More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0964 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0964  adenosylhomocysteinase  100 
 
 
413 aa  857    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00139525 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1811  adenosylhomocysteinase  54.07 
 
 
436 aa  457  1e-127  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1666  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.73 
 
 
439 aa  442  1e-123  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0107908 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0489  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  53 
 
 
418 aa  427  1e-118  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.185841  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_454  S-adenosylhomocysteine hydrolase  52.75 
 
 
418 aa  424  1e-117  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000135166  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2257  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.62 
 
 
429 aa  424  1e-117  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.266862 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1599  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  49.88 
 
 
436 aa  419  1e-116  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.171763  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1004  adenosylhomocysteinase  50.74 
 
 
418 aa  419  1e-116  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0513  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52 
 
 
418 aa  417  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00244731  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1679  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  49.65 
 
 
437 aa  415  9.999999999999999e-116  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0213  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  49.88 
 
 
415 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0145885  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0211  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.11 
 
 
418 aa  417  9.999999999999999e-116  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0674  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  49.64 
 
 
421 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0727  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  49.15 
 
 
437 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.107341  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1735  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  48.43 
 
 
415 aa  411  1e-114  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0524  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.23 
 
 
421 aa  414  1e-114  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00522036  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3662  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.62 
 
 
426 aa  414  1e-114  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.253183  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2686  adenosylhomocysteinase  49.88 
 
 
425 aa  414  1e-114  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0516  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.58 
 
 
442 aa  414  1e-114  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0503497  normal  0.0605456 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1787  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  49.43 
 
 
436 aa  414  1e-114  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000671354 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0167  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  48.91 
 
 
415 aa  411  1e-113  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.636373 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0617  adenosylhomocysteinase  48.46 
 
 
432 aa  410  1e-113  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1765  adenosylhomocysteinase  50.12 
 
 
425 aa  409  1e-113  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0366  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  49.88 
 
 
418 aa  407  1.0000000000000001e-112  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0883  adenosylhomocysteinase  48.27 
 
 
414 aa  402  1e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000768348  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1187  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  47.65 
 
 
417 aa  402  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00223621  normal  0.0169924 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0847  adenosylhomocysteinase  48.38 
 
 
425 aa  395  1e-109  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0706  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  45.87 
 
 
417 aa  397  1e-109  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0142935 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1128  adenosylhomocysteinase  48.02 
 
 
426 aa  397  1e-109  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2352  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  49.01 
 
 
420 aa  397  1e-109  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0766  adenosylhomocysteinase  49.39 
 
 
421 aa  394  1e-108  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.206287 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1547  adenosylhomocysteinase  48.13 
 
 
403 aa  389  1e-107  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2063  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  46.78 
 
 
418 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000172774  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0793  adenosylhomocysteinase  47.03 
 
 
413 aa  390  1e-107  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0776  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  47.01 
 
 
404 aa  386  1e-106  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0753  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  46.91 
 
 
404 aa  387  1e-106  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2623  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.37 
 
 
425 aa  386  1e-106  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114233  normal  0.339873 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0905  adenosylhomocysteinase  43.83 
 
 
413 aa  385  1e-106  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4055  adenosylhomocysteinase  45.85 
 
 
420 aa  384  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3963  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  49.13 
 
 
425 aa  380  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0128582  hitchhiker  0.00348944 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4355  adenosylhomocysteinase  46.29 
 
 
419 aa  379  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.506408  normal  0.724655 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0764  adenosylhomocysteinase  46.02 
 
 
420 aa  379  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.812753  normal  0.114058 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0673  adenosylhomocysteinase  49.03 
 
 
418 aa  379  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0360  adenosylhomocysteinase  45 
 
 
417 aa  380  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0649  adenosylhomocysteinase  44.06 
 
 
417 aa  375  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1200  adenosylhomocysteinase  44.31 
 
 
414 aa  377  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.51661  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1393  Adenosylhomocysteinase  45.95 
 
 
413 aa  376  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3048  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  43.81 
 
 
428 aa  377  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000864527  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2366  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  48.89 
 
 
425 aa  372  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3251  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  48.52 
 
