More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3414 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3414  HhH-GPD family protein  100 
 
 		 287 aa  561  1.0000000000000001e-159  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9146  A/G-specific DNA glycosylase-like protein  77.82 
 
 		 291 aa  430  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4995  HhH-GPD family protein  73.05 
 
 		 291 aa  398  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0246379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4471  HhH-GPD family protein  72.32 
 
 		 296 aa  395  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2875  HhH-GPD:Iron-sulfur cluster loop  71.13 
 
 		 291 aa  385  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.738957  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0599  HhH-GPD family protein  68.88 
 
 		 307 aa  357  1.9999999999999998e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.404846  normal  0.0463679 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0467  HhH-GPD family protein  63.51 
 
 		 288 aa  335  5e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.31103  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8366  HhH-GPD family protein  63.33 
 
 		 310 aa  318  3.9999999999999996e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35330  A/G-specific DNA glycosylase  56.89 
 
 		 293 aa  308  5.9999999999999995e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12933  normal  0.479068 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4274  HhH-GPD family protein  58.12 
 
 		 299 aa  304  1.0000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.162627 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4708  HhH-GPD family protein  57.76 
 
 		 299 aa  300  1e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.109375  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0595  HhH-GPD family protein  58.8 
 
 		 303 aa  301  1e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.251234  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0357  HhH-GPD family protein  58.68 
 
 		 303 aa  300  2e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.347637  normal  0.0136889 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5132  HhH-GPD family protein  58.21 
 
 		 288 aa  296  3e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4746  HhH-GPD  58.21 
 
 		 288 aa  296  3e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4832  HhH-GPD family protein  58.21 
 
 		 288 aa  296  3e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.578699 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0963  HhH-GPD family protein  55.56 
 
 		 300 aa  293  2e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.313927  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4260  HhH-GPD  59.51 
 
 		 320 aa  293  2e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.931254  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0563  HhH-GPD family protein  59.57 
 
 		 315 aa  291  6e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630244 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5346  HhH-GPD family protein  57.09 
 
 		 290 aa  291  6e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24580  A/G-specific DNA glycosylase  58.66 
 
 		 311 aa  288  6e-77  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0341  HhH-GPD family protein  58.17 
 
 		 308 aa  288  9e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1102  HhH-GPD family protein  53.1 
 
 		 300 aa  284  1.0000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0343  HhH-GPD family protein  55.4 
 
 		 329 aa  282  5.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01570  A/G-specific adenine glycosylase  54.42 
 
 		 313 aa  280  2e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0642  HhH-GPD family protein  57.6 
 
 		 300 aa  279  3e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0860  HhH-GPD family protein  58.93 
 
 		 285 aa  277  1e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.553101 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0221  HhH-GPD family protein  56.99 
 
 		 335 aa  278  1e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230318  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0967  A/G-specific DNA glycosylase  48.01 
 
 		 328 aa  277  2e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0177  HhH-GPD family protein  54.72 
 
 		 347 aa  275  5e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13060  A/G-specific DNA glycosylase  56.14 
 
 		 285 aa  273  2.0000000000000002e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0610842  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06850  A/G-specific DNA glycosylase  53.38 
 
 		 313 aa  271  1e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13622  adenine glycosylase mutY  54.09 
 
 		 304 aa  270  2e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.23263e-43  normal  0.044333 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0394  HhH-GPD family protein  56.74 
 
 		 581 aa  270  2e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1438  HhH-GPD family protein  56.23 
 
 		 291 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.41653 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0490  HhH-GPD family protein  52.86 
 
 		 311 aa  269  5e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.270588  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3282  HhH-GPD family protein  54.23 
 
 		 303 aa  263  2e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.36301  hitchhiker  0.0043845 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1171  putative A/G-specific adenine glycosylase  42.86 
 
 		 331 aa  253  3e-66  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0418958 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2876  HhH-GPD family protein  47.87 
 
 		 272 aa  185  9e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0048727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1600  A/G-specific adenine glycosylase  46.72 
 
 		 359 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.05241 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4690  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  45.91 
 
 		 344 aa  172  6.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.036705  normal  0.270203 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2002  HhH-GPD family protein  41.03 
 
 		 330 aa  171  1e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0546697  normal  0.289046 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  48.36 
 
 		 383 aa  170  2e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0748  A/G-specific adenine glycosylase  43.32 
 
 		 383 aa  170  2e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.247553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2531  HhH-GPD family protein  41.25 
 
 		 308 aa  171  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0428971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1251  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  43.72 
 
 		 372 aa  170  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000556638  normal  0.540816 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3368  A/G-specific adenine glycosylase  44.29 
 
 		 365 aa  170  3e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2917  HhH-GPD family protein  42.57 
 
 		 317 aa  169  4e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3053  A/G-specific adenine glycosylase  42.99 
 
