81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3410 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3410  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 		 272 aa  550  1e-155  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.498178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9139  Sugar phosphate isomerase/epimerase-like protein  80.67 
 
 		 270 aa  464  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4464  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  73.11 
 
 		 294 aa  410  1e-114  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2709  hypothetical protein  66.3 
 
 		 305 aa  395  1e-109  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.320407  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5002  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  64.94 
 
 		 312 aa  387  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0821356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0473  xylose isomerase-like  69.08 
 
 		 308 aa  374  1e-103  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.715311 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6143  xylose isomerase domain-containing protein  70.11 
 
 		 288 aa  365  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.536999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0249  xylose isomerase domain-containing protein  63.24 
 
 		 265 aa  316  2e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.273491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0407  xylose isomerase domain-containing protein  60.15 
 
 		 295 aa  303  1.0000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0340  xylose isomerase domain-containing protein  58.85 
 
 		 302 aa  304  1.0000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4928  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  58.11 
 
 		 268 aa  298  5e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0835  xylose isomerase domain-containing protein  55.04 
 
 		 281 aa  293  2e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.279878  normal  0.572466 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8356  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  54.84 
 
 		 305 aa  291  5e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5758  Xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  58.04 
 
 		 263 aa  290  1e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.625631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0077  xylose isomerase domain-containing protein  53.96 
 
 		 281 aa  289  4e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10507  hypothetical protein  53.79 
 
 		 280 aa  286  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0480257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0666  xylose isomerase-like TIM barrel  53.6 
 
 		 281 aa  285  4e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0659  xylose isomerase domain-containing protein  53.6 
 
 		 281 aa  285  4e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.748247 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0679  xylose isomerase domain-containing protein  53.6 
 
 		 281 aa  285  4e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.419765 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00570  sugar phosphate isomerase/epimerase  55.08 
 
 		 294 aa  282  4.0000000000000003e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.170304 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02720  sugar phosphate isomerase/epimerase  57.41 
 
 		 266 aa  282  4.0000000000000003e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0476  xylose isomerase domain-containing protein  55.51 
 
 		 262 aa  281  1e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0658  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  53.76 
 
 		 280 aa  280  2e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6746  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  58.69 
 
 		 272 aa  278  7e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.249045  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1001  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  51.08 
 
 		 295 aa  275  8e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17470  sugar phosphate isomerase/epimerase  52.49 
 
 		 325 aa  271  8.000000000000001e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.105049  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3200  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  55.25 
 
 		 287 aa  269  4e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.278083  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0185  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  49.43 
 
 		 284 aa  253  2.0000000000000002e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3351  xylose isomerase domain-containing protein  49.41 
 
 		 278 aa  251  1e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0853412  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18060  sugar phosphate isomerase/epimerase  48.65 
 
 		 295 aa  239  4e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24530  sugar phosphate isomerase/epimerase  50.19 
 
 		 261 aa  236  3e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.482145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1512  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.12 
 
 		 263 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2704  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.12 
 
 		 263 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000134824 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2906  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.74 
 
 		 291 aa  72.4  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0975  xylose isomerase domain-containing protein  28.11 
 
 		 269 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000320481  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1121  xylose isomerase domain-containing protein  26.42 
 
 		 268 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3029  xylose isomerase-like TIM barrel  26.37 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.599496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0027  xylose isomerase domain-containing protein  25.76 
 
 		 268 aa  66.6  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.0054119  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0797  xylose isomerase domain-containing protein  26.14 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0606735  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0516  hypothetical protein  26.2 
 
 		 263 aa  65.5  0.0000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0218037  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1978  xylose isomerase domain-containing protein  29 
 
 		 274 aa  62  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0530  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.79 
 
 		 273 aa  54.7  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.297775  normal  0.967129 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03175  hypothetical protein  22.8 
 
 		 276 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4684  fructoselysine 3-epimerase  22.18 
 
 		 275 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0340  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.8 
 
 		 276 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3842  fructoselysine 3-epimerase  22.18 
 
 		 276 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3750  fructoselysine 3-epimerase  22.8 
 
 		 276 aa  53.5  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.238004  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3568  fructoselysine 3-epimerase  22.18 
 
 		 276 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03223  predicted isomerase  22.8 
 
 		 276 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0340  fructoselysine 3-epimerase  22.18 
 
 		 276 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.452792 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4048  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.84 
 
 		 286 aa  50.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3944  AP endonuclease  41.77 
 
 		 285 aa  50.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0718494  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1649  AP endonuclease  19.78 
 
 		 262 aa  48.1  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00681404  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1257  xylose isomerase domain-containing protein  24.16 
 
 		 264 aa  48.9  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.666664  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1458  xylose isomerase domain-containing protein  35.21 
 
 		 255 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.931629 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0440  xylose isomerase-like TIM barrel  27.3 
 
 		 323 aa  48.9  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.292372  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2461  xylose isomerase-like TIM barrel  29.46 
 
 		 305 aa  47.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0504  xylose isomerase domain-containing protein  24.45 
 
 		 270 aa  47.8  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000275929  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3955  xylose isomerase domain-containing protein  38.82 
 
 		 276 aa  46.6  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00177251  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0973  hypothetical protein  25.69 
 
 		 257 aa  46.6  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0409  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  37.65 
 
 		 274 aa  45.8  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0941  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.81 
 
 		 293 aa  45.8  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0499  xylose isomerase domain-containing protein  25.1 
 
 		 304 aa  45.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00421742  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1263  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.66 
 
 		 297 aa  45.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.281951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11110  sugar phosphate isomerase/epimerase  28.89 
 
 		 480 aa  45.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.230414 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1498  xylose isomerase domain-containing protein  25.15 
 
 		 290 aa  45.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000000176809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1892  xylose isomerase domain-containing protein  26.76 
 
 		 275 aa  45.4  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.230832 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0529  xylose isomerase-like TIM barrel  33.8 
 
 		 281 aa  44.3  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0189964  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3793  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.9 
 
 		 256 aa  44.3  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3268  xylose isomerase domain-containing protein  24.67 
 
 		 333 aa  44.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.60758 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1536  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.15 
 
 		 292 aa  44.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00467401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3869  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  35.71 
 
 		 274 aa  43.5  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0966717  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6852  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.91 
 
 		 284 aa  43.5  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0571066  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4312  sugar phosphate isomerases/epimerases  29.17 
 
 		 283 aa  43.1  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.517232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5989  xylose isomerase domain-containing protein  32.58 
 
 		 312 aa  43.1  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63499  normal  0.171061 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4027  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.06 
 
 		 275 aa  43.1  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.383869  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3648  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.94 
 
 		 286 aa  43.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0394614 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1980  xylose isomerase domain-containing protein  23.14 
 
 		 274 aa  42.7  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3320  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  32.41 
 
 		 630 aa  42.7  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0779  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.2 
 
 		 276 aa  42.7  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0781  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.89 
 
 		 282 aa  42  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>