More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1998 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1998  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  100 
 
 		 416 aa  841    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.205607  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1484  adenosylhomocysteinase  59.22 
 
 		 415 aa  524  1e-147  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0965  adenosylhomocysteinase  55.72 
 
 		 416 aa  458  9.999999999999999e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1187  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.97 
 
 		 417 aa  443  1e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00223621  normal  0.0169924 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1485  adenosylhomocysteinase  53.51 
 
 		 417 aa  443  1e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0228  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  55.64 
 
 		 422 aa  440  9.999999999999999e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0649  adenosylhomocysteinase  53.88 
 
 		 417 aa  437  1e-121  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0706  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52.43 
 
 		 417 aa  429  1e-119  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0142935 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0360  adenosylhomocysteinase  51.82 
 
 		 417 aa  427  1e-118  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1128  adenosylhomocysteinase  49.88 
 
 		 426 aa  425  1e-118  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3048  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.36 
 
 		 428 aa  426  1e-118  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000864527  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2063  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.49 
 
 		 418 aa  419  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000172774  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1200  adenosylhomocysteinase  49.64 
 
 		 414 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.51661  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0883  adenosylhomocysteinase  47.93 
 
 		 414 aa  409  1e-113  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000768348  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17500  adenosylhomocysteinase  50.24 
 
 		 414 aa  405  1.0000000000000001e-112  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.778784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0753  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.87 
 
 		 404 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0211  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  49.88 
 
 		 418 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1035  adenosylhomocysteinase  49.76 
 
 		 411 aa  404  1e-111  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.980475  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0366  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  48.54 
 
 		 418 aa  401  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0776  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.37 
 
 		 404 aa  405  1e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2168  adenosylhomocysteinase  47.45 
 
 		 415 aa  396  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000002022  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0213  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  45.63 
 
 		 415 aa  396  1e-109  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0145885  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1735  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  46.36 
 
 		 415 aa  395  1e-109  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0766  adenosylhomocysteinase  47.84 
 
 		 421 aa  397  1e-109  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.206287 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0167  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  46.84 
 
 		 415 aa  396  1e-109  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.636373 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0764  adenosylhomocysteinase  51.36 
 
 		 420 aa  393  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.812753  normal  0.114058 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2257  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  45.99 
 
 		 429 aa  394  1e-108  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.266862 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1004  adenosylhomocysteinase  47.24 
 
 		 418 aa  393  1e-108  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0727  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  46.12 
 
 		 437 aa  394  1e-108  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.107341  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0793  adenosylhomocysteinase  46.34 
 
 		 413 aa  394  1e-108  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1811  adenosylhomocysteinase  46.86 
 
 		 436 aa  390  1e-107  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1393  Adenosylhomocysteinase  50.61 
 
 		 413 aa  391  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1181  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  46.59 
 
 		 411 aa  388  1e-107  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0905  adenosylhomocysteinase  44.77 
 
 		 413 aa  390  1e-107  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3662  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  46.1 
 
 		 426 aa  389  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.253183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1666  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  44.8 
 
 		 439 aa  385  1e-106  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0107908 
 
 
-
 
NC_002936  DET0513  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  43.17 
 
 		 418 aa  382  1e-105  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00244731  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2352  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  45.43 
 
 		 420 aa  383  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0674  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  45.15 
 
 		 421 aa  385  1e-105  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4055  adenosylhomocysteinase  50.24 
 
 		 420 aa  384  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_454  S-adenosylhomocysteine hydrolase  42.93 
 
 		 418 aa  379  1e-104  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000135166  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3754  adenosylhomocysteinase  50.61 
 
 		 420 aa  378  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3251  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  46.83 
 
 		 411 aa  381  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.234298 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1467  adenosylhomocysteinase  45.32 
 
 		 408 aa  380  1e-104  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0489  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  41.95 
 
 		 418 aa  378  1e-104  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.185841  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0136  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  46 
 
 		 401 aa  376  1e-103  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0147  adenosylhomocysteinase  47.77 
 
 		 429 aa  374  1e-102  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0646  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  49.13 
 
 		 408 aa  374  1e-102  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0468936  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1209  adenosylhomocysteinase  46.47 
 
 		 419 aa  372  1e-102  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.971819  normal  0.0566863 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4609  adenosylhomocysteinase  46.49 
 
