182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6807 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6807  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase, NAD binding  100 
 
 
500 aa  979    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4092  adenosylhomocysteinase  31.28 
 
 
394 aa  88.2  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.813316  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0872  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  29.61 
 
 
500 aa  84  0.000000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3048  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  27.54 
 
 
428 aa  83.6  0.000000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000864527  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0753  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  29.32 
 
 
404 aa  81.6  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1513  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  26.46 
 
 
425 aa  81.3  0.00000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0776  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  29.23 
 
 
404 aa  80.1  0.00000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0764  adenosylhomocysteinase  28.39 
 
 
420 aa  79.7  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.812753  normal  0.114058 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0905  adenosylhomocysteinase  26.72 
 
 
413 aa  79.7  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1393  Adenosylhomocysteinase  28 
 
 
413 aa  79.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1411  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  25.2 
 
 
408 aa  79.3  0.0000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17500  adenosylhomocysteinase  26.59 
 
 
414 aa  79.3  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.778784  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1209  adenosylhomocysteinase  25.65 
 
 
419 aa  78.2  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.971819  normal  0.0566863 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0660  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  26.74 
 
 
408 aa  77.8  0.0000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4355  adenosylhomocysteinase  24.87 
 
 
419 aa  77.4  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.506408  normal  0.724655 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1811  adenosylhomocysteinase  25.7 
 
 
436 aa  76.6  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3564  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  25 
 
 
420 aa  76.3  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.988604 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0756  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  26.63 
 
 
425 aa  75.5  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.43874 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0646  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  27.53 
 
 
408 aa  75.9  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0468936  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3251  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  27.52 
 
 
411 aa  72.4  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.234298 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3401  adenosylhomocysteinase  26.98 
 
 
406 aa  72  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0488  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  24.78 
 
 
431 aa  71.6  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1200  adenosylhomocysteinase  25.72 
 
 
414 aa  71.2  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.51661  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1357  adenosylhomocysteinase  30.15 
 
 
380 aa  70.9  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.361298  normal  0.0210902 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1035  adenosylhomocysteinase  27.38 
 
 
411 aa  70.5  0.00000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.980475  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0965  adenosylhomocysteinase  25.94 
 
 
416 aa  70.1  0.00000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0674  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  24.65 
 
 
421 aa  69.7  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0147  adenosylhomocysteinase  24.8 
 
 
429 aa  69.3  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1849  adenosylhomocysteinase  24.79 
 
 
427 aa  68.9  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0159  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  24.5 
 
 
420 aa  68.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03570  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  25.07 
 
 
465 aa  68.2  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0760213  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2686  adenosylhomocysteinase  24.79 
 
 
425 aa  68.6  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3043  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  24.8 
 
 
464 aa  68.6  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.365932  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0050  adenosylhomocysteinase  26.14 
 
 
421 aa  68.2  0.0000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1004  adenosylhomocysteinase  25.08 
 
 
418 aa  67.8  0.0000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1547  adenosylhomocysteinase  25.76 
 
 
403 aa  67.4  0.0000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1484  adenosylhomocysteinase  25.49 
 
 
415 aa  67.4  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2039  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  27.27 
 
 
442 aa  67.4  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.970546  normal  0.403341 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1998  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  26.51 
 
 
416 aa  67.4  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.205607  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0059  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  25.53 
 
 
429 aa  66.6  0.0000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00179042 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1765  adenosylhomocysteinase  25.82 
 
 
425 aa  65.9  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1485  adenosylhomocysteinase  26.32 
 
 
417 aa  65.5  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2623  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  26.22 
 
 
425 aa  65.5  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114233  normal  0.339873 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2416  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  25.64 
 
 
425 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4849  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  25 
 
 
469 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0697439 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0167  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  23.48 
 
 
415 aa  65.1  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.636373 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2366  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  25.64 
 
 
425 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4055  adenosylhomocysteinase  26.09 
 
 
420 aa  64.7  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4381  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  24.78 
 