 		 363 aa  169  5e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000966997  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3039  A/G-specific adenine glycosylase  42.99 
 
 		 363 aa  169  5e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000495773  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4400  HhH-GPD family protein  39.13 
 
 		 323 aa  169  6e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2700  A/G-specific adenine glycosylase  42.79 
 
 		 362 aa  169  6e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.469189  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1325  A/G-specific adenine glycosylase  42.99 
 
 		 363 aa  169  6e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00655288  hitchhiker  0.00812067 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3196  A/G-specific adenine glycosylase  42.99 
 
 		 363 aa  169  6e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000131734  normal  0.644967 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2939  HhH-GPD family protein  39.58 
 
 		 306 aa  167  1e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.223861  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0037  HhH-GPD family protein  41.63 
 
 		 309 aa  167  1e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1181  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  43.26 
 
 		 372 aa  167  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000011452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2490  A/G-specific adenine glycosylase  42.99 
 
 		 368 aa  168  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.646812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4978  A/G-specific adenine glycosylase  44.26 
 
 		 349 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183286  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0701  A/G-specific adenine glycosylase  46.26 
 
 		 615 aa  165  8e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0292905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4043  adenine DNA glycosylase  43.06 
 
 		 381 aa  164  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0975151 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1219  A/G-specific adenine glycosylase  41.55 
 
 		 370 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000411331  normal  0.458065 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1123  A/G-specific adenine glycosylase  42.45 
 
 		 368 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000383287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0590  A/G-specific adenine glycosylase  43.6 
 
 		 353 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.123434  decreased coverage  0.000793491 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0423  A/G-specific adenine glycosylase  47.8 
 
 		 382 aa  163  3e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04530  A/G-specific adenine glycosylase  45.97 
 
 		 362 aa  163  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0212  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  44.39 
 
 		 368 aa  163  3e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.880726  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1180  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.86 
 
 		 372 aa  163  3e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000236828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1319  A/G-specific adenine glycosylase  42.31 
 
 		 382 aa  163  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.565336  normal  0.399065 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2195  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.37 
 
 		 350 aa  163  3e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.591242 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4128  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  43.6 
 
 		 375 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1070  A/G-specific adenine glycosylase  43.83 
 
 		 357 aa  162  7e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2201  HhH-GPD family protein  40.53 
 
 		 305 aa  162  8.000000000000001e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02791  adenine DNA glycosylase  42 
 
 		 350 aa  161  9e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0610871  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0734  A/G-specific adenine glycosylase  42 
 
 		 350 aa  161  9e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0753  adenine DNA glycosylase  42 
 
 		 350 aa  161  9e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.852915  normal  0.0133097 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3122  adenine DNA glycosylase  42 
 
 		 360 aa  162  9e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4265  adenine DNA glycosylase  42 
 
 		 350 aa  161  9e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3307  adenine DNA glycosylase  42 
 
 		 360 aa  162  9e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2808  A/G-specific adenine glycosylase  44.55 
 
 		 368 aa  161  9e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2183  A/G-specific adenine glycosylase  44.55 
 
 		 368 aa  162  9e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602702  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2695  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  46.01 
 
 		 361 aa  161  9e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.375064 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2797  A/G-specific adenine glycosylase  44.55 
 
 		 368 aa  162  9e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02754  hypothetical protein  42 
 
 		 350 aa  161  9e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0736099  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0765  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.11 
 
 		 374 aa  161  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3394  adenine DNA glycosylase  41.5 
 
 		 360 aa  161  1e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0322  A/G-specific adenine glycosylase  44.98 
 
 		 352 aa  160  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000137419  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1199  A/G-specific adenine glycosylase  43.97 
 
 		 376 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0003  A/G-specific adenine glycosylase  35.94 
 
 		 353 aa  160  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000019513  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0076  A/G-specific adenine glycosylase  40.09 
 
 		 354 aa  160  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.80443  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3350  adenine DNA glycosylase  42.5 
 
 		 350 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.443349 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0518  A/G-specific adenine glycosylase  44.08 
 
 		 370 aa  159  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.851283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3274  adenine DNA glycosylase  42.5 
 
 		 350 aa  159  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3284  adenine DNA glycosylase  42.5 
 
 		 350 aa  159  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0228526 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3358  adenine DNA glycosylase  42.5 
 
 		 350 aa  159  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.173815 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3453  adenine DNA glycosylase  42.5 
 
 		 350 aa  159  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.849569 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0534  A/G-specific adenine glycosylase  40.98 
 
 		 350 aa  159  4e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000506444  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3104  adenine DNA glycosylase  41.5 
 
 		 350 aa  159  4e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00400976 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3189  HhH-GPD family protein  41.04 
 
 		 318 aa  159  5e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3407  adenine DNA glycosylase  41.63 
 
 		 368 aa  159  5e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0148197  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>