More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_34780 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_34780  S-adenosylhomocysteine hydrolase  100 
 
 
384 aa  768    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0841132  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0490  Adenosylhomocysteinase  54.09 
 
 
385 aa  411  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.332227 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0446  Adenosylhomocysteinase  54.88 
 
 
385 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.10935  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0753  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  39.11 
 
 
404 aa  239  4e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0776  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  38.58 
 
 
404 aa  238  1e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1765  adenosylhomocysteinase  40.26 
 
 
425 aa  236  4e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0567  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  39.29 
 
 
410 aa  236  4e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.200661 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1187  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  37.07 
 
 
417 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00223621  normal  0.0169924 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3401  adenosylhomocysteinase  37.87 
 
 
406 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0513  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  36.81 
 
 
418 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00244731  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0211  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  36.6 
 
 
418 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_454  S-adenosylhomocysteine hydrolase  36.81 
 
 
418 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000135166  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0965  adenosylhomocysteinase  40.57 
 
 
416 aa  231  1e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0646  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  39.42 
 
 
408 aa  231  1e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0468936  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0660  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  38.42 
 
 
408 aa  227  3e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0489  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  35.7 
 
 
418 aa  227  3e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.185841  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1765  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  35.97 
 
 
399 aa  226  6e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1393  Adenosylhomocysteinase  37.76 
 
 
413 aa  224  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1411  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  37.34 
 
 
408 aa  224  1e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0764  adenosylhomocysteinase  38.54 
 
 
420 aa  223  4e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.812753  normal  0.114058 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0136  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  37.56 
 
 
401 aa  223  4e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3048  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  36.2 
 
 
428 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000864527  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1547  adenosylhomocysteinase  34.63 
 
 
403 aa  222  9.999999999999999e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3662  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  35.32 
 
 
426 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.253183  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1200  adenosylhomocysteinase  35.2 
 
 
414 aa  220  3e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.51661  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1467  adenosylhomocysteinase  34.13 
 
 
408 aa  220  3.9999999999999997e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3754  adenosylhomocysteinase  38.18 
 
 
420 aa  219  6e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0213  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  34.31 
 
 
415 aa  219  7.999999999999999e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0145885  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0674  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  34.36 
 
 
421 aa  218  1e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0673  adenosylhomocysteinase  35.13 
 
 
418 aa  218  2e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0524  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  34.83 
 
 
421 aa  217  2.9999999999999998e-55  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00522036  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4055  adenosylhomocysteinase  37.6 
 
 
420 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0366  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  35.43 
 
 
418 aa  217  2.9999999999999998e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0360  adenosylhomocysteinase  36.98 
 
 
417 aa  216  4e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17500  adenosylhomocysteinase  34.9 
 
 
414 aa  216  4e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.778784  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0727  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  34.39 
 
 
437 aa  216  5e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.107341  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1128  adenosylhomocysteinase  34.55 
 
 
426 aa  216  5e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1004  adenosylhomocysteinase  34.97 
 
 
418 aa  216  5e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0167  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  34.65 
 
 
415 aa  216  5e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.636373 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2063  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  37.4 
 
 
418 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000172774  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0905  adenosylhomocysteinase  34.47 
 
 
413 aa  215  8e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1035  adenosylhomocysteinase  36.72 
 
 
411 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.980475  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1735  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  33.59 
 
 
415 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0793  adenosylhomocysteinase  35.16 
 
 
413 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0766  adenosylhomocysteinase  35.82 
 
 
421 aa  212  9e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.206287 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1484  adenosylhomocysteinase  33.33 
 
 
415 aa  212  1e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1181  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  35.14 
 
 
411 aa  209  7e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0756  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  37.31 
 
 
425 aa  208  1e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.43874 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3564  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  36.36 
 
 
420 aa  207  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.988604 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3251  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  35.64 
 
 
411 aa  207  3e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.234298 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4355  adenosylhomocysteinase  36.72 
 