 
429 aa  64.3  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0491549 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0213  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  23.56 
 
 
415 aa  64.3  0.000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0145885  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0489  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  24.74 
 
 
469 aa  64.3  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5280  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  24.47 
 
 
469 aa  63.9  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76463  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  25.76 
 
 
449 aa  63.9  0.000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1765  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  24.51 
 
 
399 aa  63.9  0.000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01263  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase (Eurofung)  26.2 
 
 
449 aa  63.5  0.000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0454669  normal  0.150578 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0449  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  28.81 
 
 
469 aa  63.5  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5025  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  24.47 
 
 
469 aa  63.5  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND00240  adenosylhomocysteinase, putative  25.33 
 
 
431 aa  62.8  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.672849  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4338  adenosylhomocysteinase  27.95 
 
 
436 aa  63.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.588356  normal  0.419207 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0727  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  22.9 
 
 
437 aa  63.2  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.107341  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0228  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  28.07 
 
 
422 aa  62.8  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1128  adenosylhomocysteinase  24.57 
 
 
426 aa  62.4  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0649  adenosylhomocysteinase  25.74 
 
 
417 aa  62.4  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0460  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  24.52 
 
 
469 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2679  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  25.42 
 
 
437 aa  61.6  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.455308  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4402  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  24.58 
 
 
428 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000312521  normal  0.874469 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1679  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  25.72 
 
 
437 aa  61.2  0.00000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0532  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  26.6 
 
 
465 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2352  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  23.86 
 
 
420 aa  61.2  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2003  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  25.21 
 
 
441 aa  60.8  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2821  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  25.15 
 
 
377 aa  61.2  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0417356  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1735  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  22.61 
 
 
415 aa  60.8  0.00000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1998  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  25.21 
 
 
441 aa  60.5  0.00000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05620  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  26.6 
 
 
469 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1666  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  25.75 
 
 
439 aa  60.8  0.00000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0107908 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0793  adenosylhomocysteinase  23.73 
 
 
413 aa  60.5  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0617  adenosylhomocysteinase  26.25 
 
 
432 aa  60.5  0.00000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0524  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  24.3 
 
 
421 aa  59.7  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00522036  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3754  adenosylhomocysteinase  25.75 
 
 
420 aa  59.7  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0211  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  24.09 
 
 
418 aa  59.3  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2168  adenosylhomocysteinase  23.6 
 
 
415 aa  58.9  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000002022  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0360  adenosylhomocysteinase  24.44 
 
 
417 aa  58.9  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0847  adenosylhomocysteinase  24.29 
 
 
425 aa  58.5  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1181  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  25.77 
 
 
411 aa  58.5  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5068  adenosylhomocysteinase  25.62 
 
 
469 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.724438  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0610  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  25.97 
 
 
435 aa  57.8  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10105  hypothetical protein  25.86 
 
 
504 aa  58.2  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1599  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  25.2 
 
 
436 aa  57.8  0.0000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.171763  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1675  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  24.69 
 
 
430 aa  57.4  0.0000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.146428  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0136  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  23.48 
 
 
401 aa  57.4  0.0000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0052  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  23.31 
 
 
434 aa  57.4  0.0000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0766  adenosylhomocysteinase  25.14 
 
 
421 aa  57.4  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.206287 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0567  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  26.91 
 
 
410 aa  57  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.200661 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1579  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  25 
 
 
438 aa  57  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0204825  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2132  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  23.31 
 
 
438 aa  57  0.0000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0883  adenosylhomocysteinase  23.28 
 
 
414 aa  57  0.0000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000768348  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2257  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  26.8 
 
 
429 aa  57  0.0000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.266862 
 
 
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NC_007204  Psyc_0968  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  24.89 
 
 
474 aa  56.2  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0571313 
 
 
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NC_013595  Sros_8789  Adenosylhomocysteinase  32.98 
 
 
386 aa  56.6  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013422  Hneap_0414  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  24.81 
 
 
470 aa  56.6  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.301828  n/a   
 
 
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