More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0136 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0136  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  100 
 
 		 401 aa  823    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1765  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  69.52 
 
 		 399 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0776  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.17 
 
 		 404 aa  543  1e-153  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0753  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.59 
 
 		 404 aa  543  1e-153  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2168  adenosylhomocysteinase  54.68 
 
 		 415 aa  442  1e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000002022  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0883  adenosylhomocysteinase  57 
 
 		 414 aa  444  1e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000768348  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1547  adenosylhomocysteinase  53.38 
 
 		 403 aa  433  1e-120  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3048  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.25 
 
 		 428 aa  428  1e-119  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000864527  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0167  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52 
 
 		 415 aa  429  1e-119  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.636373 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1187  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  53.5 
 
 		 417 aa  431  1e-119  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00223621  normal  0.0169924 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1200  adenosylhomocysteinase  52.97 
 
 		 414 aa  431  1e-119  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.51661  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0965  adenosylhomocysteinase  50.74 
 
 		 416 aa  430  1e-119  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0706  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52.5 
 
 		 417 aa  427  1e-118  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0142935 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0727  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52 
 
 		 437 aa  426  1e-118  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.107341  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1735  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.75 
 
 		 415 aa  422  1e-117  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0213  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.37 
 
 		 415 aa  419  1e-116  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0145885  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0674  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.13 
 
 		 421 aa  415  9.999999999999999e-116  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1467  adenosylhomocysteinase  49.75 
 
 		 408 aa  417  9.999999999999999e-116  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3251  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.61 
 
 		 411 aa  414  1e-114  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.234298 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0211  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.36 
 
 		 418 aa  412  1e-114  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3662  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.75 
 
 		 426 aa  411  1e-114  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.253183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0360  adenosylhomocysteinase  49.75 
 
 		 417 aa  407  1.0000000000000001e-112  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0649  adenosylhomocysteinase  49.38 
 
 		 417 aa  407  1.0000000000000001e-112  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1181  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.37 
 
 		 411 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2063  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50 
 
 		 418 aa  402  1e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000172774  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1128  adenosylhomocysteinase  48.5 
 
 		 426 aa  402  1e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1004  adenosylhomocysteinase  49.26 
 
 		 418 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0513  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  49.25 
 
 		 418 aa  397  1e-109  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00244731  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1035  adenosylhomocysteinase  48.88 
 
 		 411 aa  398  1e-109  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.980475  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_454  S-adenosylhomocysteine hydrolase  49.25 
 
 		 418 aa  396  1e-109  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000135166  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0489  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  48.75 
 
 		 418 aa  397  1e-109  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.185841  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17500  adenosylhomocysteinase  50 
 
 		 414 aa  396  1e-109  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.778784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0793  adenosylhomocysteinase  48.25 
 
 		 413 aa  396  1e-109  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0905  adenosylhomocysteinase  50.87 
 
 		 413 aa  394  1e-108  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1393  Adenosylhomocysteinase  46.52 
 
 		 413 aa  394  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0673  adenosylhomocysteinase  49.38 
 
 		 418 aa  387  1e-106  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1765  adenosylhomocysteinase  46.96 
 
 		 425 aa  386  1e-106  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2352  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  49.14 
 
 		 420 aa  386  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3564  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  48.4 
 
 		 420 aa  385  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.988604 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0567  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  49.38 
 
 		 410 aa  386  1e-106  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.200661 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1811  adenosylhomocysteinase  48.4 
 
 		 436 aa  383  1e-105  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0660  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  48.5 
 
 		 408 aa  383  1e-105  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0366  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  45.89 
 
 		 418 aa  384  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0516  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  49.64 
 
 		 442 aa  382  1e-105  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0503497  normal  0.0605456 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1599  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  48 
 
 		 436 aa  383  1e-105  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.171763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1485  adenosylhomocysteinase  45.79 
 
 		 417 aa  379  1e-104  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1411  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  47.41 
 
 		 408 aa  379  1e-104  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0766  adenosylhomocysteinase  46.91 
 
 		 421 aa  378  1e-104  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.206287 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0524  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  48.27 
 
 		 421 aa  379  1e-104  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00522036  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1099  adenosylhomocysteinase  48.38 
 
 		 419 aa  381  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.613377  normal  0.211169 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1484  adenosylhomocysteinase  45.5 
 
