More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2538 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2345  heavy metal translocating P-type ATPase  67.78 
 
 		 737 aa  884    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.289685  normal  0.231434 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1842  heavy metal translocating P-type ATPase  61.42 
 
 		 732 aa  863    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21425  normal  0.57874 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0690  copper-translocating P-type ATPase, RdxI  67.92 
 
 		 737 aa  892    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.247145  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0540  heavy metal translocating P-type ATPase  68.47 
 
 		 737 aa  895    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3851  heavy metal translocating P-type ATPase  63.91 
 
 		 731 aa  860    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0667  nitrogen fixation protein fixI  65.06 
 
 		 729 aa  843    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2538  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 		 727 aa  1434    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4956  heavy metal translocating P-type ATPase  47.27 
 
 		 761 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00130227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1526  heavy metal translocating P-type ATPase  46.73 
 
 		 738 aa  578  1.0000000000000001e-163  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5022  heavy metal translocating P-type ATPase  47.88 
 
 		 762 aa  570  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29502  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0357  nitrogen fixation protein FixI, putative  46.01 
 
 		 752 aa  567  1e-160  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0463  copper-translocating P-type ATPase  46.31 
 
 		 752 aa  567  1e-160  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5920  copper-translocating P-type ATPase  46.38 
 
 		 755 aa  556  1e-157  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.509848 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2393  nitrogen fixation protein FixI  44.38 
 
 		 787 aa  532  1e-150  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1796  heavy metal translocating P-type ATPase  46.55 
 
 		 724 aa  535  1e-150  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5929  copper-translocating P-type ATPase  44.67 
 
 		 757 aa  532  1e-150  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.711138 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0011  heavy metal translocating P-type ATPase  45.86 
 
 		 731 aa  532  1e-150  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.399414  normal  0.898775 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1155  heavy metal translocating P-type ATPase  46.28 
 
 		 728 aa  533  1e-150  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.302273  normal  0.0837932 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0465  heavy metal translocating P-type ATPase  48.36 
 
 		 743 aa  532  1e-150  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0752433  normal  0.273207 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3324  copper-translocating P-type ATPase  48.54 
 
 		 809 aa  530  1e-149  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0009  copper-translocating P-type ATPase  44.29 
 
 		 735 aa  530  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0736  copper-translocating P-type ATPase  45.35 
 
 		 731 aa  528  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1670  heavy metal translocating P-type ATPase  47.84 
 
 		 648 aa  528  1e-148  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2797  nitrogen fixation protein fixI  46.8 
 
 		 733 aa  523  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0350165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0014  copper-translocating P-type ATPase  45.04 
 
 		 732 aa  522  1e-147  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.190643  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2255  heavy metal translocating P-type ATPase  45.98 
 
 		 746 aa  519  1.0000000000000001e-145  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2572  heavy metal translocating P-type ATPase  46.55 
 
 		 707 aa  509  1e-143  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7463  copper-translocating P-type ATPase  46.24 
 
 		 758 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2443  heavy metal translocating P-type ATPase  46.67 
 
 		 721 aa  503  1e-141  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415649  normal  0.66709 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6713  copper-translocating P-type ATPase  45.86 
 
 		 758 aa  486  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3665  copper-translocating P-type ATPase  46.82 
 
 		 749 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.385709 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0164  heavy metal translocating P-type ATPase  38.71 
 
 		 846 aa  417  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.914587 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1960  heavy metal translocating P-type ATPase  35.47 
 
 		 828 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2994  heavy metal translocating P-type ATPase  37.31 
 
 		 838 aa  400  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1790  heavy metal translocating P-type ATPase  36.74 
 
 		 815 aa  399  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2044  heavy metal translocating P-type ATPase  38.7 
 
 		 834 aa  393  1e-108  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000418772  normal  0.430312 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1048  cation transporter E1-E2 family ATPase  34.92 
 
 		 790 aa  389  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.582758  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1875  heavy metal translocating P-type ATPase  38.04 
 
 		 826 aa  390  1e-107  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796141 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0711  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  36.23 
 
 		 812 aa  385  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.139476  normal  0.239991 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0934  heavy metal translocating P-type ATPase  33.62 
 
 		 802 aa  380  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.701132  normal  0.512838 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2479  putative cation transport P-type ATPase  38.5 
 
 		 765 aa  381  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354353  normal  0.180774 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003472  copper-translocating P-type ATPase  33.66 
 
 		 787 aa  381  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.154282  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0635  heavy metal translocating P-type ATPase  36.48 
 
 		 806 aa  381  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02298  cation transport ATPase  33.1 
 
 		 787 aa  380  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1964  heavy metal translocating P-type ATPase  32.6 
 
 		 803 aa  382  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0125075 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2112  heavy metal translocating P-type ATPase  32.16 
 
 		 803 aa  377  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.237749  normal  0.362751 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2360  heavy metal translocating P-type ATPase  36.47 
 
