80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3062 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3062  cytochrome c class I  100 
 
 		 303 aa  622  1e-177  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0184477  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2676  hypothetical protein  60.14 
 
 		 269 aa  330  1e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.543217 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1295  cytochrome c class I  54.73 
 
 		 276 aa  308  8e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.669902 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16190  cytochrome c, mono- and diheme variants family  45.61 
 
 		 263 aa  254  1.0000000000000001e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.188569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0963  cytochrome c, class I  49.13 
 
 		 268 aa  251  8.000000000000001e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0745087 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1678  cytochrome c class I  46.18 
 
 		 289 aa  249  5e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1021  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome c subunit  43.03 
 
 		 307 aa  249  5e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.121328  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14180  cytochrome c, mono- and diheme variants family  47.12 
 
 		 266 aa  248  9e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.616928  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1447  cytochrome c class I  48.31 
 
 		 284 aa  246  4e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0356963  normal  0.171198 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15700  cytochrome c, mono- and diheme variants family  48.99 
 
 		 259 aa  241  7.999999999999999e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.871134  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1891  cytochrome c class I  47.97 
 
 		 259 aa  238  6.999999999999999e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.527374  hitchhiker  0.000337472 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3134  cytochrome c class I  39.82 
 
 		 311 aa  227  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3251  cytochrome c class I  44.33 
 
 		 277 aa  216  2.9999999999999998e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0775555 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3294  cytochrome c, class I  46.53 
 
 		 277 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.79873  normal  0.176806 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2210  cytochrome c, class I  44.75 
 
 		 262 aa  216  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0119453  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3341  cytochrome c class I  42.86 
 
 		 295 aa  216  4e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3107  cytochrome c, class I  42.86 
 
 		 305 aa  211  2e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510771  normal  0.352992 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12130  cytochrome c, mono- and diheme variants family  49 
 
 		 256 aa  211  2e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.298886  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4119  cytochrome c class I  44.95 
 
 		 271 aa  210  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.83541 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3526  cytochrome c class I  45.71 
 
 		 277 aa  207  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021541 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1810  cytochrome c class I  39.64 
 
 		 294 aa  206  3e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.780394  normal  0.101949 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2076  cytochrome c class I  51.23 
 
 		 261 aa  206  6e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1374  cytochrome c class I  44.9 
 
 		 270 aa  205  6e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317055  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3135  cytochrome c, class I  43.97 
 
 		 289 aa  202  4e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1947  cytochrome c class I  42.71 
 
 		 262 aa  202  6e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000151337 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2009  cytochrome c class I  46.28 
 
 		 259 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2955  cytochrome c, class I  45.88 
 
 		 278 aa  190  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3558  cytochrome c, class I  44.37 
 
 		 273 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0912153 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10680  cytochrome c, mono- and diheme variants family  43.2 
 
 		 275 aa  187  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0523281  normal  0.768267 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3303  cytochrome c, class I  44.01 
 
 		 272 aa  186  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3292  cytochrome c, class I  44.01 
 
 		 272 aa  186  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.250177  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3354  cytochrome c, class I  44.01 
 
 		 272 aa  186  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0582943  normal  0.0591201 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3249  cytochrome c class I  44.31 
 
 		 255 aa  185  9e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00726195  hitchhiker  0.0000284914 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12222  ubiquinol-cytochrome C reductase qcrC (cytochrome C subunit)  39.59 
 
 		 280 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2693  cytochrome c class I  38.89 
 
 		 306 aa  176  4e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3056  cytochrome c class I  44.49 
 
 		 295 aa  171  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.294486  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1827  cytochrome c class I  36.95 
 
 		 280 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2545  putative cytochrome c  26.87 
 
 		 350 aa  61.2  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0456  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  24.41 
 
 		 312 aa  57  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.844005  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1360  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  23.11 
 
 		 308 aa  53.1  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.240618 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2214  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.89 
 
 		 689 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.143053  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6265  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  36.08 
 
 		 289 aa  50.4  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.142904 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5932  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  36.08 
 
 		 289 aa  50.4  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.322856  normal  0.495001 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5923  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  25.58 
 
 		 293 aa  48.9  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.123388  normal  0.389873 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1003  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  26.41 
 
 		 304 aa  47.4  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2072  cytochrome c, class I  40 
 
 		 712 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.901126 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1415  cytochrome c, class I  35.53 
 
 		 708 aa  46.6  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.526567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3370  cytochrome c, class I  38.24 
 
 		 691 aa  46.2  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384758  normal  0.0138407 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2499  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.85 
 
 		 726 aa  45.8  0.0009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.345014  normal  0.965839 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2038  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit III  25.46 
 
 		 304 aa  45.4  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0645844  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0804  cytochrome c family protein  35.53 
 
 		 721 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1107  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  26.43 
 
 		 307 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.1867  normal  0.890058 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2348  cytochrome c family protein  35.53 
 
 		 694 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.903737  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1200  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  25.76 
 
 		 307 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.944048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3042  cytochrome c, class I  31.31 
 
 		 259 aa  45.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.909018  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1236  putative bifunctional cbb3-type cytochrome c oxidase subunit II/cytochrome c  23.95 
 
 		 286 aa  45.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.385578  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60490  putative cytochrome c  50 
 
 		 675 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00637068  normal  0.0584653 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2484  cytochrome c family protein  35.53 
 
 		 721 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0635463  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1587  cytochrome c, class I  24.31 
 
 		 220 aa  44.3  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0500716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5211  putative cytochrome c  52.63 
 
 		 675 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0072933  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1071  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  34.12 
 
 		 699 aa  43.9  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5989  Cytochrome c  32.91 
 
 		 773 aa  44.3  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0014  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  26.19 
 
 		 293 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0653  cytochrome c  32.91 
 
 		 130 aa  44.3  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.963006  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1968  cytochrome c class I  27.9 
 
 		 238 aa  44.3  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000548419  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2542  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  24.02 
 
 		 294 aa  43.5  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.854548 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2041  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit III  23.27 
 
 		 304 aa  43.5  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0817  cytochrome c, class I  31.91 
 
 		 669 aa  43.5  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.04472  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2778  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  30.71 
 
 		 305 aa  43.9  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.452004  normal  0.247491 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2155  cytochrome c, class I  32.91 
 
 		 728 aa  43.5  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2773  hypothetical protein  31.48 
 
 		 151 aa  43.5  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000119865  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2696  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  29.29 
 
 		 726 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0376  cytochrome c oxidase, Cbb3-type, subunit III  26.47 
 
 		 287 aa  43.1  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0012  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  26.24 
 
 		 293 aa  42.7  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2492  cytochrome c, class I  30.84 
 
 		 698 aa  42.7  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00140351  normal  0.928162 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1526  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  25.63 
 
 		 311 aa  42.7  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3041  putative bifunctional cbb3-type cytochrome c oxidase subunit II/cytochrome c  23.95 
 
 		 286 aa  42.7  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4251  cytochrome c class I  39.13 
 
 		 286 aa  42.7  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0839506  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1279  cytochrome C oxidase subunit III  25.55 
 
 		 326 aa  42.7  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.55862 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1441  putative cytochrome c  33.78 
 
 		 311 aa  42.4  0.009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.668743  normal  0.951652 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>