More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0768 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0768  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  100 
 
 		 295 aa  584  1e-166  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.441934 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0613  band 7 protein  76.79 
 
 		 295 aa  448  1e-125  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.953423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3992  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  78.62 
 
 		 296 aa  439  9.999999999999999e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2809  band 7 protein  77.04 
 
 		 293 aa  424  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.361864  normal  0.174393 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1401  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  75.19 
 
 		 293 aa  418  1e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0069  band 7 protein  75.56 
 
 		 293 aa  419  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.212621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0057  band 7 protein  71.17 
 
 		 295 aa  391  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.373876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0416  band 7 protein  36.49 
 
 		 304 aa  186  5e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3720  hypothetical protein  37.59 
 
 		 344 aa  185  6e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6548  band 7 protein  39.56 
 
 		 326 aa  185  6e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2704  band 7 protein  38.06 
 
 		 332 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1446  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  37.69 
 
 		 305 aa  182  6e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0162555  normal  0.124024 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3305  band 7 protein  37.68 
 
 		 345 aa  182  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.366608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3075  band 7 protein  36.49 
 
 		 319 aa  180  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0686773 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3607  band 7 protein  37.68 
 
 		 346 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01652  inner membrane protein  39.1 
 
 		 321 aa  180  2.9999999999999997e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0075  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  37.83 
 
 		 328 aa  179  5.999999999999999e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00440  predicted protease, membrane anchored  36.36 
 
 		 305 aa  177  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3121  band 7 protein  36.36 
 
 		 305 aa  177  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0568  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  36.36 
 
 		 305 aa  177  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3127  band 7 protein  36.36 
 
 		 305 aa  177  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000985996 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0538  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  36.36 
 
 		 305 aa  177  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4267  band 7 protein  37.31 
 
 		 329 aa  177  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.692153  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0593  SPFH domain/band 7 family protein  36.36 
 
 		 305 aa  177  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.554445 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0070  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  37.83 
 
 		 328 aa  177  2e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.255866  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00445  hypothetical protein  36.36 
 
 		 305 aa  177  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0424  SPFH domain/band 7 family protein  36.36 
 
 		 305 aa  176  3e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4843  band 7 protein  35.56 
 
 		 336 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2364  band 7 protein  35.9 
 
 		 286 aa  176  3e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2221  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  38.35 
 
 		 312 aa  176  3e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674457 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0528  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  36.01 
 
 		 305 aa  175  7e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2735  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  40.47 
 
 		 319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0965  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  36.14 
 
 		 304 aa  174  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.543775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0609  band 7 protein  36.49 
 
 		 305 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4890  band 7 protein  35.77 
 
 		 284 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.152851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0550  band 7 protein  36.49 
 
 		 305 aa  172  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.531066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0548  band 7 protein  36.49 
 
 		 305 aa  172  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0565  band 7 protein  36.49 
 
 		 305 aa  172  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0555  band 7 protein  36.49 
 
 		 305 aa  172  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.857194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5109  band 7 protein  37.82 
 
 		 326 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.000505876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1560  band 7 protein  36.01 
 
 		 322 aa  171  9e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.140523  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4834  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  36.15 
 
 		 284 aa  171  9e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.220458  normal  0.54169 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4712  band 7 protein  36.15 
 
 		 284 aa  172  9e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.21194 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4626  band 7 protein  35.38 
 
 		 284 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.137042 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0297  band 7 protein  37.41 
 
 		 284 aa  171  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0321  band 7 protein  35.9 
 
 		 284 aa  171  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3112  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  37.09 
 
 		 309 aa  170  3e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0260  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  34.88 
 
 		 286 aa  170  3e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0324  band 7 protein  35.53 
 
 		 284 aa  169  4e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14640  band 7 protein  33.33 
 
 		 326 aa  169  6e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000590764  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4303  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  34.02 
 
 		 311 aa  168  8e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0944  band 7 protein  34.81 
 
