72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1009 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_1009  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 536 aa  1033    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0945  multi antimicrobial extrusion protein MatE  42.51 
 
 		 495 aa  273  8.000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.903745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8594  polysaccharide biosynthesis protein  40.1 
 
 		 434 aa  209  8e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1827  hypothetical protein  37.92 
 
 		 522 aa  164  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.356009  normal  0.0154869 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3971  polysaccharide biosynthesis protein  41.91 
 
 		 582 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.137474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2684  polysaccharide biosynthesis protein  24.09 
 
 		 539 aa  99  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  22.17 
 
 		 517 aa  83.6  0.000000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1211  polysaccharide biosynthesis protein  21.67 
 
 		 489 aa  77.8  0.0000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2457  polysaccharide biosynthesis protein  23.35 
 
 		 514 aa  77.4  0.0000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.267844  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  19.35 
 
 		 499 aa  77  0.0000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2438  polysaccharide biosynthesis protein  24.27 
 
 		 495 aa  76.3  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2188  polysaccharide biosynthesis protein  24.28 
 
 		 495 aa  75.1  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3541  polysaccharide biosynthesis protein  29.53 
 
 		 474 aa  73.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1836  hypothetical protein  45.71 
 
 		 523 aa  71.6  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1862  polysaccharide efflux transporter, putative  25.35 
 
 		 496 aa  71.2  0.00000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2073  polysaccharide biosynthesis protein  31.25 
 
 		 492 aa  71.6  0.00000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3832  polysaccharide biosynthesis protein  26.82 
 
 		 471 aa  71.2  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.431872  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  24.02 
 
 		 512 aa  69.7  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4091  polysaccharide biosynthesis protein  18.7 
 
 		 430 aa  69.7  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3018  polysaccharide biosynthesis protein  26.56 
 
 		 468 aa  68.9  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2304  polysaccharide biosynthesis protein  25.26 
 
 		 494 aa  68.6  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.298994  normal  0.0362143 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2006  polysaccharide biosynthesis protein  25.99 
 
 		 529 aa  65.5  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.300214  normal  0.433718 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1020  polysaccharide biosynthesis protein  30.23 
 
 		 490 aa  62.4  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2520  polysaccharide biosynthesis protein  25.58 
 
 		 474 aa  62  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.889784 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3983  polysaccharide biosynthesis associated protein  31.41 
 
 		 467 aa  60.8  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0259  polysaccharide biosynthesis protein  30.24 
 
 		 498 aa  60.5  0.00000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6501  Membrane protein involved in the export of O- antigen and teichoic acid-like protein  32.84 
 
 		 448 aa  60.5  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4685  polysaccharide biosynthesis protein  29.13 
 
 		 453 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0987  polysaccharide biosynthesis protein  26.53 
 
 		 458 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.676741 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08851  hypothetical protein  24.71 
 
 		 484 aa  55.5  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.227884  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2754  polysaccharide biosynthesis protein  23.7 
 
 		 460 aa  53.1  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.316209  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0172  polysaccharide efflux transporter, putative  30.56 
 
 		 495 aa  53.1  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.377433 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5327  polysaccharide biosynthesis protein  30.6 
 
 		 445 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0472551  normal  0.0858273 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0777  polysaccharide biosynthesis protein  23.42 
 
 		 441 aa  52.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1305  polysaccharide biosynthesis protein  32.65 
 
 		 508 aa  51.6  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.855979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4001  polysaccharide biosynthesis protein  25.09 
 
 		 455 aa  50.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.443077 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0561  polysaccharide biosynthesis protein  24.6 
 
 		 456 aa  49.7  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1828  polysaccharide biosynthesis protein  27.67 
 
 		 529 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1391  polysaccharide biosynthesis protein  28.57 
 
 		 456 aa  49.3  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0950  polysaccharide biosynthesis protein  26.38 
 
 		 458 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0259794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3797  polysaccharide biosynthesis protein  26.88 
 
 		 461 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.683173  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2996  polysaccharide biosynthesis protein  28.88 
 
 		 459 aa  47.8  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143417 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2278  polysaccharide biosynthesis protein  28.91 
 
 		 516 aa  47.8  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6968  PST family polysaccharide export protein  26.06 
 
 		 458 aa  47  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.756164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1933  polysaccharide biosynthesis protein  34.31 
 
 		 135 aa  46.6  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.546859 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1476  polysaccharide biosynthesis protein  23.01 
 
 		 478 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.41524 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1120  polysaccharide biosynthesis protein  27.27 
 
 		 478 aa  46.6  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77221  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  25.12 
 
 		 490 aa  45.8  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6018  polysaccharide biosynthesis protein  27.03 
 
 		 433 aa  46.2  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.203106 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0417  polysaccharide synthase family protein  27.27 
 
 		 550 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00377185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4819  polysaccharide synthase family protein  27.27 
 
 		 550 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0294842  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4849  polysaccharide biosynthesis family protein  28.69 
 
 		 550 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4457  polysaccharide biosynthesis family protein; export protein for polysaccharides and teichoic acids  28.69 
 
 		 550 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0642469  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4538  polysaccharide biosynthesis protein  28.69 
 
 		 550 aa  46.2  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3370  polysaccharide biosynthesis protein  28.69 
 
 		 550 aa  46.2  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0247135  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4824  polysaccharide synthase family protein  28.69 
 
 		 550 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4603  polysaccharide biosynthesis family protein  28.69 
 
 		 550 aa  45.4  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0339143  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4439  polysaccharide biosynthesis family protein; export protein for polysaccharides and teichoic acids  28.69 
 
 		 550 aa  45.4  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4959  polysaccharide biosynthesis family protein  28.69 
 
 		 550 aa  45.4  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1411  polysaccharide biosynthesis protein  27.39 
 
 		 456 aa  45.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0414  polysaccharide biosynthesis protein  19.16 
 
 		 500 aa  45.1  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37906  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0926  polysaccharide biosynthesis protein  26.16 
 
 		 458 aa  45.1  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.287187 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4842  polysaccharide synthase family protein  28.69 
 
 		 550 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00735996  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2253  lipopolysaccharide (O-antigen)exporter  24.87 
 
 		 444 aa  44.7  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4360  polysaccharide biosynthesis protein  25.13 
 
 		 429 aa  45.1  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.86188 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  24.02 
 
 		 444 aa  45.1  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2748  polysaccharide biosynthesis protein  26.25 
 
 		 526 aa  44.7  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.327125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2873  O-antigen and teichoic acid-like export protein  23.24 
 
 		 508 aa  44.3  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.793444  normal  0.427284 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2504  polysaccharide biosynthesis protein  25.37 
 
 		 486 aa  44.3  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3553  polysaccharide biosynthesis protein  27.37 
 
 		 458 aa  44.3  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1384  polysaccharide biosynthesis protein  23.31 
 
 		 440 aa  44.3  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4028  polysaccharide biosynthesis protein  32.98 
 
 		 456 aa  43.5  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>