241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0816 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0816  transcriptional activator domain protein  100 
 
 		 1133 aa  2267    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.437222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0078  transcriptional activator domain-containing protein  43.83 
 
 		 914 aa  510  1e-143  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.323405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  26.77 
 
 		 1105 aa  275  3e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  28.49 
 
 		 1122 aa  271  5e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6648  adenylate/guanylate cyclase  26.19 
 
 		 1048 aa  240  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.119419 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4480  adenylate/guanylate cyclase  26.86 
 
 		 1037 aa  233  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.420291 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  27.24 
 
 		 1148 aa  218  5e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6499  adenylate/guanylate cyclase  27.48 
 
 		 1043 aa  210  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.953876  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  26.99 
 
 		 1151 aa  209  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  27.21 
 
 		 1139 aa  208  5e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  26.79 
 
 		 1151 aa  207  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.92 
 
 		 1141 aa  202  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4100  tetratricopeptide TPR_4  26.74 
 
 		 1377 aa  199  2.0000000000000003e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000225277 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.2 
 
 		 1175 aa  198  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7064  adenylate/guanylate cyclase  25.67 
 
 		 1046 aa  192  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5691  sterile alpha motif-containing protein  25.43 
 
 		 1055 aa  192  4e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5181  adenylate/guanylate cyclase  28.59 
 
 		 1227 aa  187  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454407  normal  0.397726 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5885  adenylate/guanylate cyclase  27.48 
 
 		 1065 aa  185  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.484069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3318  serine/threonine protein kinase  25.24 
 
 		 1403 aa  181  7e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0363788 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2055  ATPase-like protein  27.91 
 
 		 1289 aa  179  3e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.125092  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3641  adenylate/guanylate cyclase  24.52 
 
 		 1138 aa  171  7e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595732  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  26.76 
 
 		 1134 aa  167  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3945  serine/threonine protein kinase  25.56 
 
 		 1402 aa  166  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0258209  decreased coverage  0.00379805 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4365  serine/threonine protein kinase  24.28 
 
 		 1398 aa  166  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161943  normal  0.271622 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  28.29 
 
 		 1160 aa  159  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.55 
 
 		 1149 aa  157  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0233  protein kinase  26.73 
 
 		 1358 aa  156  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.838065 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5817  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  23.69 
 
 		 1117 aa  155  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.987754  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1991  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.14 
 
 		 1023 aa  151  7e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0171462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5139  serine/threonine protein kinase  27.65 
 
 		 1349 aa  149  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5720  serine/threonine protein kinase  27.65 
 
 		 1349 aa  149  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.793186  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4507  serine/threonine protein kinase  27.79 
 
 		 1342 aa  147  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3132  serine/threonine protein kinase  27.5 
 
 		 1349 aa  146  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.28005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1265  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.01 
 
 		 1087 aa  146  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0514  protein kinase domain-containing protein  27.58 
 
 		 1353 aa  144  9e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3066  serine/threonine protein kinase  24.73 
 
 		 1311 aa  142  4.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.454085  normal  0.0824446 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4989  serine/threonine protein kinase  27.5 
 
 		 1348 aa  141  6e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  27.77 
 
 		 1067 aa  137  9e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.64 
 
 		 1089 aa  137  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0020  protein kinase domain-containing protein  28.69 
 
 		 1213 aa  130  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2866  protein kinase domain-containing protein  28.69 
 
 		 1359 aa  130  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2217  protein kinase domain-containing protein  28.69 
 
 		 1350 aa  130  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0639983  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2490  protein kinase domain-containing protein  28.69 
 
 		 1359 aa  130  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.460465  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0619  protein kinase domain-containing protein  28.69 
 
 		 1359 aa  129  5e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.646002  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0634  putative serine/threonine protein kinase  28.69 
 
 		 1359 aa  128  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0801  protein kinase domain-containing protein  28.69 
 
 		 1359 aa  128  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.423888  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1458  adenylate/guanylate cyclase  24.73 
 
 		 1271 aa  125  5e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1263  adenylate/guanylate cyclase  27.69 
 
