More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3401 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_3401  adenosylhomocysteinase  100 
 
 
406 aa  842    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0211  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  44.27 
 
 
418 aa  330  2e-89  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1187  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  44.9 
 
 
417 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00223621  normal  0.0169924 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3048  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  41.75 
 
 
428 aa  325  1e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000864527  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0847  adenosylhomocysteinase  42 
 
 
425 aa  324  1e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0727  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  42.67 
 
 
437 aa  324  2e-87  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.107341  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0674  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  41.98 
 
 
421 aa  323  3e-87  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0167  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  42.93 
 
 
415 aa  321  9.999999999999999e-87  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.636373 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1004  adenosylhomocysteinase  42.86 
 
 
418 aa  319  7e-86  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0489  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  42.64 
 
 
418 aa  318  1e-85  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.185841  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0513  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  42.89 
 
 
418 aa  317  2e-85  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00244731  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0213  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  41.49 
 
 
415 aa  317  2e-85  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0145885  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_454  S-adenosylhomocysteine hydrolase  43.15 
 
 
418 aa  317  3e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000135166  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1735  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  41.65 
 
 
415 aa  316  5e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3963  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  42.25 
 
 
425 aa  313  1.9999999999999998e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0128582  hitchhiker  0.00348944 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1547  adenosylhomocysteinase  44.09 
 
 
403 aa  314  1.9999999999999998e-84  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2063  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  43.62 
 
 
418 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000172774  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0488  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  42.12 
 
 
431 aa  313  2.9999999999999996e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0524  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  41.16 
 
 
421 aa  309  5e-83  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00522036  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3662  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  40.15 
 
 
426 aa  307  2.0000000000000002e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.253183  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4055  adenosylhomocysteinase  41.43 
 
 
420 aa  307  3e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1181  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  42.67 
 
 
411 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0360  adenosylhomocysteinase  42.64 
 
 
417 aa  306  6e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0766  adenosylhomocysteinase  42.09 
 
 
421 aa  305  1.0000000000000001e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.206287 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2623  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  41.54 
 
 
425 aa  303  2.0000000000000002e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114233  normal  0.339873 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0159  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  42.17 
 
 
420 aa  303  3.0000000000000004e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1765  adenosylhomocysteinase  41.1 
 
 
425 aa  301  1e-80  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4402  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  40.59 
 
 
428 aa  301  1e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000312521  normal  0.874469 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1099  adenosylhomocysteinase  42.24 
 
 
419 aa  301  2e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.613377  normal  0.211169 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2168  adenosylhomocysteinase  40.36 
 
 
415 aa  300  3e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000002022  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1200  adenosylhomocysteinase  40.61 
 
 
414 aa  300  3e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.51661  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3754  adenosylhomocysteinase  41.07 
 
 
420 aa  299  8e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0673  adenosylhomocysteinase  41.75 
 
 
418 aa  297  2e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1393  Adenosylhomocysteinase  40.46 
 
 
413 aa  296  3e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4381  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  41.23 
 
 
429 aa  296  4e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0491549 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0649  adenosylhomocysteinase  40.71 
 
 
417 aa  296  6e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2416  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  41.79 
 
 
425 aa  296  7e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2366  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  41.54 
 
 
425 aa  295  9e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0706  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  41.9 
 
 
417 aa  295  1e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0142935 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3564  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  41.07 
 
 
420 aa  294  2e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.988604 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1128  adenosylhomocysteinase  42.16 
 
 
426 aa  294  2e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2257  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  40.46 
 
 
429 aa  294  2e-78  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.266862 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0618  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  39.31 
 
 
426 aa  292  6e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.892985  normal  0.578524 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0646  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  42.26 
 
 
408 aa  290  4e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0468936  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0965  adenosylhomocysteinase  40.61 
 
 
416 aa  289  7e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3251  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  39.95 
 
 
411 aa  289  7e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.234298 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0660  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  42.67 
 
 
408 aa  288  1e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1209  adenosylhomocysteinase  40.98 
 
 
419 aa  286  4e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.971819  normal  0.0566863 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1811  adenosylhomocysteinase  38.42 
 
 
436 aa  286  5.999999999999999e-76  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0905  adenosylhomocysteinase  38.82 
 
 
413 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0136  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  39.95 
 
