More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1787 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_1679  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  85.98 
 
 
437 aa  775    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1599  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  88.07 
 
 
436 aa  798    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.171763  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1666  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  72.83 
 
 
439 aa  661    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0107908 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1787  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  100 
 
 
436 aa  882    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000671354 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0516  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  86.21 
 
 
442 aa  782    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0503497  normal  0.0605456 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1811  adenosylhomocysteinase  63.55 
 
 
436 aa  564  1.0000000000000001e-159  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2257  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  56.95 
 
 
429 aa  507  9.999999999999999e-143  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.266862 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0617  adenosylhomocysteinase  61.93 
 
 
432 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0211  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  58.31 
 
 
418 aa  504  1e-141  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0513  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  56.91 
 
 
418 aa  491  1e-137  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00244731  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_454  S-adenosylhomocysteine hydrolase  56.68 
 
 
418 aa  488  1e-136  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000135166  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1004  adenosylhomocysteinase  56.52 
 
 
418 aa  486  1e-136  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0366  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  55.13 
 
 
418 aa  488  1e-136  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0766  adenosylhomocysteinase  55.86 
 
 
421 aa  487  1e-136  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.206287 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0489  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  56.91 
 
 
418 aa  483  1e-135  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.185841  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2352  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  56.32 
 
 
420 aa  480  1e-134  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0793  adenosylhomocysteinase  53.92 
 
 
413 aa  479  1e-134  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3564  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  56.72 
 
 
420 aa  476  1e-133  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.988604 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0159  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  55.4 
 
 
420 aa  465  9.999999999999999e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0524  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  54.52 
 
 
421 aa  464  1e-129  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00522036  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2686  adenosylhomocysteinase  55.02 
 
 
425 aa  463  1e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4055  adenosylhomocysteinase  54.57 
 
 
420 aa  463  1e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1765  adenosylhomocysteinase  54.61 
 
 
425 aa  462  1e-129  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0488  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  54.94 
 
 
431 aa  459  9.999999999999999e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0357  adenosylhomocysteinase  53.46 
 
 
422 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3048  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.46 
 
 
428 aa  456  1e-127  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000864527  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3662  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  53.72 
 
 
426 aa  455  1e-127  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.253183  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2366  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  54.02 
 
 
425 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2416  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  54.02 
 
 
425 aa  451  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0847  adenosylhomocysteinase  52.38 
 
 
425 aa  453  1.0000000000000001e-126  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1735  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.23 
 
 
415 aa  449  1e-125  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0360  adenosylhomocysteinase  50.81 
 
 
417 aa  449  1e-125  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2623  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  54.02 
 
 
425 aa  448  1e-125  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114233  normal  0.339873 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4355  adenosylhomocysteinase  54.02 
 
 
419 aa  445  1.0000000000000001e-124  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.506408  normal  0.724655 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1200  adenosylhomocysteinase  50.34 
 
 
414 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.51661  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3251  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  53.6 
 
 
411 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.234298 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1393  Adenosylhomocysteinase  53.81 
 
 
413 aa  447  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1128  adenosylhomocysteinase  50.69 
 
 
426 aa  445  1.0000000000000001e-124  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0167  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.46 
 
 
415 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.636373 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0674  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.46 
 
 
421 aa  443  1e-123  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0213  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50 
 
 
415 aa  442  1e-123  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0145885  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4381  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  53.53 
 
 
429 aa  441  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0491549 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0727  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  49.77 
 
 
437 aa  442  1e-123  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.107341  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4609  adenosylhomocysteinase  51.95 
 
 
422 aa  440  9.999999999999999e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.382564  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1209  adenosylhomocysteinase  49.89 
 
 
419 aa  435  1e-121  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.971819  normal  0.0566863 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0764  adenosylhomocysteinase  53.38 
 
 
420 aa  437  1e-121  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.812753  normal  0.114058 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0618  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.95 
 
 
426 aa  437  1e-121  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.892985  normal  0.578524 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0883  adenosylhomocysteinase  51.4 
 
 
414 aa  436  1e-121  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000768348  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1187  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.47 
 
 
417 aa  436  1e-121  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00223621  normal  0.0169924 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3963  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52.5 
 
