More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0660 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0646  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  74.51 
 
 
408 aa  638    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0468936  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0660  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  100 
 
 
408 aa  841    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0567  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  76.35 
 
 
410 aa  652    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.200661 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1411  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  69.53 
 
 
408 aa  601  1.0000000000000001e-171  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0956  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  70.59 
 
 
408 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.309777  normal  0.704835 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0147  adenosylhomocysteinase  58.97 
 
 
429 aa  506  9.999999999999999e-143  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0756  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  58.48 
 
 
425 aa  500  1e-140  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.43874 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3251  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.9 
 
 
411 aa  489  1e-137  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.234298 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1849  adenosylhomocysteinase  58.48 
 
 
427 aa  491  1e-137  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1513  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  55.99 
 
 
425 aa  479  1e-134  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1181  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  58.19 
 
 
411 aa  476  1e-133  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0674  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  57.64 
 
 
421 aa  458  9.999999999999999e-129  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0213  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  57.64 
 
 
415 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0145885  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0059  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  53.07 
 
 
429 aa  448  1e-125  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00179042 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1735  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  56.76 
 
 
415 aa  449  1e-125  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0167  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  56.76 
 
 
415 aa  448  1e-125  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.636373 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0727  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  56.51 
 
 
437 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.107341  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0211  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  54.55 
 
 
418 aa  438  9.999999999999999e-123  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1004  adenosylhomocysteinase  53.56 
 
 
418 aa  437  1e-121  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0883  adenosylhomocysteinase  54.32 
 
 
414 aa  433  1e-120  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000768348  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1393  Adenosylhomocysteinase  53.04 
 
 
413 aa  427  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1187  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  53.6 
 
 
417 aa  426  1e-118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00223621  normal  0.0169924 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0366  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  53.07 
 
 
418 aa  425  1e-118  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0764  adenosylhomocysteinase  51.71 
 
 
420 aa  423  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.812753  normal  0.114058 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0524  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52.68 
 
 
421 aa  422  1e-117  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00522036  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0776  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52.96 
 
 
404 aa  418  1e-116  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3048  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  54.09 
 
 
428 aa  418  1e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000864527  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1200  adenosylhomocysteinase  53.22 
 
 
414 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.51661  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2063  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52.83 
 
 
418 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000172774  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0753  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52.96 
 
 
404 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0965  adenosylhomocysteinase  52.23 
 
 
416 aa  412  1e-114  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1666  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.7 
 
 
439 aa  412  1e-114  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0107908 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0766  adenosylhomocysteinase  51.35 
 
 
421 aa  414  1e-114  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.206287 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0706  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52.61 
 
 
417 aa  409  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0142935 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3662  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.35 
 
 
426 aa  409  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.253183  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0360  adenosylhomocysteinase  52.35 
 
 
417 aa  409  1e-113  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2352  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.11 
 
 
420 aa  407  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4055  adenosylhomocysteinase  50.36 
 
 
420 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0649  adenosylhomocysteinase  52.61 
 
 
417 aa  407  1.0000000000000001e-112  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4609  adenosylhomocysteinase  48.65 
 
 
422 aa  403  1e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.382564  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0673  adenosylhomocysteinase  52.21 
 
 
418 aa  402  1e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1765  adenosylhomocysteinase  49.39 
 
 
425 aa  401  9.999999999999999e-111  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0905  adenosylhomocysteinase  51.6 
 
 
413 aa  401  9.999999999999999e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2168  adenosylhomocysteinase  51.12 
 
 
415 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000002022  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0488  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.12 
 
 
431 aa  398  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0357  adenosylhomocysteinase  50.98 
 
 
422 aa  398  9.999999999999999e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2686  adenosylhomocysteinase  50.73 
 
 
425 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1765  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.76 
 
 
399 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17500  adenosylhomocysteinase  52.5 
 
 
414 aa  400  9.999999999999999e-111  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.778784  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0159  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  49.63 
 
 
420 aa  395  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0489  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.23 
 
 
418 aa  396  1e-109  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.185841  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1035  adenosylhomocysteinase  49.75 
 
 
411 aa  397  1e-109  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.980475  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3754  adenosylhomocysteinase  49.5 
 
