45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1744 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1744  hypothetical protein  100 
 
 		 302 aa  592  1e-168  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4222  hypothetical protein  29.87 
 
 		 313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4504  hypothetical protein  27.92 
 
 		 319 aa  105  8e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1073  hypothetical protein  30.19 
 
 		 330 aa  101  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.179281  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0745  hypothetical protein  28.66 
 
 		 316 aa  97.8  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.579699 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1301  hypothetical protein  27.15 
 
 		 350 aa  95.9  7e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5600  hypothetical protein  25.4 
 
 		 319 aa  93.2  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1174  hypothetical protein  27.85 
 
 		 321 aa  92.4  8e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2879  hypothetical protein  27.15 
 
 		 339 aa  92.4  9e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0305  hypothetical protein  30.12 
 
 		 314 aa  88.6  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5623  hypothetical protein  26.57 
 
 		 320 aa  88.6  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0083696  normal  0.628731 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1606  hypothetical protein  30.77 
 
 		 319 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0731  hypothetical protein  27.17 
 
 		 328 aa  81.3  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000108123 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0549  hypothetical protein  25.39 
 
 		 347 aa  80.9  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.00564002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0577  hypothetical protein  27.17 
 
 		 359 aa  80.5  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.112901  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4413  hypothetical protein  25.5 
 
 		 326 aa  78.6  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00830012  normal  0.663771 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0755  integral membrane protein-like protein  23.76 
 
 		 325 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0643382 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0404  hypothetical protein  28.8 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2457  hypothetical protein  23.77 
 
 		 326 aa  70.5  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.379583  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3771  hypothetical protein  25 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.720928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0634  hypothetical protein  25.6 
 
 		 298 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2204  hypothetical protein  25.61 
 
 		 297 aa  63.5  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0412  hypothetical protein  25.6 
 
 		 309 aa  62  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1672  hypothetical protein  26.03 
 
 		 303 aa  62  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000269859  normal  0.37402 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1675  hypothetical protein  26.37 
 
 		 278 aa  61.6  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0604  hypothetical protein  25.17 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1029  hypothetical protein  24.64 
 
 		 380 aa  58.9  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1410  hypothetical protein  32.43 
 
 		 347 aa  58.2  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.92034  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1794  hypothetical protein  25.96 
 
 		 319 aa  56.2  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.51439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0688  hypothetical protein  26.33 
 
 		 305 aa  54.3  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.700427  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0463  hypothetical protein  25.54 
 
 		 288 aa  53.5  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0536  hypothetical protein  45 
 
 		 349 aa  53.1  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4166  hypothetical protein  26.98 
 
 		 316 aa  51.2  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.237065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0043  hypothetical protein  22.73 
 
 		 314 aa  51.6  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274939  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0140  hypothetical protein  26.85 
 
 		 351 aa  49.7  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167342 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1769  glycosyl transferase family protein  23.79 
 
 		 586 aa  48.5  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1805  hypothetical protein  22.84 
 
 		 332 aa  47  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.13446 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3061  hypothetical protein  27.56 
 
 		 345 aa  46.6  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.41699  normal  0.49585 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1614  hypothetical protein  23.49 
 
 		 320 aa  45.4  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4270  hypothetical protein  24.18 
 
 		 370 aa  44.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6336  membrane protein  24.42 
 
 		 358 aa  43.9  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00319801 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2495  hypothetical protein  24.68 
 
 		 297 aa  42.7  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000133938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2417  hypothetical protein  25.2 
 
 		 345 aa  42.7  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.486324 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0163  hypothetical protein  23.03 
 
 		 320 aa  42.4  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00309358 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4436  hypothetical protein  26.77 
 
 		 386 aa  42.4  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>