More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0228 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0228  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  100 
 
 		 422 aa  826    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1485  adenosylhomocysteinase  55.11 
 
 		 417 aa  476  1e-133  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1998  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  55.64 
 
 		 416 aa  437  1e-121  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.205607  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1484  adenosylhomocysteinase  50.72 
 
 		 415 aa  424  1e-117  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3048  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  48.68 
 
 		 428 aa  410  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000864527  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1187  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  46.63 
 
 		 417 aa  404  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00223621  normal  0.0169924 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1200  adenosylhomocysteinase  47.95 
 
 		 414 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.51661  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0360  adenosylhomocysteinase  49.64 
 
 		 417 aa  398  9.999999999999999e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0965  adenosylhomocysteinase  50 
 
 		 416 aa  393  1e-108  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0649  adenosylhomocysteinase  50.24 
 
 		 417 aa  389  1e-107  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0706  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  48.68 
 
 		 417 aa  384  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0142935 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0776  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  47.9 
 
 		 404 aa  380  1e-104  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0167  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  45.32 
 
 		 415 aa  380  1e-104  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.636373 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0883  adenosylhomocysteinase  44.82 
 
 		 414 aa  379  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000768348  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1735  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  44.6 
 
 		 415 aa  379  1e-104  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0753  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  48.15 
 
 		 404 aa  379  1e-104  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1035  adenosylhomocysteinase  48.8 
 
 		 411 aa  375  1e-103  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.980475  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0727  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  44.42 
 
 		 437 aa  378  1e-103  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.107341  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1811  adenosylhomocysteinase  44.69 
 
 		 436 aa  374  1e-102  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0674  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  44.6 
 
 		 421 aa  372  1e-102  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0764  adenosylhomocysteinase  50.86 
 
 		 420 aa  373  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.812753  normal  0.114058 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2063  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  45.93 
 
 		 418 aa  373  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000172774  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0766  adenosylhomocysteinase  46.88 
 
 		 421 aa  373  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.206287 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1128  adenosylhomocysteinase  45.3 
 
 		 426 aa  374  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3251  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  47.92 
 
 		 411 aa  369  1e-101  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.234298 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1393  Adenosylhomocysteinase  49.15 
 
 		 413 aa  368  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2352  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  46.15 
 
 		 420 aa  367  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0213  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  42.93 
 
 		 415 aa  368  1e-100  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0145885  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1666  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  45.14 
 
 		 439 aa  367  1e-100  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0107908 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0211  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  45.19 
 
 		 418 aa  367  1e-100  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2168  adenosylhomocysteinase  44.12 
 
 		 415 aa  368  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000002022  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0366  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  44.93 
 
 		 418 aa  362  6e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17500  adenosylhomocysteinase  44.66 
 
 		 414 aa  360  3e-98  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.778784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4609  adenosylhomocysteinase  48.18 
 
 		 422 aa  360  3e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.382564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1547  adenosylhomocysteinase  46.19 
 
 		 403 aa  360  3e-98  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_454  S-adenosylhomocysteine hydrolase  43.54 
 
 		 418 aa  356  3.9999999999999996e-97  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000135166  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1679  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  46.33 
 
 		 437 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4055  adenosylhomocysteinase  46.79 
 
 		 420 aa  355  6.999999999999999e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0513  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  43.3 
 
 		 418 aa  355  1e-96  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00244731  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0524  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  43.1 
 
 		 421 aa  353  2e-96  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00522036  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0489  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  42.58 
 
 		 418 aa  353  2.9999999999999997e-96  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.185841  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1599  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  46.1 
 
 		 436 aa  352  5.9999999999999994e-96  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.171763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0660  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  44.72 
 
 		 408 aa  352  7e-96  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1787  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  46.1 
 
 		 436 aa  352  8e-96  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000671354 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0847  adenosylhomocysteinase  42.75 
 
 		 425 aa  350  2e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0159  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  43.71 
 
 		 420 aa  350  3e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3662  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  42.82 
 
 		 426 aa  348  7e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.253183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0147  adenosylhomocysteinase  46.68 
 
 		 429 aa  349  7e-95  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0516  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  44.72 
 
 		 442 aa  348  8e-95  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0503497  normal  0.0605456 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3564  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  43.99 
 
 		 420 aa  348  9e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.988604 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0488  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  43.47 
 