 
420 aa  395  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1811  adenosylhomocysteinase  50.98 
 
 
436 aa  394  1e-108  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1099  adenosylhomocysteinase  51.11 
 
 
419 aa  394  1e-108  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.613377  normal  0.211169 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_454  S-adenosylhomocysteine hydrolase  51.23 
 
 
418 aa  391  1e-108  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000135166  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1787  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.23 
 
 
436 aa  392  1e-108  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000671354 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1599  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  48.13 
 
 
436 aa  390  1e-107  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.171763  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0516  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50 
 
 
442 aa  389  1e-107  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0503497  normal  0.0605456 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0793  adenosylhomocysteinase  49.14 
 
 
413 aa  390  1e-107  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0513  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.49 
 
 
418 aa  385  1e-106  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00244731  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4355  adenosylhomocysteinase  49.14 
 
 
419 aa  386  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.506408  normal  0.724655 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1679  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50 
 
 
437 aa  386  1e-106  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1128  adenosylhomocysteinase  49.75 
 
 
426 aa  387  1e-106  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2257  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  49.02 
 
 
429 aa  387  1e-106  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.266862 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3564  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  47.67 
 
 
420 aa  384  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.988604 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0136  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  48.5 
 
 
401 aa  383  1e-105  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1209  adenosylhomocysteinase  49.14 
 
 
419 aa  381  1e-104  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.971819  normal  0.0566863 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1547  adenosylhomocysteinase  48.77 
 
 
403 aa  381  1e-104  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0050  adenosylhomocysteinase  49.38 
 
 
421 aa  380  1e-104  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1467  adenosylhomocysteinase  47.65 
 
 
408 aa  370  1e-101  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0847  adenosylhomocysteinase  46.93 
 
 
425 aa  367  1e-100  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1484  adenosylhomocysteinase  45.57 
 
 
415 aa  363  4e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2623  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  48.65 
 
 
425 aa  358  8e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114233  normal  0.339873 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2416  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  47.67 
 
 
425 aa  355  1e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2366  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  47.67 
 
 
425 aa  354  1e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4381  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  47.55 
 
 
429 aa  352  1e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0491549 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4402  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  47.67 
 
 
428 aa  350  4e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000312521  normal  0.874469 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1998  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  46.9 
 
 
416 aa  348  1e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.205607  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0228  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  44.47 
 
 
422 aa  347  3e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1485  adenosylhomocysteinase  45.05 
 
 
417 aa  344  2e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0617  adenosylhomocysteinase  45.48 
 
 
432 aa  342  5.999999999999999e-93  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0618  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  47.79 
 
 
426 aa  341  1e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.892985  normal  0.578524 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3963  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  46.19 
 
 
425 aa  340  2e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0128582  hitchhiker  0.00348944 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0964  adenosylhomocysteinase  44.67 
 
 
413 aa  315  9.999999999999999e-85  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00139525 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2132  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  41.65 
 
 
438 aa  288  1e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3401  adenosylhomocysteinase  42.67 
 
 
406 aa  288  1e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0052  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  41.65 
 
 
434 aa  287  2e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00240  adenosylhomocysteinase, putative  41.83 
 
 
431 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.672849  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1675  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  41.4 
 
 
430 aa  281  2e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.146428  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3615  adenosylhomocysteinase  40.78 
 
 
450 aa  278  1e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2003  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  39.9 
 
 
441 aa  277  2e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1998  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  39.65 
 
 
441 aa  276  6e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2679  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  41.4 
 
 
437 aa  275  8e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.455308  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76463  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  41.15 
 
 
449 aa  274  2.0000000000000002e-72  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03785  S-adenosylhomocysteine hydrolase  40.35 
 
 
438 aa  274  2.0000000000000002e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.186899  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2392  adenosylhomocysteinase  39.4 
 
 
470 aa  274  3e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.499407  normal  0.234977 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3331  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  41.54 
 
 
441 aa  273  5.000000000000001e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.276204  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0610  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  41.09 
 
 
435 aa  272  7e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4522  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  40.74 
 
 
438 aa  271  2e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0895169  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>