212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1478 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_1478  permease  100 
 
 		 389 aa  768    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.177676  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2072  permease  59.33 
 
 		 392 aa  461  1e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1323  permease  59.33 
 
 		 389 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0556  permease  59.22 
 
 		 390 aa  438  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0378038  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1904  permease  58.88 
 
 		 433 aa  432  1e-120  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.560761  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1485  permease  58.1 
 
 		 393 aa  424  1e-117  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.363242  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2877  permease  58.51 
 
 		 390 aa  419  1e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0753  permease  56.7 
 
 		 389 aa  412  1e-114  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0377989 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3597  permease  55.18 
 
 		 461 aa  410  1e-113  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.755829  normal  0.306889 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20090  permease  59.54 
 
 		 393 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0184  hypothetical protein  54.76 
 
 		 437 aa  401  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0828  permease  44.62 
 
 		 361 aa  320  3e-86  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000427926  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1802  permease  45.53 
 
 		 362 aa  315  8e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1748  permease  45.89 
 
 		 362 aa  311  1e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000179413  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0944  transporter  46.69 
 
 		 347 aa  302  7.000000000000001e-81  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_877  permease  45.11 
 
 		 343 aa  293  3e-78  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1899  permease  50.85 
 
 		 350 aa  278  8e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1107  permease  44.59 
 
 		 350 aa  278  8e-74  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1006  permease, putative  46.24 
 
 		 343 aa  273  3e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0459509  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0456  permease  44.57 
 
 		 367 aa  270  2e-71  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.349904  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0700  permease  40.51 
 
 		 359 aa  260  2e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0862  permease  41.71 
 
 		 356 aa  260  3e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.254841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0893  permease  46.53 
 
 		 343 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0816  membrane protein-like protein  40.68 
 
 		 357 aa  248  9e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.435771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0664  permease  42.26 
 
 		 386 aa  233  6e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.7223  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0016  permease  43.37 
 
 		 359 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1855  permease  47.86 
 
 		 489 aa  135  9e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.146115  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1323  permease  48.57 
 
 		 452 aa  133  6e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0701  permease  53.68 
 
 		 479 aa  126  6e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1936  putative permease  57.83 
 
 		 111 aa  107  4e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0118434  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2338  permease  25.14 
 
 		 358 aa  89.7  8e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.677868  normal  0.0877008 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3823  permease  25.14 
 
 		 358 aa  89.7  8e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0398  hypothetical protein  25.93 
 
 		 344 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.679708  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3427  permease  22.55 
 
 		 356 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000478015  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1217  permease  24.01 
 
 		 332 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0503  hypothetical protein  21.1 
 
 		 358 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2425  hypothetical protein  21.75 
 
 		 294 aa  77.8  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.395757  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05267  hypothetical protein  23.95 
 
 		 378 aa  75.9  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3941  permease  24.47 
 
 		 363 aa  76.3  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.371691 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0820  hypothetical protein  22.88 
 
 		 293 aa  75.1  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3596  hypothetical protein  21.93 
 
 		 373 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2516  permease  25.21 
 
 		 316 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.114382  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3797  putative permease  21.37 
 
 		 333 aa  73.2  0.000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.236031 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2777  permease-like  23.4 
 
 		 363 aa  73.2  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0132  permease, putative  23.98 
 
 		 402 aa  72.8  0.000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112317  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2048  permease  20.46 
 
 		 336 aa  71.6  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3989  putative permease  20.85 
 
 		 333 aa  70.5  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.531766  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02580  hypothetical protein  24.17 
 
 		 345 aa  70.1  0.00000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1498  permease  21.59 
 
 		 307 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.562403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01499  hypothetical protein  24.17 
 
 		 345 aa  70.1  0.00000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08200  permease  23.22 
 
 		 345 aa  69.7  0.00000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000119775  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0147  putative permease  20.45 
 
 		 359 aa  69.7  0.00000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2549  permease  31.29 
 
 		 368 aa  68.9  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1469  permease  25.95 
 
 		 358 aa  68.6  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.604132  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0966  permease  21.57 
 
 		 311 aa  68.6  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000479758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3190  permease  23.55 
 
 		 335 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0083  putative permease  22.06 
 
 		 306 aa  67  0.0000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0580  hypothetical protein  30.77 
 
 		 475 aa  67.4  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1221  permease  21.26 
 
 		 332 aa  67  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1997  permease  24.84 
 
 		 365 aa  66.6  0.0000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3419  permease  23.34 
 
 		 354 aa  66.6  0.0000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1427  putative permease  25.16 
 
 		 322 aa  66.2  0.0000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3647  permease  22.25 
 
 		 364 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.5727 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1730  permease, putative  22.05 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.157468  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0665  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF318 domain protein)  20.06 
 
 		 324 aa  64.7  0.000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3659  permease  31.58 
 
 		 349 aa  63.9  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2452  putative permease  22.13 
 
 		 304 aa  62.8  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0132  permease  33.61 
 
 		 363 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000160751  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1828  permease  21.57 
 
 		 330 aa  62.8  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.22223  normal  0.735803 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2333  permease  20.91 
 
 		 332 aa  62  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.685877  normal  0.0887616 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0492  permease  22.35 
 
 		 331 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3818  permease  20.91 
 
 		 332 aa  62  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3357  putative permease  22.25 
 
 		 336 aa  61.2  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.138974  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1870  permease  30.16 
 
 		 319 aa  61.2  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.788351  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1704  hypothetical protein  26.62 
 
 		 341 aa  60.8  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3497  permease  21.87 
 
 		 331 aa  60.8  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3832  permease  22.19 
 
 		 331 aa  60.8  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3958  permease  22.19 
 
 		 331 aa  60.8  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3776  permease  22.19 
 
 		 331 aa  60.5  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2503  permease  22.82 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.523202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1089  permease  22.52 
 
 		 366 aa  60.1  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1027  transporter  22.52 
 
 		 366 aa  60.1  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1442  permease  24.23 
 
 		 371 aa  59.7  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0523  permease  25.5 
 
 		 373 aa  59.3  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.21531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1810  permease  22.84 
 
 		 328 aa  59.3  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0110  permease  29.51 
 
 		 321 aa  59.3  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0535  hypothetical protein  21.18 
 
 		 331 aa  58.5  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3673  permease  31.15 
 
 		 351 aa  58.9  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1966  hypothetical protein  28.69 
 
 		 378 aa  58.2  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1645  permease  23.91 
 
 		 350 aa  57.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701842  normal  0.852279 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0534  permease  20.99 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0014  permease  32.09 
 
 		 451 aa  57.8  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.700794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1935  permease  21.91 
 
 		 353 aa  57.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1540  permease  26.76 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000982093  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2023  permease  28.76 
 
 		 350 aa  57  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1474  permease  28.85 
 
 		 353 aa  56.6  0.0000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.614025  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0728  permease  27.91 
 
 		 353 aa  56.6  0.0000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0526  permease  31.4 
 
 		 350 aa  56.6  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0464  permease  32.67 
 
 		 350 aa  56.2  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000958774  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1408  permease  33.66 
 
 		 332 aa  55.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.598043  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>