278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1257 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1257  condensin subunit ScpB  100 
 
 		 221 aa  439  9.999999999999999e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2456  condensin subunit ScpB  68.64 
 
 		 178 aa  247  1e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0826453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2319  putative transcriptional regulator  62.5 
 
 		 211 aa  228  7e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.62874  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1285  hypothetical protein  61.9 
 
 		 304 aa  226  1e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0167657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1113  segregation and condensation protein B  62.5 
 
 		 280 aa  225  4e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.411442  normal  0.867542 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2032  condensin subunit ScpB  63.69 
 
 		 311 aa  224  8e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1206  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  62.5 
 
 		 389 aa  223  1e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1628  segregation and condensation protein B  62.05 
 
 		 394 aa  222  3e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189744  hitchhiker  0.00787891 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1688  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  61.36 
 
 		 200 aa  222  4e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.145161  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1733  segregation and condensation protein B  52.8 
 
 		 360 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2824  condensin subunit ScpB  62.05 
 
 		 408 aa  221  8e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2035  condensin subunit ScpB  62.28 
 
 		 302 aa  221  9e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.401895 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1472  segregation and condensation protein B  60.71 
 
 		 345 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1911  segregation and condensation protein B  60.71 
 
 		 456 aa  219  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.436133  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4637  condensin subunit ScpB  60.71 
 
 		 343 aa  219  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0490684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2568  segregation and condensation protein B  60.71 
 
 		 458 aa  219  3e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0143518  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1736  segregation and condensation protein B  60.71 
 
 		 455 aa  219  3e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0336275  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1015  putative transcriptional regulator  60.71 
 
 		 345 aa  219  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1758  segregation and condensation protein B  60.71 
 
 		 456 aa  219  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304009  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1496  putative transcriptional regulator  60.71 
 
 		 345 aa  219  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1418  segregation and condensation protein B  60.71 
 
 		 340 aa  218  6e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.201173 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1378  putative transcriptional regulator  60.71 
 
 		 340 aa  217  8.999999999999998e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.477089  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1066  segregation and condensation protein B  60.12 
 
 		 442 aa  216  2e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1511  segregation and condensation protein B  60.12 
 
 		 442 aa  216  2e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0179  segregation and condensation protein B  60.12 
 
 		 442 aa  216  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00549366  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1759  segregation and condensation protein B  60.12 
 
 		 349 aa  216  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.450892  normal  0.0114777 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0987  segregation and condensation protein B  60.12 
 
 		 442 aa  216  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2002  condensin subunit ScpB  63.47 
 
 		 261 aa  215  4e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0508753  normal  0.414408 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1873  condensin subunit ScpB  62.28 
 
 		 184 aa  215  5e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1164  condensin subunit ScpB  54.23 
 
 		 234 aa  211  7e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1084  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  59.77 
 
 		 234 aa  209  2e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104912  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1418  condensin subunit ScpB  61.68 
 
 		 274 aa  208  4e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0086  putative transcriptional regulator  60.12 
 
 		 216 aa  204  9e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2614  condensin subunit ScpB  48.09 
 
 		 244 aa  202  5e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00467525  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2874  segregation and condensation protein B  58.08 
 
 		 206 aa  201  5e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2313  putative transcriptional regulator  61.64 
 
 		 230 aa  201  6e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.31706  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1231  putative transcriptional regulator  56.63 
 
 		 254 aa  201  9e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.457118  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5025  segregation and condensation protein B  55.67 
 
 		 278 aa  199  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.354604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1098  segregation and condensation protein B  56.02 
 
 		 246 aa  199  3.9999999999999996e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1866  putative transcriptional regulator  49.53 
 
 		 221 aa  196  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.391123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2690  segregation and condensation protein B  55.67 
 
 		 291 aa  195  5.000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2181  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  56.29 
 
 		 281 aa  194  9e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0982  segregation and condensation protein  54.44 
 
 		 209 aa  191  6e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1040  chromosome segregation and condensation protein ScpB  53.22 
 
 		 222 aa  190  1e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.190306  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0875  segregation and condensation protein B  54.44 
 
 		 209 aa  190  1e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00872  segregation and condensation protein B, putative  57.14 
 
 		 399 aa  190  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.631373  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1668  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  49.23 
 
 		 198 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000398849  hitchhiker  0.000392902 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2718  putative transcriptional regulator  49.23 
 
 		 198 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.752294  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2697  putative transcriptional regulator  49.23 
 