 		 431 aa  348  1e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1004  adenosylhomocysteinase  44.98 
 
 		 418 aa  347  2e-94  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1181  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  43.48 
 
 		 411 aa  347  3e-94  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1765  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  43.07 
 
 		 399 aa  345  7e-94  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2623  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  43.72 
 
 		 425 aa  345  8.999999999999999e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114233  normal  0.339873 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0905  adenosylhomocysteinase  40.96 
 
 		 413 aa  345  1e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0646  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  45.83 
 
 		 408 aa  345  1e-93  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0468936  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0136  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  42.14 
 
 		 401 aa  342  1e-92  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0756  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  46.65 
 
 		 425 aa  341  1e-92  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.43874 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1467  adenosylhomocysteinase  42.48 
 
 		 408 aa  341  1e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2366  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  42.75 
 
 		 425 aa  340  2e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1849  adenosylhomocysteinase  46.44 
 
 		 427 aa  340  2e-92  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1209  adenosylhomocysteinase  42.82 
 
 		 419 aa  340  2.9999999999999998e-92  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.971819  normal  0.0566863 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2416  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  42.75 
 
 		 425 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0618  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  44.44 
 
 		 426 aa  338  9.999999999999999e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.892985  normal  0.578524 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4402  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  43 
 
 		 428 aa  338  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000312521  normal  0.874469 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3963  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  43 
 
 		 425 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0128582  hitchhiker  0.00348944 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0567  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  44.23 
 
 		 410 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.200661 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1411  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  42.48 
 
 		 408 aa  335  1e-90  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2257  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  42.34 
 
 		 429 aa  335  1e-90  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.266862 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3754  adenosylhomocysteinase  47.23 
 
 		 420 aa  334  1e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0793  adenosylhomocysteinase  42.27 
 
 		 413 aa  334  2e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4381  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  42.27 
 
 		 429 aa  333  4e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0491549 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0059  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  44.36 
 
 		 429 aa  328  7e-89  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00179042 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1099  adenosylhomocysteinase  43.63 
 
 		 419 aa  327  2.0000000000000001e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.613377  normal  0.211169 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0673  adenosylhomocysteinase  43.17 
 
 		 418 aa  327  2.0000000000000001e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1765  adenosylhomocysteinase  44.76 
 
 		 425 aa  322  9.999999999999999e-87  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2686  adenosylhomocysteinase  43.2 
 
 		 425 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0956  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  42.16 
 
 		 408 aa  318  1e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.309777  normal  0.704835 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0617  adenosylhomocysteinase  43.49 
 
 		 432 aa  317  3e-85  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1513  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  42.26 
 
 		 425 aa  310  2e-83  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0357  adenosylhomocysteinase  39.57 
 
 		 422 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0050  adenosylhomocysteinase  47.33 
 
 		 421 aa  304  2.0000000000000002e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4355  adenosylhomocysteinase  41.65 
 
 		 419 aa  299  7e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.506408  normal  0.724655 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0964  adenosylhomocysteinase  38.46 
 
 		 413 aa  282  8.000000000000001e-75  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00139525 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1579  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  43.48 
 
 		 432 aa  269  8e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.921957  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND00240  adenosylhomocysteinase, putative  38.31 
 
 		 431 aa  253  7e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.672849  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8789  Adenosylhomocysteinase  43.34 
 
 		 386 aa  252  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2132  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  36.61 
 
 		 438 aa  251  2e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0052  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  36.61 
 
 		 434 aa  250  3e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2003  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  35.42 
 
 		 441 aa  246  6e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1998  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  35.77 
 
 		 441 aa  246  6.999999999999999e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76463  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  36.36 
 
 		 449 aa  242  7e-63  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3401  adenosylhomocysteinase  36.9 
 
 		 406 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01263  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase (Eurofung)  36.47 
 
 		 449 aa  239  9e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0454669  normal  0.150578 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4522  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  36.14 
 
 		 438 aa  238  1e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0895169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1675  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  35.41 
 
 		 430 aa  237  3e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.146428  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2679  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  36.25 
 
 		 437 aa  236  4e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.455308  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3615  adenosylhomocysteinase  35.49 
 
 		 450 aa  234  2.0000000000000002e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2392  adenosylhomocysteinase  33.04 
 
 		 470 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.499407  normal  0.234977 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>