149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0600 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0600  hypothetical protein  100 
 
 
143 aa  271  2.0000000000000002e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0458  hypothetical protein  61.69 
 
 
175 aa  167  5e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.266832  normal  0.317587 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0900  hypothetical protein  62.59 
 
 
149 aa  157  7e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4352  Thioredoxin domain protein  75.24 
 
 
112 aa  147  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.289078  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0447  thioredoxin-related  57.58 
 
 
146 aa  133  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4232  putative thioredoxin  49.67 
 
 
170 aa  123  9e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.514509  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6171  thioredoxin domain-containing protein  66.33 
 
 
206 aa  119  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4375  hypothetical protein  50.85 
 
 
141 aa  102  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.358603 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3032  hypothetical protein  50 
 
 
155 aa  97.1  8e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4643  thioredoxin  56.47 
 
 
120 aa  94  6e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.81878  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18680  hypothetical protein  52.17 
 
 
175 aa  92.4  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.194491  normal  0.331564 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37690  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  37.41 
 
 
145 aa  82.8  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2110  putative thioredoxin  46.03 
 
 
152 aa  82.4  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0349096  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1559  putative thioredoxin  60.67 
 
 
130 aa  79  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.832345  hitchhiker  0.00666422 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4527  thioredoxin domain-containing protein  35.25 
 
 
140 aa  71.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.509304  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4614  thioredoxin domain-containing protein  35.25 
 
 
140 aa  71.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4910  thioredoxin domain-containing protein  35.25 
 
 
140 aa  71.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5099  thioredoxin domain-containing protein  33.11 
 
 
143 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10831  thioredoxin thiX  40.62 
 
 
140 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220535 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1648  thioredoxin domain-containing protein  38.27 
 
 
140 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0259266  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1200  Thioredoxin domain protein  35.8 
 
 
98 aa  57  0.00000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3354  glutaredoxin  41.03 
 
 
86 aa  54.7  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0202302  normal  0.01077 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08920  thioredoxin  33.33 
 
 
102 aa  53.5  0.0000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000942681  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1896  thioredoxin  31.71 
 
 
102 aa  53.1  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00263225  hitchhiker  0.00000000000000449088 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6826  hypothetical protein  38.95 
 
 
140 aa  52  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0215  thioredoxin  33 
 
 
105 aa  49.7  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.370161  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3070  thioredoxin  25.97 
 
 
105 aa  48.1  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.990711  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1362  thioredoxin  35.29 
 
 
106 aa  47.8  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48539  thioredoxin h  30.25 
 
 
165 aa  47.4  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3109  thioredoxin  37.84 
 
 
107 aa  47  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3325  Thioredoxin domain protein  33.75 
 
 
176 aa  47.4  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000131659 
 
 
-
 
NC_002950  PG0034  thioredoxin  32.47 
 
 
104 aa  47  0.00009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1320  thioredoxin  30.69 
 
 
105 aa  46.6  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.113501  normal  0.148362 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  27.47 
 
 
106 aa  46.2  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1976  thioredoxin  35.53 
 
 
109 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1133  thioredoxin  25.84 
 
 
98 aa  46.2  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.114517  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  28.26 
 
 
107 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0835  thioredoxin  22.5 
 
 
102 aa  46.2  0.0002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0427  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  22.55 
 
 
103 aa  46.2  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.66857e-16  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0311  hypothetical protein  27.27 
 
 
102 aa  46.2  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04950  thioredoxin  28.21 
 
 
105 aa  46.2  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0301  thioredoxin  30.77 
 
 
106 aa  46.2  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1738  Thioredoxin domain  38.57 
 
 
131 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.749275  normal  0.660647 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2624  thioredoxin  30.85 
 
 
104 aa  45.4  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000156705  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0813  thioredoxin  30 
 
 
109 aa  44.7  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.146615  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2885  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.05 
 
 
449 aa  44.7  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.326316 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18120  thioredoxin  25.29 
 
