More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1514 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 269 aa  549  1e-155  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0763173  hitchhiker  0.00365487 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.28 
 
 		 254 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.320713  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0579  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.5 
 
 		 258 aa  198  9e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0905  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.62 
 
 		 252 aa  195  7e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00434929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2497  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.1 
 
 		 250 aa  189  5.999999999999999e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2152  ATPase FliI/YscN  36.55 
 
 		 254 aa  184  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1973  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.73 
 
 		 245 aa  181  1e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0324346  normal  0.993482 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0132  short chain dehydrogenase  38.02 
 
 		 291 aa  178  1e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2409  short chain dehydrogenase  38.06 
 
 		 245 aa  177  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00187204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.37 
 
 		 261 aa  177  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0577  short chain dehydrogenase  40.69 
 
 		 247 aa  177  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000371974  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0123  short chain dehydrogenase  37.41 
 
 		 295 aa  173  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.974335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1649  short chain dehydrogenase  39.22 
 
 		 245 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000294684  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2905  short chain dehydrogenase  36.84 
 
 		 245 aa  172  5e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00116832  normal  0.0773773 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1692  short chain dehydrogenase  37.25 
 
 		 245 aa  170  3e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00276459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2183  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.34 
 
 		 247 aa  169  3e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000966218  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1160  short chain dehydrogenase  37.66 
 
 		 246 aa  169  4e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0211991  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01893  short chain dehydrogenase  37.55 
 
 		 248 aa  166  5e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000187394  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02865  short chain dehydrogenase  38.02 
 
 		 248 aa  164  9e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2862  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.79 
 
 		 247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.142486  hitchhiker  0.0000000171216 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2119  short chain dehydrogenase  38.03 
 
 		 258 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.860412 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2792  short chain dehydrogenase  36.03 
 
 		 245 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000179947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2715  short chain dehydrogenase  36.03 
 
 		 245 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000973965  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2694  short chain dehydrogenase  36.03 
 
 		 245 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000497802  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003017  oxidoreductase short-chain dehydrogenase/reductase family  37.6 
 
 		 248 aa  162  4.0000000000000004e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00557089  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1672  short chain dehydrogenase  35.63 
 
 		 245 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245982  hitchhiker  0.00123498 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2706  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.43 
 
 		 263 aa  160  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000459649  unclonable  0.0000000000323747 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3108  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  40.43 
 
 		 263 aa  160  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0812933  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2473  short chain dehydrogenase  36.03 
 
 		 245 aa  160  2e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.733857  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1191  short chain dehydrogenase  35.19 
 
 		 245 aa  157  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2342  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.09 
 
 		 248 aa  156  3e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.890074  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2572  short chain dehydrogenase  36.21 
 
 		 245 aa  156  3e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2396  short chain dehydrogenase  37.25 
 
 		 245 aa  152  5e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000375215  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1468  short chain dehydrogenase  38.79 
 
 		 245 aa  149  6e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0118421  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2935  short chain dehydrogenase  38.79 
 
 		 245 aa  149  7e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1534  short chain dehydrogenase  38.79 
 
 		 245 aa  148  7e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000580806  hitchhiker  0.00546516 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1528  short chain dehydrogenase  38.79 
 
 		 245 aa  149  7e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.272639  hitchhiker  0.000286481 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4083  short chain dehydrogenase  39.92 
 
 		 246 aa  145  6e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.391178 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1860  short chain dehydrogenase  36.51 
 
 		 252 aa  145  6e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000976812 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1429  short chain dehydrogenase  35.68 
 
 		 253 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.281885  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1611  short chain dehydrogenase  35.68 
 
 		 253 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000230658 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1907  short chain dehydrogenase  35.68 
 
 		 253 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000106494 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1470  short chain dehydrogenase  36.1 
 
 		 252 aa  144  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.929322  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1844  short chain dehydrogenase  35.68 
 
 		 253 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000457135 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2121  short chain dehydrogenase  34.01 
 
 		 245 aa  143  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000029074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1699  oxidoreductase  37.39 
 
 		 247 aa  143  3e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.782985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1849  short chain dehydrogenase  35.68 
 
