56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4251 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4251  cytochrome c class I  100 
 
 
286 aa  585  1e-166  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0839506  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2655  cytochrome c class I  34.23 
 
 
144 aa  58.9  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1992  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  25.79 
 
 
323 aa  57.8  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1050  cytochrome c oxidase, subunit CcoP  29.3 
 
 
326 aa  54.7  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.26248  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2363  cytochrome c class I  32.81 
 
 
138 aa  53.1  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.217557 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3991  cytochrome c oxidase, subunit II  28.68 
 
 
513 aa  52.4  0.000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3864  cytochrome c oxidase, subunit II  29.07 
 
 
513 aa  52  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3791  cytochrome c oxidase, subunit II  29.07 
 
 
513 aa  52  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2877  cytochrome c family protein  27.5 
 
 
430 aa  50.4  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02300  hypothetical protein  27.2 
 
 
324 aa  50.4  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003470  cytochrome c oxidase subunit CcoP  26.2 
 
 
324 aa  50.4  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.204703  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4136  cytochrome c class I  27.96 
 
 
286 aa  50.1  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1498  cytochrome c, class I  32.32 
 
 
146 aa  50.1  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2631  cytochrome c class I  32.32 
 
 
147 aa  50.1  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2013  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  24.8 
 
 
324 aa  49.7  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00187341  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0936  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  25.57 
 
 
321 aa  49.3  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1522  cytochrome c oxidase, subunit II  35.06 
 
 
330 aa  48.1  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1489  cytochrome C  27.33 
 
 
430 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.322936  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0154  cytochrome c oxidase, subunit II  28.47 
 
 
518 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1350  cytochrome c family protein  27.33 
 
 
430 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47168  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2484  cytochrome c, class I  29.75 
 
 
138 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.789721  normal  0.114266 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1356  cytochrome c family protein  27.33 
 
 
430 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1824  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit III  24.44 
 
 
317 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1402  hypothetical protein  29.81 
 
 
170 aa  47  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.781476  normal  0.402158 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0634  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  25.9 
 
 
304 aa  46.6  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4606  cytochrome c oxidase, subunit II  26.39 
 
 
513 aa  46.6  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2959  cytochrome c class I  31.91 
 
 
571 aa  46.2  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2859  hypothetical protein  29.45 
 
 
307 aa  46.2  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0235479 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1280  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  24.07 
 
 
296 aa  46.2  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69300  hypothetical protein  30.57 
 
 
633 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1601  cytochrome c, class I  31.43 
 
 
125 aa  45.8  0.0009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.402085 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1564  cytochrome C oxidase polypeptide II  31.87 
 
 
384 aa  45.4  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05464  cytochrome c  22.58 
 
 
718 aa  45.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6394  hypothetical protein  27.03 
 
 
687 aa  45.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0632  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  26.63 
 
 
311 aa  45.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  34.26 
 
 
316 aa  44.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5948  cytochrome c oxidase, subunit II  31.82 
 
 
318 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0120  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  35 
 
 
339 aa  44.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1400  cytochrome c, class I  25.62 
 
 
421 aa  44.3  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5764  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  24.07 
 
 
447 aa  43.9  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.729406  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5993  hypothetical protein  31.65 
 
 
652 aa  43.9  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44400  putative cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  24.22 
 
 
318 aa  43.5  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2996  cytochrome c oxidase, subunit II  34.58 
 
 
329 aa  43.5  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.941612  hitchhiker  0.00487692 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1988  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  24 
 
 
323 aa  43.5  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0201798  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3780  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit III  24.22 
 
 
318 aa  43.5  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1566  diheme cytochrome c  23.97 
 
 
324 aa  43.1  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2217  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  24.4 
 
 
318 aa  43.1  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.04222  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1676  cytochrome c oxidase, subunit II  34.23 
 
 
337 aa  42.7  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1600  cytochrome c oxidase, subunit II  34.23 
 
 
337 aa  43.1  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0101  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  30.3 
 
 
329 aa  42.7  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000967148 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2070  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  25.9 
 
 
317 aa  42.7  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.542754  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1526  hypothetical protein  50 
 
 
201 aa  42.7  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.859315  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8678  cytochrome c class I  29.2 
 
 
185 aa  42.7  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00176651  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0957  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.43 
 
 
723 aa  42.7  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.12457  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2607  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  23.77 
 
 
332 aa  42.4  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00078494  normal  0.780558 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0709  cytochrome c oxidase subunit II  30.36 
 
 
355 aa  42.4  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.669005  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>