More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2679 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



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Alignment on homolog gene

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Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1228  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  73.36 
 
 
435 aa  665    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.389132  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0138  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  68.98 
 
 
472 aa  639    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.599517  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2842  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.25 
 
 
473 aa  637    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2003  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  78.84 
 
 
441 aa  736    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1998  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  78.14 
 
 
441 aa  733    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2132  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  76.22 
 
 
438 aa  701    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3919  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.25 
 
 
473 aa  637    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3134  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.25 
 
 
473 aa  637    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0057  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.25 
 
 
473 aa  637    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2679  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  100 
 
 
437 aa  914    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.455308  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0180  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.53 
 
 
472 aa  647    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0500426 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3375  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.52 
 
 
472 aa  634    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2540  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  68.09 
 
 
479 aa  635    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3165  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.1 
 
 
473 aa  641    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1701  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.25 
 
 
473 aa  637    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2130  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  72.03 
 
 
432 aa  663    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.421073  normal  0.933423 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2918  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.39 
 
 
473 aa  640    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3005  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.46 
 
 
464 aa  652    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309685  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2835  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.74 
 
 
472 aa  642    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.187693  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0052  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  75.99 
 
 
434 aa  698    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3838  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.25 
 
 
473 aa  637    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0199  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.74 
 
 
472 aa  637    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.868266  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2263  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  70.63 
 
 
470 aa  642    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0186  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.74 
 
 
472 aa  636    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.433145  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0272  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.74 
 
 
472 aa  642    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.786714  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3331  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  77.52 
 
 
441 aa  697    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.276204  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0254  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.95 
 
 
472 aa  643    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3417  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.25 
 
 
473 aa  637    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1675  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  77.93 
 
 
430 aa  703    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.146428  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1875  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.97 
 
 
475 aa  631  1e-180  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0379318  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0093  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.31 
 
 
474 aa  629  1e-179  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3758  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.17 
 
 
473 aa  629  1e-179  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2895  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.74 
 
 
470 aa  629  1e-179  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2519  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.53 
 
 
514 aa  624  1e-178  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.595006 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0193  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.95 
 
 
470 aa  626  1e-178  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.551187  hitchhiker  0.00261817 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0178  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.17 
 
 
473 aa  627  1e-178  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0170  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.81 
 
 
472 aa  624  1e-178  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.525466  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3656  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.88 
 
 
474 aa  625  1e-178  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3333  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.24 
 
 
474 aa  627  1e-178  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1294  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.46 
 
 
476 aa  624  1e-177  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000000792408  hitchhiker  0.0000266691 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0356  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.38 
 
 
464 aa  624  1e-177  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.31829  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1346  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.88 
 
 
465 aa  620  1e-176  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0213  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.17 
 
 
472 aa  619  1e-176  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15851  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3842  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.95 
 
 
471 aa  620  1e-176  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.902922  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2392  adenosylhomocysteinase  64.69 
 
 
470 aa  619  1e-176  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.499407  normal  0.234977 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0041  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.46 
 
 
465 aa  619  1e-176  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0210952  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0186  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.24 
 
 
470 aa  617  1e-175  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2938  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.67 
 
 
465 aa  617  1e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18351  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.59 
 
 
477 aa  611  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0813931  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01751  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.09 
 
 
476 aa  611  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1718  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.77 
 
 
472 aa  609  1e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17511  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.76 
 
 
476 aa  608  1e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.424526  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0102  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.03 
 
 
476 aa  605  9.999999999999999e-173  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.640394  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5919  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.82 
 
 
476 aa  606  9.999999999999999e-173  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18171  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.24 
 
 
472 aa  604  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0119  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.1 
 
 
477 aa  607  9.999999999999999e-173  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0802054 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0807  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.71 
 
 
472 aa  601  1.0000000000000001e-171  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND00240  adenosylhomocysteinase, putative  69.3 
 
 
431 aa  602  1.0000000000000001e-171  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.672849  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1202  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.52 
 
 
477 aa  604  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1642  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.62 
 
 
471 aa  601  1.0000000000000001e-171  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0112  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.55 
 
 
478 aa  603  1.0000000000000001e-171  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161463  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20771  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.52 
 
 
477 aa  604  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.215343  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0671  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.41 
 
 
471 aa  599  1e-170  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.130844  normal  0.0412083 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1718  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.73 
 
 
481 aa  599  1e-170  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.415255  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1641  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.62 
 
 
472 aa  601  1e-170  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.148655 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4545  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.79 
 
 
469 aa  595  1e-169  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0117  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.06 
 
 
472 aa  595  1e-169  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00161182  normal  0.625216 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0146  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.33 
 
 
476 aa  596  1e-169  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1548  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.34 
 
 
471 aa  596  1e-169  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2002  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.09 
 
 
481 aa  597  1e-169  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3286  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.31 
 
 
477 aa  596  1e-169  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.19663  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4454  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.3 
 
 
478 aa  597  1e-169  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.787736  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0597  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.17 
 
 
476 aa  594  1e-169  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0618  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.38 
 
 
476 aa  595  1e-169  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.542253  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18141  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.36 
 
 
479 aa  597  1e-169  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.305772  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4522  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.83 
 
 
438 aa  592  1e-168  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0895169  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4610  adenosylhomocysteinase  61.41 
 
 
483 aa  594  1e-168  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4683  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.96 
 
 
479 aa  593  1e-168  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.355652  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4060  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.52 
 
 
475 aa  591  1e-168  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0475286  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3444  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.01 
 
 
467 aa  590  1e-167  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.893839  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4153  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.95 
 
 
481 aa  589  1e-167  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.370152  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1597  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.52 
 
 
471 aa  588  1e-167  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0186  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.44 
 
 
465 aa  588  1e-167  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.168402  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3674  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  68.3 
 
 
438 aa  590  1e-167  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1069  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.74 
 
 
471 aa  587  1e-166  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0988998 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2505  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.68 
 
 
478 aa  586  1e-166  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2377  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.27 
 
 
485 aa  585  1e-166  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.913153  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3134  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.34 
 
 
479 aa  586  1e-166  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1589  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.3 
 
 
471 aa  585  1e-166  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0741  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.88 
 
 
466 aa  585  1e-166  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.88616  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2095  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.16 
 
 
471 aa  587  1e-166  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008786  Veis_0656  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.69 
 
 
473 aa  587  1e-166  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0735979 
 
 
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NC_007498  Pcar_1924  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.18 
 
 
475 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000709982  n/a   
 
 
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NC_007948  Bpro_4132  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.46 
 
 
479 aa  582  1.0000000000000001e-165  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.901613 
 
 
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NC_007964  Nham_2752  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.55 
 
 
478 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0927232  n/a   
 
 
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NC_009485  BBta_5698  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.92 
 
 
473 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.457969  normal  0.268273 
 
 
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NC_013159  Svir_27010  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.26 
 
 
485 aa  581  1.0000000000000001e-165  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.200698  normal  0.751146 
 
 
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NC_010172  Mext_4433  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.66 
 
 
468 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.513976 
 
 
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NC_010725  Mpop_4943  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.15 
 
 
468 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0590429  normal  0.487152 
 
 
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NC_008781  Pnap_0489  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.62 
 
 
478 aa  582  1.0000000000000001e-165  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
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