More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2063 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2063  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  100 
 
 
418 aa  863    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000172774  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1187  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  78.02 
 
 
417 aa  680    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00223621  normal  0.0169924 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0649  adenosylhomocysteinase  66.02 
 
 
417 aa  584  1e-166  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0706  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.87 
 
 
417 aa  582  1.0000000000000001e-165  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0142935 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3048  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.69 
 
 
428 aa  580  1e-164  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000864527  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1200  adenosylhomocysteinase  67.07 
 
 
414 aa  576  1.0000000000000001e-163  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.51661  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2168  adenosylhomocysteinase  64.63 
 
 
415 aa  559  1e-158  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000002022  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0965  adenosylhomocysteinase  63.75 
 
 
416 aa  557  1e-157  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17500  adenosylhomocysteinase  61.52 
 
 
414 aa  539  9.999999999999999e-153  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.778784  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0674  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.05 
 
 
421 aa  531  1e-150  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1128  adenosylhomocysteinase  60.1 
 
 
426 aa  526  1e-148  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0213  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  57.38 
 
 
415 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0145885  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0167  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  57.87 
 
 
415 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.636373 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0727  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  57.63 
 
 
437 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.107341  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1735  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  57.14 
 
 
415 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0360  adenosylhomocysteinase  58.64 
 
 
417 aa  516  1.0000000000000001e-145  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0883  adenosylhomocysteinase  57.8 
 
 
414 aa  509  1e-143  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000768348  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0513  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  56.22 
 
 
418 aa  498  1e-140  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00244731  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_454  S-adenosylhomocysteine hydrolase  56.7 
 
 
418 aa  499  1e-140  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000135166  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0489  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  55.74 
 
 
418 aa  499  1e-140  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.185841  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1181  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  57.73 
 
 
411 aa  497  1e-139  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1004  adenosylhomocysteinase  55.02 
 
 
418 aa  496  1e-139  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3251  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  57.95 
 
 
411 aa  487  1e-136  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.234298 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0211  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  55.88 
 
 
418 aa  484  1e-136  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0766  adenosylhomocysteinase  54.44 
 
 
421 aa  472  1e-132  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.206287 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3662  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  54.11 
 
 
426 aa  468  9.999999999999999e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.253183  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1666  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52.62 
 
 
439 aa  465  9.999999999999999e-131  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0107908 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0753  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  55.11 
 
 
404 aa  463  1e-129  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4609  adenosylhomocysteinase  51.91 
 
 
422 aa  461  1e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.382564  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0776  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  55.11 
 
 
404 aa  463  1e-129  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0366  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52.28 
 
 
418 aa  461  9.999999999999999e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4055  adenosylhomocysteinase  53.01 
 
 
420 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1811  adenosylhomocysteinase  51.68 
 
 
436 aa  456  1e-127  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1035  adenosylhomocysteinase  55.37 
 
 
411 aa  456  1e-127  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.980475  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0793  adenosylhomocysteinase  52.06 
 
 
413 aa  455  1e-127  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2352  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52.04 
 
 
420 aa  455  1e-127  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1467  adenosylhomocysteinase  54.07 
 
 
408 aa  456  1e-127  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3564  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.44 
 
 
420 aa  449  1e-125  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.988604 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0488  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.56 
 
 
431 aa  450  1e-125  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0524  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  53.1 
 
 
421 aa  450  1e-125  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00522036  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1484  adenosylhomocysteinase  51.71 
 
 
415 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2686  adenosylhomocysteinase  51.2 
 
 
425 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1547  adenosylhomocysteinase  54.95 
 
 
403 aa  447  1.0000000000000001e-124  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0617  adenosylhomocysteinase  50.47 
 
 
432 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0159  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.84 
 
 
420 aa  443  1e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1393  Adenosylhomocysteinase  52.18 
 
 
413 aa  442  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0847  adenosylhomocysteinase  51.69 
 
 
425 aa  444  1e-123  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1765  adenosylhomocysteinase  52.96 
 
 
425 aa  443  1e-123  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1599  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.46 
 
 
436 aa  444  1e-123  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.171763  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2257  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  49.88 
 
 
429 aa  444  1e-123  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.266862 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0764  adenosylhomocysteinase  50.97 
 