 
425 aa  433  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0128582  hitchhiker  0.00348944 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0706  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.23 
 
 
417 aa  432  1e-120  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0142935 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0649  adenosylhomocysteinase  50.46 
 
 
417 aa  434  1e-120  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0965  adenosylhomocysteinase  50.46 
 
 
416 aa  432  1e-120  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0776  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52.97 
 
 
404 aa  433  1e-120  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0753  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52.73 
 
 
404 aa  429  1e-119  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2063  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.23 
 
 
418 aa  429  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000172774  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1181  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.12 
 
 
411 aa  430  1e-119  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4402  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52.62 
 
 
428 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000312521  normal  0.874469 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0673  adenosylhomocysteinase  51.74 
 
 
418 aa  424  1e-117  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1099  adenosylhomocysteinase  52.09 
 
 
419 aa  424  1e-117  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.613377  normal  0.211169 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17500  adenosylhomocysteinase  49.08 
 
 
414 aa  421  1e-116  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.778784  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2168  adenosylhomocysteinase  47.24 
 
 
415 aa  419  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000002022  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1035  adenosylhomocysteinase  49.07 
 
 
411 aa  420  1e-116  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.980475  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3754  adenosylhomocysteinase  51.04 
 
 
420 aa  414  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1547  adenosylhomocysteinase  48.71 
 
 
403 aa  406  1.0000000000000001e-112  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0646  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.64 
 
 
408 aa  402  1e-111  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0468936  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1467  adenosylhomocysteinase  47.09 
 
 
408 aa  400  9.999999999999999e-111  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1411  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  48.96 
 
 
408 aa  395  1e-109  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0660  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.23 
 
 
408 aa  392  1e-108  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0905  adenosylhomocysteinase  45.37 
 
 
413 aa  391  1e-107  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1485  adenosylhomocysteinase  45.03 
 
 
417 aa  385  1e-106  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0964  adenosylhomocysteinase  49.43 
 
 
413 aa  384  1e-105  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00139525 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1513  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  47.61 
 
 
425 aa  383  1e-105  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0567  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  49.07 
 
 
410 aa  384  1e-105  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.200661 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0147  adenosylhomocysteinase  47.34 
 
 
429 aa  379  1e-104  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1849  adenosylhomocysteinase  48.6 
 
 
427 aa  377  1e-103  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0956  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  49.3 
 
 
408 aa  377  1e-103  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.309777  normal  0.704835 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1484  adenosylhomocysteinase  44.65 
 
 
415 aa  372  1e-102  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0756  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  46.82 
 
 
425 aa  372  1e-102  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.43874 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0136  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  46.82 
 
 
401 aa  374  1e-102  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1765  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  46.32 
 
 
399 aa  362  6e-99  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1998  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  44.14 
 
 
416 aa  358  9.999999999999999e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.205607  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0059  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  45.69 
 
 
429 aa  357  1.9999999999999998e-97  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00179042 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0228  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  46.1 
 
 
422 aa  345  8e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3134  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  44.47 
 
 
479 aa  344  2e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3854  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  45.45 
 
 
474 aa  343  2.9999999999999997e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.612683 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0050  adenosylhomocysteinase  46.85 
 
 
421 aa  342  5.999999999999999e-93  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2679  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  45.83 
 
 
437 aa  341  2e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.455308  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1642  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  45.56 
 
 
471 aa  341  2e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2304  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  42.83 
 
 
473 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0671  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  44.89 
 
 
471 aa  339  5e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.130844  normal  0.0412083 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0161  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  43.13 
 
 
493 aa  339  5e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.716929  normal  0.0316991 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1675  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  45.83 
 
 
430 aa  338  8e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.146428  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1998  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  43.52 
 
 
441 aa  338  9e-92  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2003  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  43.52 
 
 
441 aa  338  9.999999999999999e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1548  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  44.97 
 
 
471 aa  338  9.999999999999999e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27010  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  42.98 
 
 
485 aa  337  1.9999999999999998e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.200698  normal  0.751146 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2132  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  43.52 
 
 
438 aa  337  1.9999999999999998e-91  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0763  adenosylhomocysteinase  43.82 
 
 
475 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.401892  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0052  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  43.52 
 
 
434 aa  336  5e-91  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>