75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10105 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_10105  hypothetical protein  100 
 
 		 504 aa  1009    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4092  adenosylhomocysteinase  29.07 
 
 		 394 aa  64.3  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.813316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3370  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  42.31 
 
 		 425 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2732  cyclic nucleotide-binding protein  42.31 
 
 		 425 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6807  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase, NAD binding  26.4 
 
 		 500 aa  58.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_3120  predicted protein  34.38 
 
 		 241 aa  56.2  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2775  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  32.09 
 
 		 493 aa  55.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.85719 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0490  Adenosylhomocysteinase  27.24 
 
 		 385 aa  54.7  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.332227 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5091  MscS Mechanosensitive ion channel  31.09 
 
 		 637 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148956  normal  0.0183068 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0336  NUDIX family hydrolase  25.7 
 
 		 548 aa  55.1  0.000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0925  cyclic nucleotide-binding:protein kinase  29.27 
 
 		 454 aa  54.7  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2710  cyclic nucleotide-binding protein  34.56 
 
 		 388 aa  54.3  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2303  MscS Mechanosensitive ion channel  36.46 
 
 		 512 aa  53.5  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.697138  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3804  MscS Mechanosensitive ion channel  32.93 
 
 		 495 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0386  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.36 
 
 		 340 aa  53.1  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2230  hypothetical protein  33.04 
 
 		 356 aa  53.5  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323716 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2270  cyclic nucleotide-binding protein  36.15 
 
 		 477 aa  52.4  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00166052 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0301  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  35.42 
 
 		 858 aa  52.8  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0446  Adenosylhomocysteinase  25.86 
 
 		 385 aa  52.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.10935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0866  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.96 
 
 		 546 aa  51.2  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.100369 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0496  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.3 
 
 		 129 aa  50.8  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05510  cAMP-dependent protein kinase inhibitor, putative  37.11 
 
 		 482 aa  50.8  0.00006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3212  cyclic nucleotide-binding protein  34.4 
 
 		 388 aa  50.4  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0065  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 258 aa  50.4  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0605636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12585  hypothetical protein  32.53 
 
 		 583 aa  50.4  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.274213  normal  0.619754 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5420  hypothetical protein  37.5 
 
 		 265 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00117771  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0723  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  35.71 
 
 		 173 aa  49.7  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4790  cyclic nucleotide-binding protein  40.24 
 
 		 170 aa  49.7  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2519  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  27.59 
 
 		 492 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.806579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3368  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.78 
 
 		 503 aa  48.9  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00879958  normal  0.135189 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04987  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit (PKA regulatory subunit) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O59922]  34.09 
 
 		 412 aa  49.3  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.599779  normal  0.51731 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0426  Na+/H+ antiporter  30.77 
 
 		 832 aa  48.9  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62260  hypothetical protein  37.5 
 
 		 265 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000560596  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3692  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.53 
 
 		 146 aa  49.3  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2082  cyclic nucleotide-binding protein  30.77 
 
 		 832 aa  48.9  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.584605  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03665  sulfate transporter family protein (AFU_orthologue; AFUA_4G12440)  34.38 
 
 		 1053 aa  48.9  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2455  cyclic nucleotide-binding protein  34.31 
 
 		 594 aa  48.1  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1433  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.47 
 
 		 408 aa  48.1  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.532362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4020  cyclic nucleotide-binding  43.75 
 
 		 367 aa  48.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109231  normal  0.727114 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4028  Thioredoxin-disulfide reductase  33.62 
 
 		 538 aa  47.8  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0134605  normal  0.10391 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11563  predicted protein  28.57 
 
 		 238 aa  47.4  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.684972  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3442  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.68 
 
 		 563 aa  47.4  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352677  normal  0.0673657 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3707  hypothetical protein  30.68 
 
 		 563 aa  47.4  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.78076  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4410  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 225 aa  47  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.994375  normal  0.444525 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3152  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.26 
 
 		 487 aa  47  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.833452  normal  0.47191 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4796  cyclic nucleotide-binding (cNMP-bd) protein  37.35 
 
 		 263 aa  47  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370555  unclonable  0.0000216721 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2063  hypothetical protein  26.42 
 
 		 153 aa  46.2  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0098  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.93 
 
 		 211 aa  46.2  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.4392599999999995e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2504  cyclic nucleotide-binding protein  26.92 
 
 		 628 aa  46.6  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3689  cyclic nucleotide-binding protein  24.72 
 
 		 454 aa  46.6  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120597  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_12211  predicted protein  33.75 
 
 		 528 aa  46.2  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0772  cyclic nucleotide-binding protein  31.09 
 
 		 164 aa  45.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0764  adenosylhomocysteinase  26.49 
 
 		 420 aa  45.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.812753  normal  0.114058 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2350  cyclic nucleotide-binding protein  35.23 
 
 		 832 aa  45.8  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0998  cyclic nucleotide-binding protein  34.72 
 
 		 265 aa  45.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000000222196  unclonable  1.0277600000000001e-18 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 226 aa  45.8  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3910  cyclic nucleotide-binding protein  31.48 
 
 		 167 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.34683  normal  0.175845 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13268  transmembrane transport protein  36.14 
 
 		 1048 aa  45.8  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.321047 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82287  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit (PKA regulatory subunit)  33.33 
 
 		 441 aa  45.8  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.770378 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6804  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.58 
 
 		 238 aa  45.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.223692 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5447  voltage-dependent potassium channel  29.93 
 
 		 409 aa  45.1  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.532768  normal  0.0697598 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0840  cyclic nucleotide-binding protein  31.31 
 
 		 350 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.126759 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4712  cyclic nucleotide-binding protein  37.33 
 
 		 412 aa  44.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566577  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4137  cyclic nucleotide-binding protein  35.37 
 
 		 177 aa  44.7  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.252066 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3069  hypothetical protein  27.94 
 
 		 721 aa  44.3  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3494  cyclic nucleotide-binding protein  35.37 
 
 		 173 aa  44.7  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0343  cyclic nucleotide-binding protein  37.36 
 
 		 811 aa  44.3  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0783507  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2053  hypothetical protein  25.47 
 
 		 153 aa  44.3  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3727  cyclic nucleotide-binding protein  34.18 
 
 		 167 aa  44.3  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00887093 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0079  hypothetical protein  44 
 
 		 169 aa  43.9  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.26747 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2821  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  30.73 
 
 		 377 aa  43.9  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0417356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5025  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.71 
 
 		 1056 aa  43.9  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00524189  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2926  hypothetical protein  27.94 
 
 		 721 aa  43.5  0.009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0664  cyclic nucleotide-binding  35 
 
 		 449 aa  43.5  0.009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0101822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0533  MscS Mechanosensitive ion channel  38.3 
 
 		 472 aa  43.5  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>