 
420 aa  438  9.999999999999999e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.812753  normal  0.114058 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4381  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52.64 
 
 
429 aa  441  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0491549 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1679  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.57 
 
 
437 aa  439  9.999999999999999e-123  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0516  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  48.97 
 
 
442 aa  438  9.999999999999999e-123  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0503497  normal  0.0605456 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3754  adenosylhomocysteinase  50.84 
 
 
420 aa  439  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1787  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.23 
 
 
436 aa  438  1e-121  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000671354 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0567  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  54.3 
 
 
410 aa  436  1e-121  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.200661 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2366  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.2 
 
 
425 aa  429  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0646  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.96 
 
 
408 aa  430  1e-119  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0468936  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2416  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.2 
 
 
425 aa  428  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1485  adenosylhomocysteinase  51.21 
 
 
417 aa  431  1e-119  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3963  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.93 
 
 
425 aa  427  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0128582  hitchhiker  0.00348944 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0618  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.44 
 
 
426 aa  426  1e-118  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.892985  normal  0.578524 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0905  adenosylhomocysteinase  49.39 
 
 
413 aa  427  1e-118  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0660  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  53.07 
 
 
408 aa  424  1e-117  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1209  adenosylhomocysteinase  48.68 
 
 
419 aa  419  1e-116  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.971819  normal  0.0566863 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4355  adenosylhomocysteinase  50.36 
 
 
419 aa  418  1e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.506408  normal  0.724655 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1411  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.24 
 
 
408 aa  418  9.999999999999999e-116  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2623  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.48 
 
 
425 aa  418  9.999999999999999e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114233  normal  0.339873 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4402  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.32 
 
 
428 aa  417  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000312521  normal  0.874469 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1513  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.23 
 
 
425 aa  416  9.999999999999999e-116  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0673  adenosylhomocysteinase  50.24 
 
 
418 aa  415  9.999999999999999e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1998  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.36 
 
 
416 aa  414  1e-114  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.205607  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1765  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.89 
 
 
399 aa  409  1e-113  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0756  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.6 
 
 
425 aa  411  1e-113  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.43874 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0956  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52.32 
 
 
408 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.309777  normal  0.704835 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0136  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50 
 
 
401 aa  407  1.0000000000000001e-112  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1099  adenosylhomocysteinase  50.6 
 
 
419 aa  407  1.0000000000000001e-112  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.613377  normal  0.211169 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0147  adenosylhomocysteinase  49.63 
 
 
429 aa  405  1.0000000000000001e-112  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0357  adenosylhomocysteinase  47.71 
 
 
422 aa  404  1e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0059  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.84 
 
 
429 aa  400  9.999999999999999e-111  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00179042 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1849  adenosylhomocysteinase  48.89 
 
 
427 aa  396  1e-109  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0228  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  45.93 
 
 
422 aa  373  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0964  adenosylhomocysteinase  46.78 
 
 
413 aa  369  1e-101  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00139525 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0050  adenosylhomocysteinase  47.06 
 
 
421 aa  348  9e-95  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00240  adenosylhomocysteinase, putative  43.03 
 
 
431 aa  327  3e-88  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.672849  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3331  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  43.48 
 
 
441 aa  319  6e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.276204  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3401  adenosylhomocysteinase  43.62 
 
 
406 aa  318  1e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01263  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase (Eurofung)  42.39 
 
 
449 aa  318  2e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0454669  normal  0.150578 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1998  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  40.48 
 
 
441 aa  317  2e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76463  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  42.52 
 
 
449 aa  317  2e-85  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2003  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  40.48 
 
 
441 aa  317  3e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0610  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  42.58 
 
 
435 aa  317  3e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1675  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  42.62 
 
 
430 aa  316  4e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.146428  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3615  adenosylhomocysteinase  41.84 
 
 
450 aa  314  1.9999999999999998e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2679  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  42.13 
 
 
437 aa  310  2e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.455308  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2132  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  40.58 
 
 
438 aa  309  5.9999999999999995e-83  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2392  adenosylhomocysteinase  40.44 
 
 
470 aa  309  6.999999999999999e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.499407  normal  0.234977 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0052  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  40.58 
 
 
434 aa  308  2.0000000000000002e-82  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2039  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  41.69 
 
 
442 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.970546  normal  0.403341 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>