More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2986 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2986  putative aminotransferase  100 
 
 		 465 aa  961    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2633  putative aminotransferase  61.49 
 
 		 455 aa  585  1e-166  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03900  putative aminotransferase  61.42 
 
 		 456 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2643  putative aminotransferase  61.02 
 
 		 460 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0390  putative aminotransferase  61.42 
 
 		 456 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5406  putative aminotransferase  61.01 
 
 		 454 aa  580  1e-164  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00027228 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  59.78 
 
 		 466 aa  578  1e-164  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1787  putative aminotransferase  61.49 
 
 		 452 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0281  putative aminotransferase  60.32 
 
 		 453 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5182  putative aminotransferase  59.38 
 
 		 453 aa  571  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5308  aminotransferase, class III  60.13 
 
 		 455 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48850  putative aminotransferase  59.87 
 
 		 457 aa  573  1.0000000000000001e-162  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0343  putative aminotransferase  60.31 
 
 		 457 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.457259 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5089  putative aminotransferase  60.31 
 
 		 453 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441787  normal  0.847711 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5242  putative aminotransferase  60.31 
 
 		 453 aa  570  1e-161  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4866  putative aminotransferase  59.6 
 
 		 454 aa  570  1e-161  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00453658  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2180  putative aminotransferase  60.81 
 
 		 452 aa  568  1e-160  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2379  aminotransferase class-III  58.64 
 
 		 471 aa  565  1e-160  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00692435  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3557  putative aminotransferase  60.59 
 
 		 452 aa  565  1e-160  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.936496  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4663  putative aminotransferase  59.37 
 
 		 451 aa  558  1e-158  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1902  putative aminotransferase  57.93 
 
 		 459 aa  556  1e-157  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.483281  normal  0.25146 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1738  putative aminotransferase  58.52 
 
 		 470 aa  556  1e-157  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000987202 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2727  putative aminotransferase  55.72 
 
 		 478 aa  552  1e-156  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692247  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1101  putative aminotransferase  56.42 
 
 		 455 aa  522  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.27722 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0952  putative aminotransferase  55.36 
 
 		 455 aa  522  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1254  putative aminotransferase  58.33 
 
 		 464 aa  520  1e-146  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.179444  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3573  putative aminotransferase  54.39 
 
 		 478 aa  520  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.67707 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0351  putative aminotransferase  55.82 
 
 		 478 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.000167331  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4665  putative aminotransferase  55.01 
 
 		 482 aa  514  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0941  putative aminotransferase  55.23 
 
 		 481 aa  512  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140903  normal  0.500981 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2863  putative aminotransferase  57.57 
 
 		 465 aa  511  1e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.126034  normal  0.221703 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1407  putative aminotransferase  54.69 
 
 		 456 aa  510  1e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1296  putative aminotransferase  51.32 
 
 		 460 aa  506  9.999999999999999e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566567 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2995  putative aminotransferase  54.67 
 
 		 480 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3014  putative aminotransferase  54.89 
 
 		 480 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.672031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2904  putative aminotransferase  54.44 
 
 		 477 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6344  putative aminotransferase  54.34 
 
 		 480 aa  501  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0824  putative aminotransferase  55.99 
 
 		 465 aa  499  1e-140  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2381  putative aminotransferase  54.67 
 
 		 480 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3042  putative aminotransferase  54.44 
 
 		 477 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2653  putative aminotransferase  52.76 
 
 		 472 aa  496  1e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2989  putative aminotransferase  54.67 
 
 		 475 aa  498  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2787  putative aminotransferase  52.54 
 
 		 475 aa  494  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.123672  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2710  putative aminotransferase  52.54 
 
 		 475 aa  495  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1108  putative aminotransferase  54.95 
 
 		 465 aa  497  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.290549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2180  putative aminotransferase  54.05 
 
 		 464 aa  495  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.930783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0727  putative aminotransferase  52.76 
 
 		 472 aa  497  1e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0635  putative aminotransferase  52.76 
 
 		 472 aa  497  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2021  putative aminotransferase  52.54 
 
 		 472 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2078  putative aminotransferase  53.6 
 