 		 415 aa  378  1e-104  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0646  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  47.39 
 
 		 408 aa  380  1e-104  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0468936  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0764  adenosylhomocysteinase  45.64 
 
 		 420 aa  378  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.812753  normal  0.114058 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1679  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  47.06 
 
 		 437 aa  377  1e-103  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2623  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  47.88 
 
 		 425 aa  374  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114233  normal  0.339873 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1787  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  46.82 
 
 		 436 aa  374  1e-102  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000671354 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2686  adenosylhomocysteinase  45.95 
 
 		 425 aa  373  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0488  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  45.93 
 
 		 431 aa  368  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0159  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  46.38 
 
 		 420 aa  368  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4381  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  46.91 
 
 		 429 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0491549 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4055  adenosylhomocysteinase  44.33 
 
 		 420 aa  371  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1998  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  46 
 
 		 416 aa  369  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.205607  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3754  adenosylhomocysteinase  44.58 
 
 		 420 aa  371  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0847  adenosylhomocysteinase  44.89 
 
 		 425 aa  365  1e-100  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1666  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  46.08 
 
 		 439 aa  365  1e-100  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0107908 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4609  adenosylhomocysteinase  43.53 
 
 		 422 aa  363  2e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.382564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0618  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  45.14 
 
 		 426 aa  363  2e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.892985  normal  0.578524 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0956  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  47.77 
 
 		 408 aa  363  2e-99  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.309777  normal  0.704835 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2257  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  45.1 
 
 		 429 aa  363  3e-99  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.266862 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0147  adenosylhomocysteinase  44.09 
 
 		 429 aa  363  4e-99  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4402  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  45.89 
 
 		 428 aa  363  4e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000312521  normal  0.874469 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3963  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  46.13 
 
 		 425 aa  361  1e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0128582  hitchhiker  0.00348944 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2416  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  45.89 
 
 		 425 aa  360  3e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2366  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  45.89 
 
 		 425 aa  360  3e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0617  adenosylhomocysteinase  47 
 
 		 432 aa  357  9.999999999999999e-98  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4355  adenosylhomocysteinase  44.31 
 
 		 419 aa  357  1.9999999999999998e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.506408  normal  0.724655 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1513  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  43.56 
 
 		 425 aa  354  2e-96  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0756  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  43.35 
 
 		 425 aa  353  4e-96  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.43874 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0059  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  43.84 
 
 		 429 aa  348  7e-95  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00179042 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1849  adenosylhomocysteinase  43.92 
 
 		 427 aa  345  6e-94  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1209  adenosylhomocysteinase  43.21 
 
 		 419 aa  340  4e-92  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.971819  normal  0.0566863 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0228  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  42.14 
 
 		 422 aa  332  6e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0964  adenosylhomocysteinase  45.77 
 
 		 413 aa  329  6e-89  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00139525 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0357  adenosylhomocysteinase  44.62 
 
 		 422 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0050  adenosylhomocysteinase  43.18 
 
 		 421 aa  317  3e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3401  adenosylhomocysteinase  39.95 
 
 		 406 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4522  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  42.13 
 
 		 438 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0895169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0610  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  40 
 
 		 435 aa  282  6.000000000000001e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03785  S-adenosylhomocysteine hydrolase  41.69 
 
 		 438 aa  281  1e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.186899  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1579  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  39.41 
 
 		 432 aa  277  2e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.921957  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3615  adenosylhomocysteinase  40.25 
 
 		 450 aa  276  6e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1998  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  39.41 
 
 		 441 aa  276  6e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2003  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  39.41 
 
 		 441 aa  275  7e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4338  adenosylhomocysteinase  40.8 
 
 		 436 aa  275  7e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.588356  normal  0.419207 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2679  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  39.16 
 
 		 437 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.455308  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2392  adenosylhomocysteinase  39.14 
 
 		 470 aa  273  3e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.499407  normal  0.234977 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1675  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  38.71 
 
 		 430 aa  273  4.0000000000000004e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.146428  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2132  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  40.92 
 
 		 438 aa  272  9e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2039  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  41.13 
 
 		 442 aa  271  1e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.970546  normal  0.403341 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3674  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  40.8 
 
 		 438 aa  271  1e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>