124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0478 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0478  lipid A biosynthesis acyltransferase  100 
 
 		 299 aa  604  9.999999999999999e-173  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03733  xanthomonadin biosynthesis acyltransferase  46.46 
 
 		 324 aa  262  4e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4175  putative lauroyl/myristoyl acyltransferase involved in LPS biosynthesis  45.36 
 
 		 301 aa  256  3e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0066  lipid A biosynthesis acyltransferase  46.55 
 
 		 314 aa  256  4e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3931  hypothetical protein  42.86 
 
 		 323 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.959639  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2748  putative lauroyl/myristoyl acyltransferase involved in LPS biosynthesis  46.21 
 
 		 310 aa  249  4e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.252016  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0917  hypothetical protein  45.52 
 
 		 315 aa  249  5e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1990  acyltransferase  44.82 
 
 		 326 aa  248  7e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.186271  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2067  acyltransferase  45.15 
 
 		 326 aa  248  8e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1376  lipid A biosynthesis acyltransferase  43.29 
 
 		 326 aa  240  2e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.227614  hitchhiker  0.00151708 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2681  acyltransferase-like protein  42.03 
 
 		 324 aa  239  5e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.640182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2814  acyltransferase-like protein  42.03 
 
 		 324 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296791  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0943  lipid A biosynthesis acyltransferase  40.07 
 
 		 306 aa  232  6e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2148  acyltransferase-like  42.37 
 
 		 327 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.109876  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2762  acyltransferase-like protein  42.37 
 
 		 327 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00399604  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3299  putative lauroyl/myristoyl acyltransferase involved in LPS biosynthesis  42.57 
 
 		 334 aa  230  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.921474  normal  0.662751 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6092  acyltransferase-like  42.37 
 
 		 327 aa  229  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0436764  normal  0.372543 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1320  hypothetical protein  43.19 
 
 		 321 aa  229  3e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.605124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0307  hypothetical protein  42.76 
 
 		 320 aa  224  1e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0800  hypothetical protein  40.14 
 
 		 282 aa  223  2e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0431  hypothetical protein  41.08 
 
 		 323 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.691434  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0319  lipid A biosynthesis acyltransferase  42.42 
 
 		 320 aa  211  7.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.362183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3989  lipid A biosynthesis acyltransferase  39.32 
 
 		 304 aa  209  5e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2098  putative glycosyl transferase  34.84 
 
 		 563 aa  184  1.0000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2672  hypothetical protein  39.81 
 
 		 332 aa  177  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.258257  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4373  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.55 
 
 		 594 aa  176  5e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3603  glycosyl transferase family protein  34.98 
 
 		 568 aa  171  9e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4078  glycosyl transferase family protein  34.98 
 
 		 568 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3918  lipid A biosynthesis acyltransferase  36.42 
 
 		 313 aa  171  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0336  glycosyl transferase family protein  32.59 
 
 		 606 aa  171  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0342  glycosyl transferase family protein  32.69 
 
 		 619 aa  170  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0932  hypothetical protein  36.27 
 
 		 575 aa  170  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3059  glycosyl transferase family 2  35.92 
 
 		 575 aa  170  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158212  normal  0.489966 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0345  glycosyl transferase family protein  32.59 
 
 		 610 aa  169  4e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00785  hypothetical protein  36.54 
 
 		 567 aa  169  6e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0337  glycosyl transferase family protein  32.46 
 
 		 619 aa  168  8e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0335  glycosyl transferase family protein  32.69 
 
 		 619 aa  168  9e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3681  glycosyl transferase family protein  32.58 
 
 		 610 aa  168  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0441  glycosyl transferase family protein  32.36 
 
 		 629 aa  167  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0895  glycosyl transferase family protein  35.02 
 
 		 572 aa  167  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.661363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4766  glycosyl transferase family 2  35.1 
 
 		 573 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3689  glycosyl transferase family 2  35.1 
 
 		 573 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.329039 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0345  glycosyl transferase family 2  32.46 
 
 		 623 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259601 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3516  glycosyl transferase family protein  33.01 
 