 
411 aa  372  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.234298 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0159  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  46.57 
 
 
420 aa  372  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2416  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  48.89 
 
 
425 aa  372  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0965  adenosylhomocysteinase  43.34 
 
 
416 aa  372  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4402  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  48.01 
 
 
428 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000312521  normal  0.874469 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3754  adenosylhomocysteinase  46.35 
 
 
420 aa  371  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0618  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  49 
 
 
426 aa  369  1e-101  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.892985  normal  0.578524 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17500  adenosylhomocysteinase  43.92 
 
 
414 aa  370  1e-101  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.778784  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4609  adenosylhomocysteinase  44.44 
 
 
422 aa  369  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.382564  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1209  adenosylhomocysteinase  45.19 
 
 
419 aa  370  1e-101  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.971819  normal  0.0566863 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4381  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  48.15 
 
 
429 aa  368  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0491549 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1099  adenosylhomocysteinase  47.07 
 
 
419 aa  370  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.613377  normal  0.211169 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3564  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  46.32 
 
 
420 aa  367  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.988604 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0357  adenosylhomocysteinase  47.77 
 
 
422 aa  368  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2168  adenosylhomocysteinase  45.28 
 
 
415 aa  365  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000002022  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0488  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  46.06 
 
 
431 aa  367  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1181  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  46.21 
 
 
411 aa  362  7.0000000000000005e-99  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0646  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  45.07 
 
 
408 aa  361  2e-98  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0468936  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0136  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  45.77 
 
 
401 aa  359  4e-98  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1467  adenosylhomocysteinase  45.05 
 
 
408 aa  357  1.9999999999999998e-97  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1035  adenosylhomocysteinase  43.46 
 
 
411 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.980475  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1484  adenosylhomocysteinase  41.22 
 
 
415 aa  344  2e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0567  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  44.42 
 
 
410 aa  343  2e-93  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.200661 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1765  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  44.72 
 
 
399 aa  343  4e-93  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0660  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  44.67 
 
 
408 aa  340  4e-92  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1411  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  42.61 
 
 
408 aa  333  4e-90  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0956  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  42.86 
 
 
408 aa  326  5e-88  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.309777  normal  0.704835 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0147  adenosylhomocysteinase  41.98 
 
 
429 aa  324  2e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1513  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  41.94 
 
 
425 aa  323  4e-87  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1998  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  38.52 
 
 
416 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.205607  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1849  adenosylhomocysteinase  40.74 
 
 
427 aa  313  3.9999999999999997e-84  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1485  adenosylhomocysteinase  38.61 
 
 
417 aa  311  1e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0756  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  39.76 
 
 
425 aa  311  1e-83  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.43874 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0610  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  42.82 
 
 
435 aa  302  9e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0228  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  38.46 
 
 
422 aa  301  1e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0059  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  40.25 
 
 
429 aa  295  1e-78  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00179042 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1675  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  40.51 
 
 
430 aa  291  2e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.146428  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3674  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  40.94 
 
 
438 aa  286  7e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2132  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  38.86 
 
 
438 aa  285  9e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0050  adenosylhomocysteinase  38.02 
 
 
421 aa  285  9e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0052  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  38.86 
 
 
434 aa  284  2.0000000000000002e-75  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2679  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  40.53 
 
 
437 aa  282  7.000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.455308  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1998  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  36.32 
 
 
441 aa  281  1e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4338  adenosylhomocysteinase  40.49 
 
 
436 aa  281  1e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.588356  normal  0.419207 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01263  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase (Eurofung)  37.83 
 
 
449 aa  280  2e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0454669  normal  0.150578 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27010  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  37.47 
 
 
485 aa  281  2e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.200698  normal  0.751146 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2003  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  36.32 
 
 
441 aa  281  2e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3134  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  38.5 
 
 
479 aa  281  2e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03785  S-adenosylhomocysteine hydrolase  41.44 
 
 
438 aa  281  2e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.186899  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00240  adenosylhomocysteinase, putative  38.21 
 
 
431 aa  279  8e-74  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.672849  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0763  adenosylhomocysteinase  36.67 
 
 
475 aa  277  2e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.401892  normal  0.121264 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>