More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2142 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2142  amino acid permease family protein  100 
 
 		 459 aa  926    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1787  amino acid permease-associated region  63.13 
 
 		 453 aa  582  1.0000000000000001e-165  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1260  amino acid permease family protein  62.25 
 
 		 452 aa  582  1.0000000000000001e-165  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1753  amino acid permease-associated region  63.13 
 
 		 453 aa  582  1.0000000000000001e-165  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0124899  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2017  amino acid permease family protein  56.33 
 
 		 458 aa  539  9.999999999999999e-153  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000181843  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2464  amino acid permease-associated region  57.73 
 
 		 469 aa  538  1e-151  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.025431  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2513  amino acid permease-associated region  57.73 
 
 		 469 aa  538  1e-151  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0665501  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4632  D-alanine/D-serine/glycine permease  48.15 
 
 		 468 aa  477  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.75325  normal  0.0825274 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4718  D-alanine/D-serine/glycine permease  47.25 
 
 		 468 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0967735  normal  0.0466612 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4840  D-alanine/D-serine/glycine permease  47.47 
 
 		 468 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.317801  normal  0.122354 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4896  D-alanine/D-serine/glycine permease  46.52 
 
 		 473 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.673653  normal  0.259186 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4759  D-alanine/D-serine/glycine permease  48.55 
 
 		 467 aa  460  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.329595  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04080  D-alanine/D-serine/glycine transporter  48.24 
 
 		 470 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000357991  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3785  amino acid permease-associated region  48.24 
 
 		 470 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000255253  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4776  D-alanine/D-serine/glycine permease  48.24 
 
 		 470 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000471149  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4794  D-alanine/D-serine/glycine permease  48.55 
 
 		 467 aa  460  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.489012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4749  D-alanine/D-serine/glycine permease  48.24 
 
 		 470 aa  461  9.999999999999999e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000228678  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04043  hypothetical protein  48.24 
 
 		 470 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000255427  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4816  D-alanine/D-serine/glycine permease  49.43 
 
 		 469 aa  459  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.343115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0378  D-alanine/D-serine/glycine permease  49.43 
 
 		 469 aa  458  9.999999999999999e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000253333  normal  0.311262 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5725  D-alanine/D-serine/glycine permease  48.24 
 
 		 470 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00067927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4666  D-alanine/D-serine/glycine permease  49.43 
 
 		 469 aa  459  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0386097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3798  D-alanine/D-serine/glycine permease  48.24 
 
 		 470 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000560112  normal  0.948087 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4676  D-alanine/D-serine/glycine permease  49.43 
 
 		 469 aa  459  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00205284  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1591  D-alanine/D-serine/glycine permease  48.24 
 
 		 470 aa  456  1e-127  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.892948  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4458  D-alanine/D-serine/glycine permease  49.2 
 
 		 467 aa  457  1e-127  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000362617  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2608  D-alanine/D-serine/glycine permease  47.05 
 
 		 487 aa  456  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.737465 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3739  D-alanine/D-serine/glycine permease  46.71 
 
 		 482 aa  455  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0151839  normal  0.192087 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2361  D-alanine/D-serine/glycine permease  48.58 
 
 		 474 aa  452  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.149802  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2672  D-alanine/D-serine/glycine permease  48.02 
 
 		 470 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.164346  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2259  D-alanine/D-serine/glycine permease  48.58 
 
 		 471 aa  452  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.046598  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2045  D-alanine/D-serine/glycine permease  48.58 
 
 		 471 aa  452  1.0000000000000001e-126  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00488299  normal  0.01176 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3098  D-alanine/D-serine/glycine permease  46.55 
 
 		 474 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1825  D-alanine/D-serine/glycine permease  48.77 
 
 		 466 aa  447  1.0000000000000001e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.20063 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4685  D-alanine/D-serine/glycine permease  49.2 
 
 		 467 aa  443  1e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000407821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30130  gamma-aminobutyrate permease-like transporter  49.55 
 
 		 503 aa  442  1e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.362555 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4275  amino acid permease-associated region  48.44 
 
 		 467 aa  440  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1516  amino acid permease-associated region  48.02 
 
 		 469 aa  437  1e-121  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0916  D-serine/D-alanine/glycine transporter  46.8 
 
 		 466 aa  433  1e-120  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.104508  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3773  amino acid permease-associated region  46.92 
 
 		 502 aa  427  1e-118  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0405  D-alanine/D-serine/glycine permease  46.99 
 
 		 457 aa  424  1e-117  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0728357 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0983  amino acid permease-associated region  46.04 
 
 		 473 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.604277  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0539  amino acid permease-associated region  45.36 
 