 		 461 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.066309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2200  putative aminotransferase  54.05 
 
 		 461 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.534345  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0545  putative aminotransferase  53.56 
 
 		 458 aa  491  1e-137  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1947  putative aminotransferase  52.34 
 
 		 477 aa  490  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.769855  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1829  putative aminotransferase  52.34 
 
 		 476 aa  490  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63972  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2162  putative aminotransferase  53.15 
 
 		 464 aa  488  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5915  putative aminotransferase  53.15 
 
 		 464 aa  488  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5472  putative aminotransferase  52.82 
 
 		 461 aa  483  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0276081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3946  putative aminotransferase  51.76 
 
 		 466 aa  474  1e-132  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118972  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02700  putative aminotransferase  48.33 
 
 		 460 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0755258 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0307  putative aminotransferase  48.33 
 
 		 460 aa  443  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6646  putative aminotransferase  50 
 
 		 463 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.349002  normal  0.0868524 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4932  putative aminotransferase  48.68 
 
 		 456 aa  426  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2871  putative aminotransferase  46.62 
 
 		 460 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.59328  normal  0.681396 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2588  putative aminotransferase  46.15 
 
 		 460 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.155274  normal  0.308476 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3128  putative aminotransferase  46.15 
 
 		 460 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3250  putative aminotransferase  46.39 
 
 		 460 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0885225 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0421  aminotransferase  45.33 
 
 		 456 aa  383  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6604  aminotransferase  44.49 
 
 		 456 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.112591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1491  aminotransferase  42.23 
 
 		 463 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1928  aminotransferase  42.98 
 
 		 459 aa  371  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5230  aminotransferase class-III  44.49 
 
 		 456 aa  368  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2041  aminotransferase  42.98 
 
 		 455 aa  362  6e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0199  aminotransferase  40.53 
 
 		 456 aa  360  4e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0221401  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3993  aminotransferase  41.28 
 
 		 460 aa  356  5e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0061  hypothetical protein  42.73 
 
 		 465 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.543932  hitchhiker  0.00333997 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2908  aminotransferase class-III  42.33 
 
 		 485 aa  353  5e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.597811 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3858  hypothetical protein  41.14 
 
 		 469 aa  352  7e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3134  aminotransferase class-III  42.33 
 
 		 463 aa  352  1e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.495081 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3261  aminotransferase  40.64 
 
 		 460 aa  351  1e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.899637  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0191  aminotransferase  40.44 
 
 		 456 aa  351  2e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3196  aminotransferase class-III  42.32 
 
 		 458 aa  350  2e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3280  aminotransferase  40.85 
 
 		 468 aa  349  5e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.880154 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4421  hypothetical protein  42.95 
 
 		 463 aa  349  6e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130906 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0184  aminotransferase  40.22 
 
 		 456 aa  349  7e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0145634  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5513  aminotransferase class-III  40.69 
 
 		 460 aa  348  9e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574518  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3738  aminotransferase  42.29 
 
 		 461 aa  347  2e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4959  hypothetical protein  42.32 
 
 		 467 aa  346  4e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6450  hypothetical protein  40.87 
 
 		 466 aa  346  6e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6685  hypothetical protein  40.87 
 
 		 466 aa  346  6e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0052  hypothetical protein  41.39 
 
 		 461 aa  345  7e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2923  aminotransferase class-III  43.15 
 
 		 451 aa  345  1e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0806486  normal  0.849242 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5629  hypothetical protein  41.24 
 
 		 467 aa  344  2e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6282  hypothetical protein  40.65 
 
 		 466 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3814  aminotransferase class-III  41.52 
 
 		 460 aa  342  5.999999999999999e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7510  hypothetical protein  41.09 
 
 		 467 aa  342  8e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6051  hypothetical protein  40.22 
 
 		 466 aa  341  1e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2054  hypothetical protein  38.7 
 
 		 467 aa  341  2e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2934  hypothetical protein  40.3 
 
 		 466 aa  341  2e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.913582  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2724  hypothetical protein  41.88 
 
 		 468 aa  341  2e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6348  hypothetical protein  40 
 
 		 466 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>