More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0074 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0074  amino acid permease family protein  100 
 
 		 447 aa  879    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1784  amino acid transporter  26.27 
 
 		 462 aa  107  5e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000562371  hitchhiker  4.50262e-17 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  26.22 
 
 		 490 aa  105  1e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0554  amino acid transporter  26.87 
 
 		 476 aa  100  4e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00163593  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  23.45 
 
 		 471 aa  99  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  25.96 
 
 		 496 aa  97.8  4e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1741  amino acid permease-associated region  25.88 
 
 		 467 aa  97.1  5e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.908164  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  22.39 
 
 		 471 aa  95.1  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1855  amino acid transporter  25.44 
 
 		 443 aa  95.5  2e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.599049  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0441  amino acid permease-associated region  30.98 
 
 		 740 aa  94.4  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.238325  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  25.85 
 
 		 476 aa  94.7  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  22.79 
 
 		 471 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  22.57 
 
 		 471 aa  93.2  9e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  22.35 
 
 		 471 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  22.35 
 
 		 471 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  22.35 
 
 		 471 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  22.35 
 
 		 471 aa  91.7  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  25.8 
 
 		 483 aa  92  2e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  22.35 
 
 		 471 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  23.74 
 
 		 469 aa  91.7  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  25.33 
 
 		 471 aa  91.7  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  25.33 
 
 		 471 aa  91.7  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  22.84 
 
 		 494 aa  91.3  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  25.33 
 
 		 471 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  25.31 
 
 		 476 aa  90.9  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0631  amino acid permease family protein  22.62 
 
 		 471 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.279847  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2142  amino acid permease family protein  22.25 
 
 		 459 aa  90.9  5e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3674  amino acid permease-associated region  23.82 
 
 		 549 aa  90.1  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0328426  normal  0.284517 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2849  amino acid permease  25.33 
 
 		 471 aa  89.7  9e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.714889  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5815  amino acid permease-associated region  23.97 
 
 		 465 aa  89.7  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  22.62 
 
 		 471 aa  89.4  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  27.02 
 
 		 436 aa  89.4  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0321  amino acid permease family protein  24.58 
 
 		 460 aa  89.4  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0838341  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1907  amino acid permease-associated region  24.75 
 
 		 486 aa  88.6  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0305  amino acid permease-associated region  24.59 
 
 		 468 aa  88.6  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0385  amino acid permease-associated region  26.87 
 
 		 453 aa  87.8  3e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000859435  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1000  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 566 aa  87.8  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1213  amino acid permease-associated region  28.46 
 
 		 541 aa  87  5e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2687  amino acid permease-associated region  25.84 
 
 		 465 aa  87  6e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.825447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0764  amino acid permease  26.84 
 
 		 459 aa  87  6e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00283351  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  23.87 
 
 		 466 aa  86.7  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1116  putative amino acid permease  27.15 
 
 		 458 aa  86.7  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00419604  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1168  amino acid transporter  26.22 
 
 		 478 aa  86.7  8e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0306264  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  23.87 
 
 		 468 aa  86.7  9e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3597  amino acid permease-associated region  25.34 
 
 		 549 aa  86.7  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.333154 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0907  amino acid transporter  24.16 
 
 		 486 aa  86.3  9e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.555245  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  23.87 
 
 		 468 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  23.56 
 
 		 471 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0965  amino acid permease  27.32 
 
 		 458 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.307962  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0961  amino acid permease  27.32 
 
 		 458 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0130325  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  23.29 
 
 		 486 aa  85.9  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4455  amino acid permease-associated region  23.42 
 
 		 496 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  23.87 
 
 		 468 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  23.42 
 
 		 496 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0096  amino acid permease-associated region  25.13 
 
 		 466 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  23.4 
 
 		 476 aa  85.5  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  22.17 
 
 		 486 aa  85.1  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3674  amino acid permease-associated region  26.93 
 
 		 487 aa  85.1  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1191  amino acid permease-associated region  25.66 
 
 		 499 aa  85.1  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3228  amino acid permease-associated region  24.58 
 
 		 473 aa  85.5  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2106  amino acid permease family protein  24.89 
 
 		 471 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  23.79 
 
 		 467 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  23.87 
 
 		 468 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  23.62 
 
 		 466 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  23.12 
 
 		 466 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3163  amino acid permease family protein  24.67 
 
 		 471 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1808  amino acid transporter  24.34 
 
 		 465 aa  84.7  0.000000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000076298  hitchhiker  0.0000000000409798 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1930  amino acid permease-associated region  26.09 
 
 		 463 aa  84.3  0.000000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372004  hitchhiker  0.00366235 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4029  amino acid permease-associated region  27.34 
 
 		 488 aa  84  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.891947  normal  0.206887 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3131  amino acid permease family protein  24.62 
 
 		 471 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  25.24 
 
 		 506 aa  84  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  23.18 
 
 		 467 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  23.18 
 
 		 467 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2897  amino acid permease  24.45 
 
 		 471 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0279038  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  23.18 
 
 		 467 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  24.17 
 
 		 467 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1318  amino acid transporter  26.76 
 
 		 461 aa  83.6  0.000000000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00693769  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  23.18 
 
 		 467 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0345  amino acid permease-associated region  25.61 
 
 		 468 aa  83.2  0.000000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  24.75 
 
 		 439 aa  83.2  0.000000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0778  amino acid permease-associated region  26.29 
 
 		 459 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000191037 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  23.18 
 
 		 467 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0627  amino acid transporter  25.9 
 
 		 458 aa  82.4  0.00000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0212224  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0026  hypothetical protein  25 
 
 		 463 aa  82.8  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  24.55 
 
 		 463 aa  82.8  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  22.96 
 
 		 467 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1260  amino acid permease family protein  23.15 
 
 		 452 aa  82  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1465  amino acid permease-associated region  24 
 
 		 488 aa  82  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1720  amino acid permease-associated region  26.34 
 
 		 471 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0250  amino acid permease-associated region  23.8 
 
 		 465 aa  82.4  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2460  amino acid permease-associated region  24.44 
 
 		 468 aa  82.4  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.708189  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3885  amino acid permease-associated region  27.53 
 
 		 487 aa  81.6  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.223191  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4398  amino acid permease-associated region  27.46 
 
 		 488 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.465101 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1840  amino acid transporter  24.09 
 
 		 466 aa  82  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2785  amino acid permease-associated region  24.03 
 
 		 520 aa  81.3  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0177971 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2517  amino acid permease-associated region  25.96 
 
 		 468 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0972613  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  23.57 
 
 		 467 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4348  basic amino acid transporter  25.63 
 
 		 463 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.190712 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2530  amino acid permease-associated region  25.42 
 
 		 449 aa  81.3  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.480015  normal  0.105308 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2924  amino acid permease-associated region  23.49 
 
 		 473 aa  81.3  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.670343  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>