 		 198 aa  188  7e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2908  segregation and condensation protein B  50.8 
 
 		 226 aa  187  9e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0704465 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2797  putative transcriptional regulator  49.23 
 
 		 198 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1647  segregation and condensation protein B  50 
 
 		 198 aa  186  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0202301  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2399  putative transcriptional regulator  49.24 
 
 		 198 aa  185  4e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.093672  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2012  segregation and condensation protein B  55.29 
 
 		 236 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0659243  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0722  condensin subunit ScpB  56.29 
 
 		 194 aa  184  1.0000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2206  segregation and condensation protein B  55.43 
 
 		 201 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0850  condensin subunit ScpB  53.04 
 
 		 287 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0321676  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpB  49.43 
 
 		 206 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1555  segregation and condensation protein B  51.38 
 
 		 247 aa  181  7e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00574498  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02284  hypothetical protein  51.2 
 
 		 197 aa  181  1e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.30198  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2247  putative transcriptional regulator  47.78 
 
 		 210 aa  180  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043002 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1611  putative transcriptional regulator  53.66 
 
 		 254 aa  180  2e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.499077  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3786  segregation and condensation protein B  53.37 
 
 		 259 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000435187 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1721  condensin subunit ScpB  50.59 
 
 		 352 aa  179  4e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.862733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1466  condensin subunit ScpB  48.4 
 
 		 198 aa  178  4e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1532  condensin subunit ScpB  48.4 
 
 		 198 aa  178  4e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104314  normal  0.016321 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1524  condensin subunit ScpB  48.4 
 
 		 198 aa  178  4e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434208 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1813  conserved hypothetical protein TIGR00281  51.91 
 
 		 257 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3583  hypothetical protein  51.91 
 
 		 255 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.809895  normal  0.416711 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1690  putative transcriptional regulator  49.43 
 
 		 214 aa  178  5.999999999999999e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.706761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0582  putative transcriptional regulator  52.17 
 
 		 210 aa  177  1e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.571381  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3014  hypothetical protein  47.87 
 
 		 198 aa  176  2e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15670  chromosome segregation and condensation protein B  53.59 
 
 		 263 aa  176  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1839  condensin subunit ScpB  51.85 
 
 		 264 aa  175  5e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0830751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1490  condensin subunit ScpB  48.08 
 
 		 337 aa  174  7e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1415  putative transcriptional regulator  52.25 
 
 		 255 aa  174  7e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.694698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2825  putative transcriptional regulator  44.75 
 
 		 250 aa  174  9e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.994301  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4497  hypothetical protein  52.25 
 
 		 277 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1433  putative transcriptional regulator  47.13 
 
 		 245 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4003  segregation and condensation protein B  51.12 
 
 		 256 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.577747  decreased coverage  0.000000530322 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1595  hypothetical protein  46.32 
 
 		 193 aa  170  1e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1401  hypothetical protein  46.84 
 
 		 193 aa  169  2e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1161  putative transcriptional regulator  52.23 
 
 		 221 aa  167  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2125  putative transcriptional regulator  48.54 
 
 		 198 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1724  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  48.82 
 
 		 228 aa  165  5e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.870411 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22860  putative transcriptional regulator  50 
 
 		 330 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.184233 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1929  segregation and condensation protein B  50 
 
 		 332 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0678384  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1016  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  45.16 
 
 		 194 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2759  segregation and condensation protein B  39.36 
 
 		 299 aa  136  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.331589  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4418  condensin subunit ScpB  44.25 
 
 		 385 aa  132  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1135  putative transcriptional regulator  43.71 
 
 		 181 aa  131  7.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5640  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.79 
 
 		 534 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1884  segregation and condensation protein B  39.04 
 
 		 195 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000125518  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1093  condensin subunit ScpB  43.45 
 
 		 215 aa  125  4.0000000000000003e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2296  segregation and condensation protein B  39.01 
 
 		 192 aa  125  6e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1468  segregation and condensation protein B  46.25 
 
 		 177 aa  125  7e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1791  segregation and condensation protein B  46.25 
 
 		 177 aa  125  7e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1927  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  39.56 
 
 		 192 aa  124  9e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2512  putative transcriptional regulator  45.86 
 
 		 256 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.915644  normal  0.474436 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1752  putative transcriptional regulator  39.77 
 
 		 186 aa  124  2e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.178756  normal  0.0679167 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>