142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0884 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_0884  hypothetical protein  100 
 
 
217 aa  456  9.999999999999999e-129  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0648  hypothetical protein  31.98 
 
 
212 aa  108  6e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0360  methyltransferase type 12  28.77 
 
 
201 aa  82  0.000000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2052  Methyltransferase type 12  28.27 
 
 
211 aa  81.3  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2206  hypothetical protein  29.35 
 
 
195 aa  78.2  0.00000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00459198  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4403  SAM-binding motif-containing protein  27.78 
 
 
218 aa  76.3  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11537  hypothetical protein  30.72 
 
 
166 aa  75.1  0.0000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.574774 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3058  methyltransferase type 12  23 
 
 
208 aa  75.1  0.0000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6593  methyltransferase type 12  28.71 
 
 
206 aa  74.3  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0321  methyltransferase type 12  22.64 
 
 
210 aa  73.6  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.034044  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1292  methyltransferase type 12  25.24 
 
 
209 aa  68.6  0.00000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0144  SAM-binding motif-containing protein  27.23 
 
 
216 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0157  SAM-binding motif-containing protein  26.73 
 
 
216 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0703  hypothetical protein  25.38 
 
 
221 aa  68.2  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.220568  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3424  Methyltransferase type 11  30.53 
 
 
203 aa  65.9  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000529  hypothetical protein  27.27 
 
 
207 aa  64.3  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.338352  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0164  hypothetical protein  26.21 
 
 
195 aa  64.7  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.789241  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3310  SAM-binding motif-containing protein  27.36 
 
 
215 aa  64.3  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0193155  normal  0.377357 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05357  hypothetical protein  28.17 
 
 
204 aa  63.9  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3213  hypothetical protein  23.19 
 
 
210 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  32.2 
 
 
225 aa  56.6  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1668  LmbE family protein  37.18 
 
 
423 aa  51.6  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1847  methyltransferase type 11  33.63 
 
 
195 aa  51.2  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.512652  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  28.97 
 
 
196 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  28.1 
 
 
194 aa  49.7  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1528  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.15 
 
 
241 aa  48.5  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4086  methyltransferase type 11  29.59 
 
 
249 aa  48.5  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315577  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1558  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.15 
 
 
241 aa  48.5  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1846  methyltransferase type 11  31.03 
 
 
195 aa  48.5  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.441849  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0026  methyltransferase type 11  32.11 
 
 
262 aa  48.1  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3234  Methyltransferase type 11  24.79 
 
 
235 aa  48.1  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1309  Methyltransferase type 11  34.31 
 
 
231 aa  47.8  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.236304  normal  0.0297047 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1188  methyltransferase type 11  32.18 
 
 
201 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.351781  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1652  Methyltransferase type 11  33.77 
 
 
262 aa  48.1  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1205  methyltransferase type 11  32.18 
 
 
201 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.795774  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1215  methyltransferase type 11  32.18 
 
 
201 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0778 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0954  methyltransferase type 11  34.62 
 
 
219 aa  47.8  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0058  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  31.65 
 
 
239 aa  47  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0952  methyltransferase type 11  25 
 
 
272 aa  47  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1352  hypothetical protein  20.41 
 
 
206 aa  47  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1534  methyltransferase type 12  32.18 
 
 
201 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.657128  normal  0.275584 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0549  Methyltransferase type 11  26.67 
 
 
201 aa  47.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4330  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.18 
 
 
236 aa  47  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.249898  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  29.17 
 
 
225 aa  46.6  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2249  methyltransferase type 12  26.17 
 
 
217 aa  46.6  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.200806 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1845  methyltransferase type 11  27.64 
 
 
234 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0701  methyltransferase domain protein  24.35 
 
 
217 aa  46.6  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  32.18 
 
 
271 aa  46.2  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  35.53 
 
 
252 aa  46.6  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1164  methyltransferase type 11  31.48 
 