 		 253 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714478  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2357  short chain dehydrogenase  36.1 
 
 		 252 aa  143  4e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.596185  hitchhiker  0.00000030745 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1380  short chain dehydrogenase  36.1 
 
 		 252 aa  143  4e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1903  short chain dehydrogenase  36.1 
 
 		 252 aa  143  4e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000124069 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01247  short chain dehydrogenase  35.68 
 
 		 252 aa  142  5e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.68 
 
 		 252 aa  142  5e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0592861  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1495  short chain dehydrogenase  35.68 
 
 		 252 aa  142  5e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01257  hypothetical protein  35.68 
 
 		 252 aa  142  5e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1843  short chain dehydrogenase  38.36 
 
 		 259 aa  142  5e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0503797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0275  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.02 
 
 		 243 aa  142  5e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000379715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2199  short chain dehydrogenase  36.1 
 
 		 253 aa  141  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000321431 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1354  short chain dehydrogenase  39.59 
 
 		 246 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.801717  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1763  short chain dehydrogenase  39.51 
 
 		 246 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.755311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3951  short chain dehydrogenase  39.51 
 
 		 246 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.010229  hitchhiker  0.00832612 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1956  short chain dehydrogenase  37.45 
 
 		 246 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1370  short chain dehydrogenase  38.68 
 
 		 246 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2728  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  34.33 
 
 		 269 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2350  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.33 
 
 		 269 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0807012  hitchhiker  0.000000111749 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23200  short chain dehydrogenase  37.5 
 
 		 246 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.246989  hitchhiker  0.000850788 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2167  short chain dehydrogenase  34.25 
 
 		 253 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.18591  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15740  short chain dehydrogenase  37.5 
 
 		 252 aa  133  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2037  short chain dehydrogenase  34.25 
 
 		 253 aa  133  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.317524  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1740  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  39.92 
 
 		 246 aa  132  5e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2307  short chain dehydrogenase  34.25 
 
 		 253 aa  132  5e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1926  short chain dehydrogenase  34.25 
 
 		 253 aa  132  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.641553  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2313  short chain dehydrogenase  32.92 
 
 		 253 aa  129  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.119343  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2660  short chain dehydrogenase  33.61 
 
 		 276 aa  127  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.219801  unclonable  0.0000000271181 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2012  short chain dehydrogenase  31.69 
 
 		 253 aa  124  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0861155  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 		 239 aa  121  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.640458 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1927  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 253 aa  121  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.745144  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1188  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.02 
 
 		 232 aa  120  3e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3652  short chain dehydrogenase  37.07 
 
 		 246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.816797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0403  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.84 
 
 		 237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.140375  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1204  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.19 
 
 		 238 aa  108  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2451  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.05 
 
 		 247 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.26523  normal  0.621505 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2500  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.96 
 
 		 250 aa  105  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.8 
 
 		 247 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176683  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4406  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.34 
 
 		 247 aa  100  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.851673 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2998  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.64 
 
 		 247 aa  99.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.264049  normal  0.384966 
 
 
-
 
NC_004310  BR0445  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.08 
 
 		 246 aa  98.2  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0452  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.08 
 
 		 255 aa  98.2  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.43 
 
 		 235 aa  98.2  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.91 
 
 		 244 aa  97.8  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0981  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.51 
 
 		 248 aa  97.4  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1497  NAD/NADP dependent oxidoreductase  32.59 
 
 		 246 aa  97.1  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.445063  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.03 
 
 		 257 aa  96.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.240167  normal  0.806426 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1687  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.05 
 
 		 247 aa  96.7  4e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.188551  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01316  short chain dehydrogenase  35.71 
 
 		 230 aa  95.5  7e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.395347  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0726  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.08 
 
 		 250 aa  95.5  9e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1271  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.05 
 
 		 255 aa  95.1  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4628  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.47 
 
 		 254 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351241  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3786  putative Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.02 
 
 		 247 aa  95.1  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1375  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.14 
 
 		 258 aa  95.1  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0796493  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.84 
 
 		 246 aa  94  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.667413 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>