 		 818 aa  377  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1275  heavy metal translocating P-type ATPase  37.33 
 
 		 839 aa  378  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1990  heavy metal translocating P-type ATPase  31.86 
 
 		 807 aa  378  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2219  heavy metal translocating P-type ATPase  32.82 
 
 		 794 aa  378  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2011  heavy metal translocating P-type ATPase  32.44 
 
 		 803 aa  379  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000954051 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  32.18 
 
 		 797 aa  373  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2359  cation transporter E1-E2 family ATPase  32.96 
 
 		 799 aa  374  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2781  heavy metal translocating P-type ATPase  37.35 
 
 		 805 aa  376  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000811697 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  31.41 
 
 		 743 aa  375  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4261  heavy metal translocating P-type ATPase  37.59 
 
 		 882 aa  372  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  32.71 
 
 		 752 aa  372  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1607  heavy metal translocating P-type ATPase  37.59 
 
 		 824 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.183906  normal  0.0233029 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1568  putative cation-transporting ATPase  32.31 
 
 		 791 aa  369  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.758768  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  32.61 
 
 		 750 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1796  cation transporter E1-E2 family ATPase  33.57 
 
 		 795 aa  371  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2015  heavy metal translocating P-type ATPase  32.77 
 
 		 797 aa  370  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.467794  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0805  copper-translocating P-type ATPase  34.97 
 
 		 831 aa  368  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.366424  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  32.32 
 
 		 798 aa  369  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4090  heavy metal translocating P-type ATPase  35.21 
 
 		 813 aa  367  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.670864 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1846  heavy metal translocating P-type ATPase  32.11 
 
 		 813 aa  368  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.418126  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3826  heavy metal translocating P-type ATPase  37.3 
 
 		 824 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  30.29 
 
 		 797 aa  365  1e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1570  heavy metal translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 747 aa  365  1e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.706467  normal  0.910265 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1835  heavy metal translocating P-type ATPase  35.38 
 
 		 804 aa  365  2e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3421  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  37.59 
 
 		 824 aa  365  2e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0860043 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  32.53 
 
 		 753 aa  365  2e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3579  heavy metal translocating P-type ATPase  37.71 
 
 		 814 aa  363  4e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3543  heavy metal translocating P-type ATPase  35.55 
 
 		 740 aa  364  4e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1954  heavy metal translocating P-type ATPase  32.17 
 
 		 799 aa  363  6e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1730  heavy metal translocating P-type ATPase  34.32 
 
 		 839 aa  363  9e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3783  copper-translocating P-type ATPase  36.17 
 
 		 811 aa  362  1e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0413939  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  31.23 
 
 		 815 aa  362  1e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000116614  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1397  hypothetical protein  34.05 
 
 		 735 aa  362  1e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3376  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  37.12 
 
 		 819 aa  362  1e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4492  hypothetical protein  32.3 
 
 		 799 aa  362  1e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2206  heavy metal translocating P-type ATPase  32.3 
 
 		 799 aa  362  1e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.107808  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2219  heavy metal translocating P-type ATPase  32.16 
 
 		 799 aa  361  2e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000412933  normal  0.369074 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0576  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  29.83 
 
 		 817 aa  361  2e-98  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.176053  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2140  copper-translocating P-type ATPase  32.73 
 
 		 803 aa  362  2e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0654  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  35.05 
 
 		 732 aa  361  3e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3639  heavy metal translocating P-type ATPase  32.6 
 
 		 786 aa  360  3e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2266  heavy metal translocating P-type ATPase  35.39 
 
 		 790 aa  361  3e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0477  copper-exporting ATPase  30.85 
 
 		 742 aa  361  3e-98  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.123452  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2131  cation transporter E1-E2 family ATPase  30.62 
 
 		 794 aa  360  6e-98  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44440  putative cation-transporting P-type ATPase  35.94 
 
 		 811 aa  360  7e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.838322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02060  copper-translocating P-type ATPase  31.48 
 
 		 796 aa  360  7e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.600497  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1640  P1 ATPase/HMA domain-containing protein  35.56 
 
 		 817 aa  359  8e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650256 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19950  Copper-translocating P-type ATPase  37.02 
 
 		 800 aa  359  9e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.677512  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1690  copper-translocating P-type ATPase  30.58 
 
 		 740 aa  358  1.9999999999999998e-97  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1996  copper-translocating P-type ATPase  37.3 
 
 		 823 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369514  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0661  copper-translocating P-type ATPase  35.31 
 
 		 797 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1994  heavy metal translocating P-type ATPase  31.19 
 
 		 857 aa  358  1.9999999999999998e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000675494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1187  putative metal transporting P-type ATPase  35.54 
 
 		 792 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1698  cation transport ATPases  32.46 
 
 		 799 aa  358  1.9999999999999998e-97  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.118388  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>