 
106 aa  45.1  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000183291  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  31.52 
 
 
108 aa  44.7  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0360  thioredoxin  26.14 
 
 
109 aa  44.3  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0739  thioredoxin  26.74 
 
 
104 aa  44.7  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.186683  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3579  thioredoxin  26.67 
 
 
107 aa  44.3  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.248424  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl178  thioredoxin  25 
 
 
102 aa  44.3  0.0006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0171  thioredoxin  28 
 
 
105 aa  44.3  0.0006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.620565  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1129  thioredoxin  28 
 
 
137 aa  44.3  0.0006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0651  thioredoxin  31.63 
 
 
145 aa  44.3  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1358  thioredoxin  32.43 
 
 
107 aa  43.9  0.0007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52686  thioredoxin  26.25 
 
 
117 aa  43.9  0.0007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.540777  normal  0.0222325 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1773  redox-active disulfide protein 1  33.77 
 
 
80 aa  43.9  0.0007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  34.92 
 
 
289 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000384652  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0425  thioredoxin domain-containing protein  29.29 
 
 
112 aa  43.9  0.0008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0908  redox-active disulfide protein 1  32.47 
 
 
80 aa  43.9  0.0008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.424409 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  34.92 
 
 
289 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  32.1 
 
 
107 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3812  thioredoxin reductase  35.59 
 
 
460 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2296  thioredoxin  26.74 
 
 
103 aa  43.5  0.0009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0737  thioredoxin  26.32 
 
 
104 aa  43.5  0.0009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0942767  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0143  thioredoxin  29.09 
 
 
104 aa  43.5  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0205  thioredoxin, putative  23.71 
 
 
108 aa  42.7  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.513083  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1412  thioredoxin  33.72 
 
 
104 aa  43.5  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  32.1 
 
 
107 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0031  thioredoxin  25 
 
 
110 aa  43.1  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0261  thioredoxin, putative  23.71 
 
 
108 aa  42.7  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689046 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1708  thioredoxin  32.53 
 
 
110 aa  43.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00102285  normal  0.772138 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0183  thioredoxin  29.09 
 
 
104 aa  43.5  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  28.24 
 
 
105 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0162  thioredoxin  29.09 
 
 
104 aa  43.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1513  thioredoxin  27.78 
 
 
109 aa  43.5  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000429326  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0136  thioredoxin  30.38 
 
 
107 aa  43.5  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000946631  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1151  thioredoxin  33.33 
 
 
105 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.951665  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5974  thioredoxin domain protein  25.56 
 
 
102 aa  42.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.897668  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0832  thioredoxin  28.71 
 
 
105 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  31.4 
 
 
106 aa  42.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6430  thioredoxin  26.47 
 
 
106 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0295  thioredoxin  34.09 
 
 
104 aa  42.7  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0738  thioredoxin 2  28.4 
 
 
140 aa  42.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  32.47 
 
 
107 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  29.52 
 
 
106 aa  42.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  29.41 
 
 
110 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1036  redox-active disulfide protein 1  32.47 
 
 
80 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1773  thioredoxin domain-containing protein  34.02 
 
 
131 aa  42.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1675  thioredoxin  37.84 
 
 
110 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.140064  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1003  thioredoxin  32.58 
 
 
110 aa  42  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0352077  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0556  thioredoxin  25.97 
 
 
144 aa  42  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000127919 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5927  thioredoxin  31.82 
 
 
110 aa  41.6  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365173  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1456  thioredoxin  30.16 
 
 
109 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2109  Thioredoxin domain  35.71 
 
 
131 aa  42  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.63713  normal  0.510323 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3849  thioredoxin  28.41 
 
 
108 aa  42  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1206  thioredoxin  28.21 
 
 
109 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.232039  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1359  thioredoxin  30.16 
 
 
109 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0428  thioredoxin  26.37 
 
 
110 aa  41.6  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>