 		 572 aa  165  8e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0695  glycosyl transferase family protein  35.18 
 
 		 593 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26589  normal  0.841638 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0347  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 		 606 aa  163  3e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3384  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.34 
 
 		 552 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4806  glycosyl transferase, family 2  33.66 
 
 		 558 aa  161  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.705565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004069  acyltransferase  31.83 
 
 		 568 aa  160  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4601  glycosyl transferase family protein  31.51 
 
 		 567 aa  160  3e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228674 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5098  hypothetical protein  34.11 
 
 		 315 aa  155  9e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0432  hypothetical protein  33.77 
 
 		 315 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0320  glycosyl transferase family protein  30.16 
 
 		 567 aa  154  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187922 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3891  glycosyl transferase family protein  33.44 
 
 		 563 aa  154  2.9999999999999998e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.845308 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3893  glycosyl transferase family protein  29.97 
 
 		 585 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4383  lipid A biosynthesis acyltransferase  31.89 
 
 		 343 aa  149  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0399697  normal  0.120258 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0434  hypothetical protein  33.77 
 
 		 315 aa  149  6e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.037729  normal  0.512971 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4574  glycosyl transferase family 2  33.23 
 
 		 571 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2753  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.53 
 
 		 324 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.602528  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0117  acyltransferase  29.87 
 
 		 306 aa  125  6e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000125573  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2177  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.85 
 
 		 536 aa  124  2e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000219359  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1857  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.43 
 
 		 296 aa  124  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2122  acyltransferase  26.53 
 
 		 298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.946895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0549  lipid A biosynthesis acyltransferase  26 
 
 		 299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.3206  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1995  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.78 
 
 		 288 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.834184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1104  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.37 
 
 		 292 aa  109  5e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0922  lipid A biosynthesis acyltransferase  31.16 
 
 		 300 aa  102  7e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0972  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.83 
 
 		 535 aa  102  7e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000724117  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0435  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.15 
 
 		 320 aa  102  8e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.646584  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03895  hypothetical protein  24.26 
 
 		 290 aa  100  3e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2099  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.19 
 
 		 287 aa  92  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2652  acyltransferase  26.32 
 
 		 303 aa  84.3  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3613  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.39 
 
 		 300 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0243  hypothetical protein  27.24 
 
 		 299 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.185931  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0306  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.32 
 
 		 298 aa  75.9  0.0000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000601508  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2207  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.73 
 
 		 302 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1688  hypothetical protein  26.2 
 
 		 297 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.426385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1483  acyltransferase  25 
 
 		 307 aa  62  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1224  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.27 
 
 		 234 aa  58.9  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1802  acyltransferase  26.44 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00482344 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1563  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.37 
 
 		 281 aa  57  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0369  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.79 
 
 		 302 aa  57  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1078  lauroyl/myristoyl acyltransferase  20.76 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.210564 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0347  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.21 
 
 		 298 aa  55.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0271  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.55 
 
 		 307 aa  55.1  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0343  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.29 
 
 		 301 aa  55.5  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.725626 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2601  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.73 
 
 		 301 aa  55.1  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0768  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.57 
 
 		 303 aa  52.8  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.922594  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0365  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.4 
 
 		 291 aa  52.4  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0338088 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0079  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.8 
 
 		 293 aa  52.4  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0319084 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6125  Lauroyl/myristoyl acyltransferase-like protein  24.47 
 
 		 304 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.226979  normal  0.687421 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2901  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.47 
 
 		 284 aa  51.6  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2101  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.73 
 
 		 304 aa  51.2  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00461081  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3026  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.11 
 
 		 316 aa  50.8  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0623  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.52 
 
 		 319 aa  49.3  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.791174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1414  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.29 
 
 		 314 aa  49.3  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0185573  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3420  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase, putative  26.09 
 
 		 307 aa  48.1  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2358  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.46 
 
 		 284 aa  48.1  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0495  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.6 
 
 		 294 aa  47.8  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3414  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.75 
 
 		 309 aa  47  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>