 		 1027 aa  123  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.505762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3160  serine/threonine protein kinase  29.6 
 
 		 956 aa  122  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2730  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  29.13 
 
 		 1429 aa  118  6e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.225426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2662  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.8 
 
 		 1422 aa  116  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1237  adenylate/guanylate cyclase  29.44 
 
 		 1027 aa  115  5e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1254  adenylate/guanylate cyclase  29.44 
 
 		 1027 aa  115  5e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.419758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.4 
 
 		 1081 aa  113  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  27.48 
 
 		 1291 aa  112  6e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.19 
 
 		 1080 aa  109  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4588  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  25.24 
 
 		 1096 aa  109  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537027  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0044  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  25.63 
 
 		 1360 aa  108  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0143745  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1206  hypothetical protein  23.82 
 
 		 1142 aa  107  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0256  TPR repeat-containing protein  24.91 
 
 		 1298 aa  107  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2035  serine/threonine protein kinase  29.37 
 
 		 1383 aa  105  7e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.202066 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0385  adenylate/guanylate cyclase  25.85 
 
 		 1198 aa  103  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  23.29 
 
 		 1093 aa  103  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1771  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.6 
 
 		 1403 aa  101  6e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00900617  normal  0.173635 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1238  adenylate/guanylate cyclase  24.21 
 
 		 1050 aa  101  9e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431531  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1255  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  24.21 
 
 		 1050 aa  101  9e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.922944 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1262  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  23.97 
 
 		 1055 aa  101  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1904  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  24.54 
 
 		 1014 aa  99.8  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  28.36 
 
 		 983 aa  99  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  29.5 
 
 		 916 aa  98.2  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1863  serine/threonine protein kinase  27.45 
 
 		 1422 aa  95.1  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.51472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0048  adenylate/guanylate cyclase  25.45 
 
 		 1142 aa  95.1  7e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3586  adenylate/guanylate cyclase  24.46 
 
 		 1123 aa  94.4  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0258664  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1938  serine/threonine protein kinase  27.31 
 
 		 1346 aa  93.6  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.24353  normal  0.0612241 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  29.33 
 
 		 954 aa  93.6  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0102  serine/threonine protein kinase  30.08 
 
 		 1289 aa  93.6  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1264  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  24.76 
 
 		 1053 aa  94  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2256  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  25.98 
 
 		 1295 aa  92.4  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  27.53 
 
 		 1022 aa  92  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  28.89 
 
 		 1006 aa  90.9  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3632  serine/threonine protein kinase  27.89 
 
 		 1340 aa  89.7  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419397 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7278  adenylate/guanylate cyclase  24.07 
 
 		 1094 aa  89.7  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.137597 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2957  AAA ATPase  27.52 
 
 		 1264 aa  89  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302868 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  28.02 
 
 		 1126 aa  88.2  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  30.19 
 
 		 900 aa  87.8  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1068  transcriptional regulator, LuxR family  27.68 
 
 		 966 aa  87.4  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  27.02 
 
 		 967 aa  87  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0498  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  27.81 
 
 		 1150 aa  85.9  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2785  transcriptional regulator, LuxR family  30.38 
 
 		 1013 aa  85.5  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4285  adenylate/guanylate cyclase  27.03 
 
 		 1204 aa  84  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2749  serine/threonine protein kinase  28.28 
 
 		 1320 aa  84.3  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.750661  normal  0.0664583 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1020  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  24.54 
 
 		 1441 aa  84.3  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4797  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  25.34 
 
 		 1468 aa  84.3  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0329  ATPase-like protein  24.46 
 
 		 1169 aa  84  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.257596 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0601  adenylate/guanylate cyclase  24.55 
 
 		 1063 aa  83.6  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.534178 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5436  transcriptional regulator, LuxR family  27.7 
 
 		 959 aa  84  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800009 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0515  ATPase-like  25.63 
 
 		 1079 aa  83.2  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.413543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1246  transcriptional regulator  23.87 
 
 		 1020 aa  81.6  0.00000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.571861  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4054  serine/threonine protein kinase  28.98 
 
 		 1400 aa  81.6  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.736762 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 973 aa  81.6  0.00000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>