 
267 aa  46.2  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1312  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  25.69 
 
 
345 aa  45.8  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.82 
 
 
201 aa  45.8  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2377  hypothetical protein  35.37 
 
 
292 aa  45.8  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.969915  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51145  predicted protein  23.4 
 
 
363 aa  45.8  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  31.76 
 
 
215 aa  45.4  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1026  Methyltransferase type 11  24.79 
 
 
235 aa  45.4  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3333  Methyltransferase type 11  32.94 
 
 
257 aa  45.4  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1439  methyltransferase  31.48 
 
 
212 aa  45.1  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00779237  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2707  Methyltransferase type 12  32.61 
 
 
201 aa  45.1  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0494  Methyltransferase type 11  40.62 
 
 
228 aa  45.1  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4274  methyltransferase type 11  29.51 
 
 
243 aa  45.1  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.533221  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1078  SAM-dependent methyltransferase  30.26 
 
 
201 aa  44.3  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.215412  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  29.81 
 
 
209 aa  45.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0235  Methyltransferase type 11  28.36 
 
 
242 aa  44.3  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4890  methyltransferase type 12  28.57 
 
 
201 aa  44.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.909319  normal  0.033244 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0393  methyltransferase protein  32 
 
 
246 aa  44.3  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  31.71 
 
 
319 aa  44.7  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2296  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
209 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000023308  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2935  methyltransferase type 11  28.93 
 
 
249 aa  44.3  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1937  methyltransferase  25.58 
 
 
236 aa  43.9  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4343  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  41.18 
 
 
259 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1676  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.69 
 
 
243 aa  43.9  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257047  normal  0.49664 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.68 
 
 
255 aa  43.5  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21420  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  33.33 
 
 
233 aa  43.5  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0478514  hitchhiker  0.0000156795 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3033  methyltransferase type 11  26.92 
 
 
304 aa  43.9  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21650  methyltransferase family protein  27.78 
 
 
199 aa  44.3  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.920787 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2096  type 11 methyltransferase  29.41 
 
 
207 aa  43.5  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.423415  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1999  2-heptaprenyl-1,4- naphthoquinonemethyltransferas e  32.95 
 
 
235 aa  43.9  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.753273  normal  0.375757 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0010  Methyltransferase type 11  33.02 
 
 
248 aa  43.9  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1969  methyltransferase type 11  24.07 
 
 
214 aa  43.9  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00620087  normal  0.0463791 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2200  hypothetical protein  25.58 
 
 
236 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.029444  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3111  Methyltransferase type 11  29.63 
 
 
241 aa  43.9  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4083  Trans-aconitate 2-methyltransferase  37.18 
 
 
257 aa  43.9  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.30188 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0166  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.55 
 
 
239 aa  43.9  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00279122 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1039  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.46 
 
 
241 aa  43.1  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.71 
 
 
250 aa  43.1  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1285  hypothetical protein  36.99 
 
 
262 aa  43.1  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0843441  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3419  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.37 
 
 
299 aa  43.5  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0714  methyltransferase  32.1 
 
 
231 aa  43.5  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2592  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.88 
 
 
424 aa  43.1  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3312  hypothetical protein  26.95 
 
 
211 aa  43.1  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.644401 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1459  Methyltransferase type 11  29.9 
 
 
250 aa  43.1  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2692  Methyltransferase type 11  31.96 
 
 
270 aa  43.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79255  normal  0.0821355 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  33.75 
 
 
202 aa  43.1  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0429  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.36 
 
 
249 aa  43.5  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7096  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 
208 aa  42.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517227  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0587  Methyltransferase type 11  31.17 
 
 
220 aa  42.7  0.004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0834  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.92 
 
 
237 aa  43.1  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293263  normal  0.0185746 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.33 
 
 
252 aa  42.7  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31490  methyltransferase family protein  32.47 
 
 
205 aa  42.7  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>