49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3227 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3227  tetratricopeptide domain-containing protein  100 
 
 		 412 aa  794    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.654756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1074  hypothetical protein  58.38 
 
 		 416 aa  381  1e-104  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0537877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4853  TPR repeat-containing protein  54.66 
 
 		 421 aa  366  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.712178  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2368  hypothetical protein  55.58 
 
 		 426 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.021674 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3801  tetratricopeptide TPR_4  46.93 
 
 		 425 aa  285  7e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0474  tetratricopeptide TPR_4  43.4 
 
 		 405 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.223886 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3809  hypothetical protein  40.85 
 
 		 405 aa  223  4e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0968  hypothetical protein  40.56 
 
 		 419 aa  218  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.364744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1254  hypothetical protein  33.33 
 
 		 322 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1285  hypothetical protein  33.33 
 
 		 322 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.253608  normal  0.342893 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0466  hypothetical protein  32.29 
 
 		 341 aa  105  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447492  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3203  hypothetical protein  34.62 
 
 		 332 aa  103  5e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1816  hypothetical protein  33.33 
 
 		 326 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3758  hypothetical protein  32.84 
 
 		 337 aa  102  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0855  hypothetical protein  38.46 
 
 		 326 aa  102  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3867  hypothetical protein  31.85 
 
 		 327 aa  101  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0707  hypothetical protein  38.46 
 
 		 326 aa  102  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4599  hypothetical protein  32.08 
 
 		 325 aa  98.6  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.934593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3364  hypothetical protein  31.53 
 
 		 325 aa  85.5  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.175832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0542  TPR repeat-containing protein  30.73 
 
 		 994 aa  76.3  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.397005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0209  Tetratricopeptide domain protein  28.65 
 
 		 552 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000260586 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1977  hypothetical protein  36.73 
 
 		 714 aa  63.5  0.000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.574809 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0848  Tetratricopeptide domain protein  31.06 
 
 		 992 aa  62.8  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0302645  normal  0.423245 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3607  hypothetical protein  27.78 
 
 		 393 aa  62.4  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.496069  normal  0.349432 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0381  TPR repeat-containing protein  29.58 
 
 		 422 aa  62  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2335  copper amine oxidase domain protein  26.4 
 
 		 934 aa  59.7  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4958  TPR repeat-containing protein  25.53 
 
 		 1621 aa  58.9  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4136  Tetratricopeptide domain protein  31.76 
 
 		 1219 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6113  hypothetical protein  35.67 
 
 		 596 aa  56.6  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1546  TPR repeat-containing protein  26.34 
 
 		 1779 aa  55.8  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3125  Tetratricopeptide domain protein  37.5 
 
 		 1141 aa  56.2  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3883  hypothetical protein  25 
 
 		 501 aa  55.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.879407 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8810  Tetratricopeptide domain protein  35.09 
 
 		 724 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.872699  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6111  hypothetical protein  33.12 
 
 		 599 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4791  hypothetical protein  27.88 
 
 		 720 aa  53.9  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1936  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 1911 aa  53.1  0.000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.261102  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3460  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  27.27 
 
 		 644 aa  52  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3221  hypothetical protein  30 
 
 		 737 aa  51.6  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1909  copper amine oxidase-like protein  29.13 
 
 		 490 aa  51.2  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0548415  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3677  TPR repeat-containing protein  28.23 
 
 		 1448 aa  48.5  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2763  TPR repeat-containing protein  26.06 
 
 		 1711 aa  48.9  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4959  TPR repeat-containing protein  30.95 
 
 		 1544 aa  47.4  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0210  hypothetical protein  30.88 
 
 		 476 aa  46.6  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1908  copper amine oxidase-like protein  25.34 
 
 		 962 aa  45.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.510602  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2009  TPR repeat-containing protein  29.3 
 
 		 1502 aa  45.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0574678  decreased coverage  0.000390887 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3302  Tetratricopeptide domain protein  33.33 
 
 		 982 aa  44.7  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4460  TPR repeat-containing protein  27.97 
 
 		 1247 aa  43.9  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0317978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2481  TPR repeat-containing protein  25.3 
 
 		 1321 aa  43.9  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.834883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2765  TPR repeat-containing protein  28.24 
 
 		 1083 aa  43.1  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>