 		 422 aa  375  1e-102  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.382564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1787  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  45.06 
 
 		 436 aa  372  1e-102  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000671354 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3564  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  45.5 
 
 		 420 aa  370  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.988604 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4402  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  45.61 
 
 		 428 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000312521  normal  0.874469 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0847  adenosylhomocysteinase  44.39 
 
 		 425 aa  370  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0756  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  47.58 
 
 		 425 aa  368  1e-101  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.43874 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0159  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  45.19 
 
 		 420 aa  369  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0617  adenosylhomocysteinase  45.33 
 
 		 432 aa  369  1e-101  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1547  adenosylhomocysteinase  45.02 
 
 		 403 aa  368  1e-100  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0618  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  46.59 
 
 		 426 aa  365  1e-100  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.892985  normal  0.578524 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0524  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  44.79 
 
 		 421 aa  365  1e-100  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00522036  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0488  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  44.95 
 
 		 431 aa  367  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1679  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  44.8 
 
 		 437 aa  365  1e-99  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2686  adenosylhomocysteinase  47.3 
 
 		 425 aa  363  2e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0673  adenosylhomocysteinase  44.83 
 
 		 418 aa  363  3e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0059  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  47.9 
 
 		 429 aa  362  9e-99  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00179042 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1765  adenosylhomocysteinase  46.54 
 
 		 425 aa  362  9e-99  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1411  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  44.96 
 
 		 408 aa  361  1e-98  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1849  adenosylhomocysteinase  48.27 
 
 		 427 aa  361  1e-98  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2416  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  45.12 
 
 		 425 aa  360  2e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2366  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  45.12 
 
 		 425 aa  361  2e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2623  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  45.37 
 
 		 425 aa  360  2e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114233  normal  0.339873 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0660  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  46.9 
 
 		 408 aa  359  4e-98  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1599  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  43.91 
 
 		 436 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.171763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1099  adenosylhomocysteinase  44.85 
 
 		 419 aa  358  9.999999999999999e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.613377  normal  0.211169 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4381  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  45.37 
 
 		 429 aa  356  3.9999999999999996e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0491549 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0516  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  43.22 
 
 		 442 aa  355  7.999999999999999e-97  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0503497  normal  0.0605456 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3963  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  45.12 
 
 		 425 aa  355  1e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0128582  hitchhiker  0.00348944 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1513  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  46.29 
 
 		 425 aa  355  1e-96  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1765  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  43.75 
 
 		 399 aa  351  1e-95  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0567  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  45.66 
 
 		 410 aa  350  2e-95  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.200661 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0357  adenosylhomocysteinase  42.05 
 
 		 422 aa  344  2e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0956  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  44.91 
 
 		 408 aa  342  1e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.309777  normal  0.704835 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4355  adenosylhomocysteinase  45.19 
 
 		 419 aa  338  9.999999999999999e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.506408  normal  0.724655 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1579  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  46.59 
 
 		 432 aa  332  5e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.921957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0050  adenosylhomocysteinase  42.79 
 
 		 421 aa  299  7e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0964  adenosylhomocysteinase  38.52 
 
 		 413 aa  289  5.0000000000000004e-77  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00139525 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2132  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  38.46 
 
 		 438 aa  281  1e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0052  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  38.46 
 
 		 434 aa  280  4e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1675  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  37.68 
 
 		 430 aa  271  1e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.146428  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2679  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  38.46 
 
 		 437 aa  269  7e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.455308  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18141  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  34.22 
 
 		 479 aa  263  4e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.305772  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3615  adenosylhomocysteinase  38.13 
 
 		 450 aa  262  8.999999999999999e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0610  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  37.77 
 
 		 435 aa  260  3e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3674  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  37.38 
 
 		 438 aa  260  4e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2003  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  35.66 
 
 		 441 aa  259  9e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1998  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  35.42 
 
 		 441 aa  258  2e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18171  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  34.16 
 
 		 472 aa  258  2e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3401  adenosylhomocysteinase  38.36 
 
 		 406 aa  256  7e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1579  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  37.14 
 
 		 438 aa  255  1.0000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0204825  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18351  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  33.41 
 
 		 477 aa  255  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0813931  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>