 
419 aa  207  3e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.506408  normal  0.724655 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2168  adenosylhomocysteinase  33.59 
 
 
415 aa  206  4e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000002022  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1209  adenosylhomocysteinase  35.71 
 
 
419 aa  206  8e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.971819  normal  0.0566863 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4609  adenosylhomocysteinase  36.87 
 
 
422 aa  205  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.382564  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1099  adenosylhomocysteinase  34.87 
 
 
419 aa  205  1e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.613377  normal  0.211169 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0147  adenosylhomocysteinase  35.38 
 
 
429 aa  205  1e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0847  adenosylhomocysteinase  34.19 
 
 
425 aa  204  2e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0488  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  35.32 
 
 
431 aa  204  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0956  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  35.05 
 
 
408 aa  204  3e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.309777  normal  0.704835 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0159  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  35.58 
 
 
420 aa  204  3e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0706  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  35.64 
 
 
417 aa  202  6e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0142935 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2352  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  33.77 
 
 
420 aa  202  8e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2257  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  32.8 
 
 
429 aa  202  9e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.266862 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1485  adenosylhomocysteinase  35.19 
 
 
417 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0649  adenosylhomocysteinase  37.2 
 
 
417 aa  200  3.9999999999999996e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1811  adenosylhomocysteinase  32.03 
 
 
436 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0883  adenosylhomocysteinase  32.27 
 
 
414 aa  195  1e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000768348  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2686  adenosylhomocysteinase  33.42 
 
 
425 aa  194  2e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4402  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  33.16 
 
 
428 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000312521  normal  0.874469 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1513  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  35.75 
 
 
425 aa  194  2e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1666  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  33.58 
 
 
439 aa  191  2e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0107908 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1849  adenosylhomocysteinase  35.84 
 
 
427 aa  190  4e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2416  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  34.53 
 
 
425 aa  189  7e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2366  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  34.53 
 
 
425 aa  189  8e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3963  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  33.07 
 
 
425 aa  188  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0128582  hitchhiker  0.00348944 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1787  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  34.48 
 
 
436 aa  187  2e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000671354 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4381  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  31.88 
 
 
429 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0491549 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2623  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  31.89 
 
 
425 aa  186  5e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114233  normal  0.339873 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0050  adenosylhomocysteinase  35.73 
 
 
421 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1599  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  34.24 
 
 
436 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.171763  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1998  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  34.81 
 
 
416 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.205607  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1679  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  33.09 
 
 
437 aa  182  9.000000000000001e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1579  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  38.29 
 
 
432 aa  181  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.921957  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0618  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  31.35 
 
 
426 aa  180  4e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.892985  normal  0.578524 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0617  adenosylhomocysteinase  32.48 
 
 
432 aa  180  4.999999999999999e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0059  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  34.09 
 
 
429 aa  177  2e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00179042 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0516  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  32.51 
 
 
442 aa  177  3e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0503497  normal  0.0605456 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1579  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  33.25 
 
 
438 aa  177  4e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0204825  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0357  adenosylhomocysteinase  33.51 
 
 
422 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0228  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  35.29 
 
 
422 aa  171  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03785  S-adenosylhomocysteine hydrolase  32.89 
 
 
438 aa  171  2e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.186899  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4522  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  32.8 
 
 
438 aa  167  4e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0895169  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3674  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  30.61 
 
 
438 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0610  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  30.23 
 
 
435 aa  162  9e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2679  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  31.02 
 
 
437 aa  160  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.455308  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2130  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  31.93 
 
 
432 aa  160  3e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.421073  normal  0.933423 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2132  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  31.38 
 
 
438 aa  160  3e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0052  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  31.38 
 
 
434 aa  160  3e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1675  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  30.35 
 
 
430 aa  160  3e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.146428  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2003  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  30.75 
 
 
441 aa  159  6e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>