 		 331 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.188485  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1880  band 7 protein  35.45 
 
 		 334 aa  167  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.126513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3437  band 7 protein  36.3 
 
 		 283 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.462208  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4541  band 7 protein  34.07 
 
 		 329 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0157  inner membrane protein  35.59 
 
 		 318 aa  163  3e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.131876  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0862  band 7 protein  33.7 
 
 		 336 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.464796 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1268  hypothetical protein  36.4 
 
 		 304 aa  162  4.0000000000000004e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.169836 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3024  SPFH/band 7 family protein  36.4 
 
 		 304 aa  162  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1100  band 7 protein  35.44 
 
 		 304 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3162  band 7 protein  36.4 
 
 		 304 aa  162  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0138  band 7 protein  35.59 
 
 		 318 aa  162  5.0000000000000005e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1153  band 7 protein  35.69 
 
 		 301 aa  162  5.0000000000000005e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.294255  hitchhiker  0.000000366449 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2127  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  34.33 
 
 		 286 aa  162  6e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.458205  normal  0.678014 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2451  band 7 protein  34.33 
 
 		 286 aa  162  6e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3110  band 7 protein  33.33 
 
 		 282 aa  162  6e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00709216  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3216  band 7 protein  35.79 
 
 		 304 aa  162  7e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4419  band 7 protein  35.96 
 
 		 319 aa  162  8.000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2146  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  33.98 
 
 		 322 aa  160  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1928  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  33.98 
 
 		 321 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2075  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  33.98 
 
 		 321 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2064  SPFH domain/Band 7 family protein  33.98 
 
 		 322 aa  160  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101789  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3243  SPFH domain/Band 7 family protein  33.66 
 
 		 322 aa  160  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000635475  normal  0.334624 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1890  stomatin-like protein  33.98 
 
 		 322 aa  160  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1880  stomatin-like protein  33.98 
 
 		 322 aa  160  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2174  SPFH domain/Band 7 family protein  33.98 
 
 		 322 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.268114  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0038  hypothetical protein  34.44 
 
 		 300 aa  160  3e-38  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2106  SPFH domain/Band 7 family protein  33.98 
 
 		 321 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0086  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  34.73 
 
 		 281 aa  159  4e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3018  band 7 protein  36.21 
 
 		 369 aa  159  5e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.506434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0929  Band 7 protein  32.75 
 
 		 332 aa  159  6e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.384267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1429  band 7 protein  34.04 
 
 		 394 aa  159  8e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3244  band 7 protein  35.86 
 
 		 369 aa  158  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1359  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  32.39 
 
 		 334 aa  158  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0198882 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3533  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  34.63 
 
 		 316 aa  157  1e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1924  band 7 protein  33.98 
 
 		 322 aa  158  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159861  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0497  hypothetical protein  35.23 
 
 		 306 aa  157  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.988378  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21690  SPFH domain, Band 7 family protein  34.55 
 
 		 429 aa  157  3e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.389538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2227  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  34.28 
 
 		 359 aa  155  7e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491741  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1091  band 7 protein  31.76 
 
 		 282 aa  155  7e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0608  band 7 protein  38.1 
 
 		 286 aa  154  1e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004150  stomatin family protein  32.3 
 
 		 305 aa  155  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2313  band 7 protein  33.92 
 
 		 398 aa  155  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1034  band 7 protein  35.82 
 
 		 307 aa  154  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.679836  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1334  band 7/Mec-2 family protein  30.27 
 
 		 326 aa  154  2e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3024  band 7 protein  35.82 
 
 		 304 aa  154  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3004  band 7 protein  36.06 
 
 		 303 aa  154  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1179  band 7 protein  35.74 
 
 		 403 aa  154  2e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.473377  decreased coverage  0.000901683 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01317  hypothetical protein  34.38 
 
 		 304 aa  154  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0280  integral membrane protein  35.07 
 
 		 307 aa  154  2e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>