 		 513 aa  417  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1448  amino acid permease-associated region  46.29 
 
 		 473 aa  413  1e-114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11719  D-serine/alanine/glycine transporter protein cycA  47.33 
 
 		 556 aa  408  1e-113  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.636709  normal  0.17883 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4992  amino acid permease-associated region  44.54 
 
 		 475 aa  409  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2200  amino acid permease-associated region  47.54 
 
 		 467 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2394  amino acid permease-associated region  44.27 
 
 		 472 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4894  amino acid permease-associated region  42.22 
 
 		 459 aa  388  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04173  D-alanine/D-serine/glycine permease  47.61 
 
 		 440 aa  386  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3611  amino acid permease-associated region  43.99 
 
 		 493 aa  387  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1560  amino acid permease  41.04 
 
 		 461 aa  382  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.762264  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1301  amino acid permease-associated region  43.14 
 
 		 448 aa  383  1e-105  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3389  amino acid permease-associated region  41.7 
 
 		 464 aa  385  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0717  amino acid permease  42.63 
 
 		 447 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2440  amino acid permease  42 
 
 		 461 aa  382  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3129  amino acid permease  42.7 
 
 		 468 aa  381  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0821  amino acid permease family protein  43.21 
 
 		 463 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000433182  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0725  amino acid permease family protein  43.18 
 
 		 463 aa  379  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.050872  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0745  amino acid permease  42.63 
 
 		 447 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.527192  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1170  amino acid permease  42 
 
 		 485 aa  382  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.247985  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1709  amino acid permease  42.63 
 
 		 447 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0608  amino acid permease-associated region  42.76 
 
 		 463 aa  377  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000166726  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0762  amino acid permease family protein  43.21 
 
 		 463 aa  378  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.561238  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0659  amino acid permease family protein  42.99 
 
 		 463 aa  376  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000492464  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0603  amino acid permease; proline-specific permease  42.99 
 
 		 463 aa  376  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000034111  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0604  amino acid permease; proline-specific permease  42.99 
 
 		 463 aa  376  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000017445  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0693  amino acid permease family protein  42.99 
 
 		 463 aa  376  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.890997  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0748  amino acid permease family protein  42.99 
 
 		 463 aa  376  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000194828 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4610  amino acid permease family protein  42.95 
 
 		 463 aa  377  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000638139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0584  amino acid permease-associated region  43.44 
 
 		 463 aa  375  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000395475  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1244  proline-specific permease  41.33 
 
 		 485 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1089  amino acid permease-associated region  42 
 
 		 472 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.501177  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0056  amino acid permease family protein  47.22 
 
 		 467 aa  374  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4729  amino acid permease  41.43 
 
 		 471 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.735524  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1059  amino acid permease-associated region  42 
 
 		 472 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.341828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1100  amino acid permease-associated region  42 
 
 		 472 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0119846  normal  0.968879 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3525  amino acid permease-associated region  39.82 
 
 		 462 aa  369  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0051  amino acid permease family protein  47.22 
 
 		 467 aa  370  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2796  amino acid permease  41.92 
 
 		 468 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0563419  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0036  amino acid permease  42.14 
 
 		 468 aa  371  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2472  amino acid permease-associated region  42.92 
 
 		 485 aa  369  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1646  amino acid transporter  40.04 
 
 		 460 aa  369  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.815643  normal  0.134679 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5984  amino acid permease-associated region  40.69 
 
 		 460 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3996  amino acid permease-associated region  40.69 
 
 		 460 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54040  amino acid permease  41.43 
 
 		 471 aa  371  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0663  gamma-aminobutyrate permease related permease  41.61 
 
 		 457 aa  369  1e-101  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4371  amino acid permease-associated region  40.69 
 
 		 460 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0019  amino acid permease  41.92 
 
 		 468 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.038207  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1747  amino acid permease  41.92 
 
 		 468 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3814  amino acid permease  42.14 
 
 		 468 aa  371  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.756679  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3874  amino acid permease  42.14 
 
 		 468 aa  371  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3181  amino acid permease  41.92 
 
 		 468 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0172  amino acid permease-associated region  43.61 
 
 		 468 aa  368  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0100  amino acid permease-associated region  43.4 
 
 		 449 aa  368  1e-100  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000148817  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4353  amino acid permease-associated region  41.56 
 
 		 472 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578199 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2459  amino acid permease-associated region  40.26 
 
 		 462 aa  363  4e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000167644  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4250  amino acid permease-associated region  40.98 
 
 		 471 aa  362  6e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.254584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0665  amino acid permease-associated region  39.91 
 
 		 459 aa  361  1e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4561  amino acid permease-associated region  41.43 
 
 		 473 aa  361  1e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>