139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1739 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1739  hypothetical protein  100 
 
 		 202 aa  419  1e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0852288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1869  uncharacterized peroxidase-related enzyme  60.29 
 
 		 201 aa  244  9e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0138584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3962  peroxidase-like  46.24 
 
 		 191 aa  165  4e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.466457  normal  0.338877 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1446  hypothetical protein  34.07 
 
 		 195 aa  84.7  8e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.885296  normal  0.0846239 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1714  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.46 
 
 		 214 aa  80.9  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2465  hypothetical protein  30.57 
 
 		 190 aa  75.1  0.0000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0916178 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1433  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.12 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2646  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.65 
 
 		 176 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104106  normal  0.490574 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1888  hypothetical protein  30.34 
 
 		 197 aa  72.4  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0113894  normal  0.523313 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2759  hypothetical protein  27.32 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1573  hypothetical protein  27.53 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0640101 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2001  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.35 
 
 		 198 aa  69.7  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.153933  normal  0.952873 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2396  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.19 
 
 		 199 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.692596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5313  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.38 
 
 		 197 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0249  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.48 
 
 		 192 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.331558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2089  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.25 
 
 		 196 aa  68.6  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.673257 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2539  uncharacterized peroxidase  28.81 
 
 		 197 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4745  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.09 
 
 		 192 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.969731 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3941  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.68 
 
 		 197 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0161606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5106  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.81 
 
 		 196 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.153962 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5460  hypothetical protein  28.48 
 
 		 192 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3579  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.68 
 
 		 197 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.95961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5402  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.48 
 
 		 192 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092423 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2827  peroxidase-like  29.53 
 
 		 191 aa  67  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00537954  normal  0.0498212 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2115  hypothetical protein  29.41 
 
 		 192 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433121  normal  0.170797 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1446  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.21 
 
 		 235 aa  67  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1766  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.53 
 
 		 196 aa  67  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.44027  normal  0.472183 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1447  hypothetical protein  27.68 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218618  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4461  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.13 
 
 		 377 aa  66.2  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0531  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.97 
 
 		 386 aa  66.2  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.482172  hitchhiker  0.0000452351 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3355  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.48 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0563256 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3158  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.65 
 
 		 369 aa  66.6  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5290  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.48 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.523649 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0028  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.86 
 
 		 372 aa  65.9  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4868  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.88 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.405716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0091  alkylhydroperoxidase-related  27.12 
 
 		 191 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336937  normal  0.314057 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3260  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.11 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.737438  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0820  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.42 
 
 		 196 aa  64.7  0.0000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.519725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4522  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.88 
 
 		 217 aa  64.7  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.61443  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2532  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.11 
 
 		 196 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4179  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.35 
 
 		 377 aa  64.3  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3885  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.53 
 
 		 369 aa  63.9  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0113459  normal  0.656811 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3669  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.38 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237397 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2199  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.3 
 
 		 195 aa  64.3  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3525  hypothetical protein  30.59 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2816  alkylhydroperoxidase AhpD domain protein  25.84 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0335697  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4285  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.06 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3349  alkylhydroperoxidase  28.65 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.347693  normal  0.0410777 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0026  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.5 
 
 		 371 aa  62.8  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3352  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.16 
 
 		 176 aa  62.4  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4506  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.53 
 
 		 398 aa  62  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256167 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1956  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.24 
 
 		 193 aa  62  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1757  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.24 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4592  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.61 
 
 		 192 aa  61.2  0.000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.991129  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2199  hypothetical protein  26.09 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0950  alkylhydroperoxidase AhpD  28.82 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0758  hypothetical protein  27.47 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00140607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3071  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.22 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000318179  hitchhiker  0.00336398 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0121  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.46 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.464175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3281  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.24 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.366271  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2093  hypothetical protein  28.82 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.868254 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3877  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.07 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.42439  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3407  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.81 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3064  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.61 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.319513 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3133  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.68 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.293905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3419  hypothetical protein  26.99 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4675  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.82 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0195  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.87 
 
 		 178 aa  57.8  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4098  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.99 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0948482  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0194  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.93 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17780  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain  28.96 
 
 		 391 aa  57.4  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.162216  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7169  hypothetical protein  28.08 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.360229  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2544  alkylhydroperoxidase AhpD core  23.6 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.165226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2723  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.3 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.114348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3197  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.27 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1186  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.14 
 
 		 192 aa  57  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5135  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.67 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2532  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.57 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.872008  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2316  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.78 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.463838 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1945  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.25 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.449613 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1859  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.33 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0505741  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3003  hypothetical protein  29.33 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0419  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.43 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2668  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.39 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3152  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.22 
 
 		 372 aa  53.1  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.93611 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02815  probable fusion protein  26.86 
 
 		 196 aa  52.8  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.159587  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2999  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.41 
 
 		 196 aa  52.8  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3431  hypothetical protein  28.48 
 
 		 183 aa  52  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1603  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.99 
 
 		 179 aa  52  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4271  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.16 
 
 		 192 aa  51.6  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0429275  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2768  VCBS  26.92 
 
 		 183 aa  51.6  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.9777  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3517  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.14 
 
 		 143 aa  51.2  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1633  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.78 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.45 
 
 		 143 aa  50.1  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.315709  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1899  hypothetical protein  25.14 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.31729 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4420  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.27 
 
 		 181 aa  49.7  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286086  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6526  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.37 
 
 		 186 aa  49.3  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00474121  normal  0.101119 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1021  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.53 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.291858 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1084  alkylhydroperoxidase  31.58 
 
 		 143 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.359651 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  25.15 
 
 		 178 aa  48.1  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>