More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3674 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_2039  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  81.9 
 
 
442 aa  723    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.970546  normal  0.403341 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4522  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  78.77 
 
 
438 aa  711    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0895169  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1579  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  79.45 
 
 
438 aa  718    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0204825  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4338  adenosylhomocysteinase  81.76 
 
 
436 aa  734    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.588356  normal  0.419207 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0610  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  80.79 
 
 
435 aa  727    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3674  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  100 
 
 
438 aa  909    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03785  S-adenosylhomocysteine hydrolase  81.51 
 
 
438 aa  728    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.186899  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3615  adenosylhomocysteinase  69.84 
 
 
450 aa  610  1e-173  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2130  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  70.57 
 
 
432 aa  601  1e-170  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.421073  normal  0.933423 
 
 
-
 
NC_006686  CND00240  adenosylhomocysteinase, putative  68.76 
 
 
431 aa  594  1e-169  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.672849  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2003  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.13 
 
 
441 aa  591  1e-168  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1998  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.13 
 
 
441 aa  590  1e-167  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2679  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  68.3 
 
 
437 aa  590  1e-167  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.455308  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1228  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  70.07 
 
 
435 aa  590  1e-167  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.389132  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1675  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  69.46 
 
 
430 aa  590  1e-167  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.146428  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0671  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.27 
 
 
471 aa  581  1.0000000000000001e-165  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.130844  normal  0.0412083 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0807  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.21 
 
 
472 aa  582  1.0000000000000001e-165  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1642  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.21 
 
 
471 aa  573  1.0000000000000001e-162  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2132  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.97 
 
 
438 aa  571  1e-161  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1641  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.16 
 
 
472 aa  571  1e-161  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.148655 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0052  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.97 
 
 
434 aa  570  1e-161  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2095  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.83 
 
 
471 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3331  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.28 
 
 
441 aa  561  1.0000000000000001e-159  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.276204  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0112  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60 
 
 
478 aa  558  1e-158  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161463  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4056  adenosylhomocysteinase  60.21 
 
 
476 aa  560  1e-158  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4454  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60 
 
 
478 aa  554  1e-157  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.787736  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0314  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.68 
 
 
480 aa  553  1e-156  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0626  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.29 
 
 
481 aa  552  1e-156  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.549264  normal  0.0480596 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2505  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60 
 
 
478 aa  553  1e-156  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0349  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.68 
 
 
480 aa  554  1e-156  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.249495  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1548  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.11 
 
 
471 aa  551  1e-156  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76463  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.98 
 
 
449 aa  552  1e-156  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0903  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.37 
 
 
496 aa  548  1e-155  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4356  adenosylhomocysteinase  60.63 
 
 
485 aa  549  1e-155  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.39009  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0921  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.21 
 
 
471 aa  551  1e-155  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0763  adenosylhomocysteinase  59.92 
 
 
475 aa  546  1e-154  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.401892  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4610  adenosylhomocysteinase  59.42 
 
 
483 aa  548  1e-154  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3444  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.4 
 
 
467 aa  547  1e-154  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.893839  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3576  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.07 
 
 
465 aa  546  1e-154  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01263  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase (Eurofung)  62.98 
 
 
449 aa  544  1e-153  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0454669  normal  0.150578 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0117  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.23 
 
 
472 aa  543  1e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00161182  normal  0.625216 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4545  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.18 
 
 
469 aa  544  1e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4153  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.68 
 
 
481 aa  541  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.370152  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0966  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  58.95 
 
 
496 aa  544  1e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.161816  normal  0.729382 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2440  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.94 
 
 
469 aa  543  1e-153  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2304  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  58.92 
 
 
473 aa  543  1e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0180  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.16 
 
 
472 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0500426 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0161  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  58.28 
 
 
493 aa  538  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.716929  normal  0.0316991 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1597  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.26 
 
 
471 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2263  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.95 
 
 
470 aa  539  9.999999999999999e-153  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27010  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.37 
 
 
485 aa  541  9.999999999999999e-153  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.200698  normal  0.751146 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1392  Adenosylhomocysteinase  59.28 
 
 
475 aa  539  9.999999999999999e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.23034 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2674  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.99 
 
 
469 aa  537  1e-151  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0254  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.73 
 
 
472 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3165  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.73 
 
 
473 aa  535  1e-151  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1589  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.05 
 
 
471 aa  535  1e-151  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0163  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.33 
 
 
472 aa  537  1e-151  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.358648 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2835  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.73 
 
 
472 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.187693  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0272  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.73 
 
 
472 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.786714  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1069  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.35 
 
 
471 aa  537  1e-151  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0988998 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2842  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.52 
 
 
473 aa  531  1e-150  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01751  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.99 
 
 
476 aa  532  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3919  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.52 
 
 
473 aa  531  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2377  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.42 
 
 
485 aa  531  1e-150  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.913153  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0057  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.52 
 
 
473 aa  531  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3375  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.52 
 
 
472 aa  532  1e-150  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04338  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  58.58 
 
 
480 aa  531  1e-150  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0156  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  58.32 
 
 
491 aa  531  1e-150  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2003  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.58 
 
 
468 aa  534  1e-150  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.012931  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1701  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.52 
 
 
473 aa  531  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0163  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  58.95 
 
 
491 aa  532  1e-150  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2392  adenosylhomocysteinase  60.22 
 
 
470 aa  533  1e-150  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.499407  normal  0.234977 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3134  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.52 
 
 
473 aa  531  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2835  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.53 
 
 
461 aa  534  1e-150  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0174  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  58.95 
 
 
491 aa  532  1e-150  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3838  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.52 
 
 
473 aa  531  1e-150  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5698  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.08 
 
 
473 aa  532  1e-150  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.457969  normal  0.268273 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2918  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.16 
 
 
473 aa  532  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1432  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  58.11 
 
 
476 aa  534  1e-150  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3417  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.52 
 
 
473 aa  531  1e-150  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2015  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.85 
 
 
466 aa  529  1e-149  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.15803  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2097  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.07 
 
 
466 aa  530  1e-149  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.311406  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17511  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  58.97 
 
 
476 aa  528  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.424526  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3079  adenosylhomocysteinase  58.11 
 
 
484 aa  528  1e-149  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.439915 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0102  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.77 
 
 
476 aa  528  1e-149  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.640394  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1718  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.87 
 
 
472 aa  529  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0178  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.8 
 
 
473 aa  528  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0186  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.3 
 
 
472 aa  531  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.433145  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1198  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  57.46 
 
 
492 aa  530  1e-149  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.654496  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0822  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.07 
 
 
466 aa  530  1e-149  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0199  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.3 
 
 
472 aa  530  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.868266  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18351  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.2 
 
 
477 aa  528  1e-149  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0813931  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0741  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.96 
 
 
466 aa  525  1e-148  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.88616  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0138  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.02 
 
 
472 aa  528  1e-148  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.599517  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1514  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.58 
 
 
463 aa  526  1e-148  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0931  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.7 
 
 
468 aa  525  1e-148  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0161754 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2526  adenosylhomocysteinase  57.52 
 
 
498 aa  526  1e-148  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.127167  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3426  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.53 
 
 
462 aa  526  1e-148  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3854  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60 
 
 
474 aa  528  1e-148  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.612683 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20771  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.24 
 
 
477 aa  525  1e-148  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.215343  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>