC transporter related  40.74 
 
 		 240 aa  174  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.773218 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  42.31 
 
 		 237 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2102  ABC transporter related  39.15 
 
 		 265 aa  174  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3849  ABC transporter  40.93 
 
 		 233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1393  ABC transporter related protein  42.31 
 
 		 236 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3305  ABC transporter related  45.73 
 
 		 822 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3361  ABC transporter related  39.48 
 
 		 242 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.413712 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4056  ABC transporter related  42.99 
 
 		 240 aa  173  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2709  ABC transporter related  39.48 
 
 		 242 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.810827  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  40.76 
 
 		 235 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  40.34 
 
 		 235 aa  173  2.9999999999999996e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2756  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  41.45 
 
 		 234 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.211076  normal  0.384438 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5837  ABC transporter related  41.7 
 
 		 234 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000984285 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1209  ABC transporter related  41.7 
 
 		 256 aa  173  2.9999999999999996e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.093328  normal  0.473951 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0484  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  38.98 
 
 		 237 aa  173  2.9999999999999996e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2519  ABC transporter related  36.91 
 
 		 238 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.644805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1726  ABC transporter related  40.17 
 
 		 237 aa  172  3.9999999999999995e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.972485  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2863  ABC transporter-related protein  37.87 
 
 		 238 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2412  ABC transporter related  36.91 
 
 		 238 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6115  ABC transporter related  36.91 
 
 		 238 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4754  ABC transporter related  37.55 
 
 		 238 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.616033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2494  ABC transporter related  36.91 
 
 		 238 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  39.32 
 
 		 234 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1883  ABC transporter related  36.91 
 
 		 238 aa  172  5e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0731  ABC transporter related  41.63 
 
 		 237 aa  172  5e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1291  ABC transporter related  38.72 
 
 		 264 aa  172  5e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  39.32 
 
 		 233 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4863  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  40.6 
 
 		 238 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0000477464  hitchhiker  0.0000052401 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0601  ABC transporter  40.25 
 
 		 238 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.190896  normal  0.541783 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4741  ABC transporter related  40.6 
 
 		 238 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000344378  hitchhiker  0.000000131699 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  36.48 
 
 		 238 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1970  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  36.91 
 
 		 234 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000796203  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2541  ABC transporter related  36.48 
 
 		 238 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0266  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  36.91 
 
 		 238 aa  171  9e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000214299  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0882  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  36.91 
 
 		 238 aa  171  9e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.000000000000026853  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0986  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  36.91 
 
 		 238 aa  171  9e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350992  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1146  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  36.91 
 
 		 238 aa  171  9e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000313887  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4553  ABC transporter related  39.22 
 
 		 234 aa  171  9e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  38.14 
 
 		 239 aa  171  9e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  36.91 
 
 		 238 aa  171  9e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00134652  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0943  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  36.91 
 
 		 238 aa  171  9e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00876691  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0858  ABC transporter related  44.35 
 
 		 230 aa  171  1e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.269038  normal  0.152569 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5692  ABC transporter related  40.85 
 
 		 234 aa  171  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010773 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>