57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2648 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2648  hypothetical protein  100 
 
 
191 aa  375  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0118253  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4956  hypothetical protein  42.47 
 
 
207 aa  134  9e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.56336  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4394  hypothetical protein  42.39 
 
 
186 aa  130  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.487067  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4511  hypothetical protein  37.77 
 
 
188 aa  119  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0916947  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7213  hypothetical protein  40.74 
 
 
180 aa  115  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.117419 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4205  hypothetical protein  37.04 
 
 
185 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520104  normal  0.0181669 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4018  hypothetical protein  38.83 
 
 
196 aa  109  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.483907  normal  0.202254 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5441  hypothetical protein  36.17 
 
 
194 aa  106  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5150  hypothetical protein  35.11 
 
 
189 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5694  hypothetical protein  36.02 
 
 
190 aa  98.6  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.195445 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5062  hypothetical protein  36.75 
 
 
167 aa  98.2  6e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1069  hypothetical protein  36.17 
 
 
191 aa  90.1  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3764  hypothetical protein  40.21 
 
 
194 aa  89.4  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.343176  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1118  hypothetical protein  33.69 
 
 
190 aa  89  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.581554 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1401  hypothetical protein  33.16 
 
 
194 aa  86.7  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136211  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0915  hypothetical protein  32.97 
 
 
197 aa  81.6  0.000000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.649673  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6625  hypothetical protein  36.16 
 
 
189 aa  77.4  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11744  hypothetical protein  31.79 
 
 
189 aa  71.2  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.213346  normal  0.501181 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5072  hypothetical protein  32.35 
 
 
194 aa  68.2  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5365  hypothetical protein  32.35 
 
 
194 aa  68.2  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.561933 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4984  hypothetical protein  32.35 
 
 
194 aa  68.2  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1542  hypothetical protein  32.79 
 
 
184 aa  62.4  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.272764  hitchhiker  0.00246606 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2932  hypothetical protein  28.16 
 
 
226 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3298  hypothetical protein  32.82 
 
 
200 aa  60.5  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.584526  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6121  hypothetical protein  27.8 
 
 
202 aa  58.9  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18336  normal  0.0364143 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13807  hypothetical protein  29.32 
 
 
194 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.280753  normal  0.497634 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3545  hypothetical protein  31.61 
 
 
197 aa  58.5  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.266411  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8890  hypothetical protein  30.34 
 
 
199 aa  58.2  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10586  ArsR family transcriptional regulator  30.27 
 
 
437 aa  57.8  0.00000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.4131599999999997e-27  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1843  hypothetical protein  32.12 
 
 
186 aa  57.8  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000379282  normal  0.068852 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2137  hypothetical protein  29.35 
 
 
206 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00112657 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0334  hypothetical protein  31.37 
 
 
230 aa  55.5  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2112  hypothetical protein  32.3 
 
 
177 aa  55.1  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2465  hypothetical protein  29.29 
 
 
193 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00930954  normal  0.0949599 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1453  hypothetical protein  30.49 
 
 
186 aa  53.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.313622  normal  0.465473 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6375  hypothetical protein  29.3 
 
 
220 aa  52.4  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.172776 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2196  hypothetical protein  27.36 
 
 
206 aa  52  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582945  normal  0.0278946 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04730  conserved hypothetical protein TIGR03086  26.09 
 
 
196 aa  52  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.217314  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2150  hypothetical protein  27.36 
 
 
206 aa  52  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2519  hypothetical protein  29.19 
 
 
186 aa  51.2  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.291648 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0172  hypothetical protein  33.86 
 
 
131 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0824  hypothetical protein  30.77 
 
 
198 aa  49.3  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1377  hypothetical protein  38.57 
 
 
194 aa  48.5  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0059  hypothetical protein  24.49 
 
 
192 aa  48.5  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4594  hypothetical protein  28.07 
 
 
187 aa  48.5  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.232846  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02890  conserved hypothetical protein TIGR03086  26.67 
 
 
187 aa  45.8  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10752  hypothetical protein  28.21 
 
 
182 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000019473  normal  0.221771 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7305  hypothetical protein  27.75 
 
 
189 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0874  hypothetical protein  33.58 
 
 
197 aa  44.3  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3649  hypothetical protein  35.63 
 
 
238 aa  43.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0565628 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2270  hypothetical protein  28.31 
 
 
198 aa  42.4  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.674256  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2526  hypothetical protein  28.92 
 
 
202 aa  42.4  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.19758  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2309  hypothetical protein  26.6 
 
 
193 aa  42  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0901282  normal  0.039758 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3933  hypothetical protein  36.36 
 
 
198 aa  41.6  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0576755  hitchhiker  0.00503729 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1384  hypothetical protein  30.27 
 
 
184 aa  41.2  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.132892  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2350  hypothetical protein  25.3 
 
 
187 aa  41.2  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.146654  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0149  hypothetical protein  30.52 
 
 
194 aa  41.2  0.01  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.214633  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>