 
401 aa  285  1.0000000000000001e-75  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17500  adenosylhomocysteinase  39.02 
 
 
414 aa  284  2.0000000000000002e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.778784  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0793  adenosylhomocysteinase  38.5 
 
 
413 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2686  adenosylhomocysteinase  39.2 
 
 
425 aa  282  6.000000000000001e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0366  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  39.19 
 
 
418 aa  282  9e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4609  adenosylhomocysteinase  37.53 
 
 
422 aa  282  1e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.382564  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1467  adenosylhomocysteinase  39.18 
 
 
408 aa  281  1e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1035  adenosylhomocysteinase  39.9 
 
 
411 aa  281  2e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.980475  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0776  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  41.21 
 
 
404 aa  281  2e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0764  adenosylhomocysteinase  37.95 
 
 
420 aa  280  4e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.812753  normal  0.114058 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2352  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  39.03 
 
 
420 aa  279  6e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0753  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  40.94 
 
 
404 aa  279  6e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0357  adenosylhomocysteinase  38.93 
 
 
422 aa  275  7e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0883  adenosylhomocysteinase  39.79 
 
 
414 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000768348  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1411  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  41.21 
 
 
408 aa  273  5.000000000000001e-72  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1765  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  38.12 
 
 
399 aa  271  1e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0956  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  40.53 
 
 
408 aa  271  1e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.309777  normal  0.704835 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1484  adenosylhomocysteinase  37.89 
 
 
415 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1513  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  39.79 
 
 
425 aa  267  2.9999999999999995e-70  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0756  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  39.38 
 
 
425 aa  266  4e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.43874 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1485  adenosylhomocysteinase  37.24 
 
 
417 aa  265  8.999999999999999e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1787  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  37.59 
 
 
436 aa  265  1e-69  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000671354 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1666  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  36.89 
 
 
439 aa  264  3e-69  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0107908 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0567  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  40.11 
 
 
410 aa  262  8.999999999999999e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.200661 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0617  adenosylhomocysteinase  39.21 
 
 
432 aa  262  1e-68  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1599  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  37.02 
 
 
436 aa  261  2e-68  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.171763  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0050  adenosylhomocysteinase  39.53 
 
 
421 aa  260  3e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0516  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  38.56 
 
 
442 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0503497  normal  0.0605456 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0147  adenosylhomocysteinase  37.23 
 
 
429 aa  259  5.0000000000000005e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1679  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  37.2 
 
 
437 aa  257  2e-67  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1998  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  38.36 
 
 
416 aa  250  4e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.205607  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4355  adenosylhomocysteinase  36.15 
 
 
419 aa  249  6e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.506408  normal  0.724655 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0059  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  37.91 
 
 
429 aa  245  9.999999999999999e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00179042 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1849  adenosylhomocysteinase  37.05 
 
 
427 aa  244  1.9999999999999999e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34780  S-adenosylhomocysteine hydrolase  37.87 
 
 
384 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0841132  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0964  adenosylhomocysteinase  37.3 
 
 
413 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00139525 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0228  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  36.9 
 
 
422 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1579  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  35.81 
 
 
438 aa  224  2e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0204825  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03785  S-adenosylhomocysteine hydrolase  36.61 
 
 
438 aa  223  4.9999999999999996e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.186899  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0446  Adenosylhomocysteinase  35.54 
 
 
385 aa  219  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.10935  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4338  adenosylhomocysteinase  35.2 
 
 
436 aa  219  5e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.588356  normal  0.419207 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0490  Adenosylhomocysteinase  35.01 
 
 
385 aa  219  6e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.332227 
 
 
-
 
NC_006686  CND00240  adenosylhomocysteinase, putative  36.12 
 
 
431 aa  219  7e-56  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.672849  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0610  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  35.79 
 
 
435 aa  215  9.999999999999999e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4522  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  33.17 
 
 
438 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0895169  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01263  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase (Eurofung)  35.64 
 
 
449 aa  211  2e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0454669  normal  0.150578 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1998  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  35.42 
 
 
441 aa  211  2e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3331  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  34.69 
 
 
441 aa  211  2e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.276204  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1432  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  33.98 
 
 
476 aa  211  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2003  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  35.42 
 
 
441 aa  210  4e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>