More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_454 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0513  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  97.85 
 
 
418 aa  846    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00244731  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_454  S-adenosylhomocysteine hydrolase  100 
 
 
418 aa  861    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000135166  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0489  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  95.45 
 
 
418 aa  832    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.185841  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0766  adenosylhomocysteinase  64.99 
 
 
421 aa  572  1.0000000000000001e-162  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.206287 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3564  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.75 
 
 
420 aa  565  1e-160  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.988604 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0366  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.38 
 
 
418 aa  566  1e-160  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3662  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.34 
 
 
426 aa  561  1.0000000000000001e-159  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.253183  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0793  adenosylhomocysteinase  63.44 
 
 
413 aa  558  1e-158  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2352  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.31 
 
 
420 aa  559  1e-158  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0211  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.94 
 
 
418 aa  558  1e-158  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0488  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.07 
 
 
431 aa  557  1e-157  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0159  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.83 
 
 
420 aa  551  1e-156  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1004  adenosylhomocysteinase  63.44 
 
 
418 aa  546  1e-154  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4055  adenosylhomocysteinase  61.67 
 
 
420 aa  535  1e-151  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0524  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.43 
 
 
421 aa  536  1e-151  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00522036  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0618  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.87 
 
 
426 aa  537  1e-151  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.892985  normal  0.578524 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1765  adenosylhomocysteinase  61.47 
 
 
425 aa  529  1e-149  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0847  adenosylhomocysteinase  59.76 
 
 
425 aa  530  1e-149  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4402  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.17 
 
 
428 aa  525  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000312521  normal  0.874469 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2623  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.3 
 
 
425 aa  525  1e-148  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114233  normal  0.339873 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3963  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.72 
 
 
425 aa  516  1.0000000000000001e-145  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0128582  hitchhiker  0.00348944 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2366  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.82 
 
 
425 aa  517  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4381  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.78 
 
 
429 aa  517  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0491549 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2416  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.82 
 
 
425 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1209  adenosylhomocysteinase  59.42 
 
 
419 aa  510  1e-143  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.971819  normal  0.0566863 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1666  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  58.09 
 
 
439 aa  506  9.999999999999999e-143  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0107908 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1187  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  58.21 
 
 
417 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00223621  normal  0.0169924 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1811  adenosylhomocysteinase  58.03 
 
 
436 aa  501  1e-141  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3048  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  56.83 
 
 
428 aa  497  1e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000864527  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4609  adenosylhomocysteinase  54.78 
 
 
422 aa  496  1e-139  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.382564  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1393  Adenosylhomocysteinase  58.5 
 
 
413 aa  497  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2063  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  56.7 
 
 
418 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000172774  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0706  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  56.63 
 
 
417 aa  493  9.999999999999999e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0142935 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1200  adenosylhomocysteinase  57.21 
 
 
414 aa  493  9.999999999999999e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.51661  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1599  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  56.68 
 
 
436 aa  491  9.999999999999999e-139  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.171763  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1128  adenosylhomocysteinase  56.23 
 
 
426 aa  487  1e-136  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1787  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  56.68 
 
 
436 aa  488  1e-136  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000671354 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1679  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  55.13 
 
 
437 aa  483  1e-135  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0674  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  55.93 
 
 
421 aa  483  1e-135  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0764  adenosylhomocysteinase  57.49 
 
 
420 aa  484  1e-135  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.812753  normal  0.114058 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0213  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  54.24 
 
 
415 aa  479  1e-134  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0145885  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0516  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  54.9 
 
 
442 aa  478  1e-134  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0503497  normal  0.0605456 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0673  adenosylhomocysteinase  58.05 
 
 
418 aa  480  1e-134  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1099  adenosylhomocysteinase  57.46 
 
 
419 aa  476  1e-133  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.613377  normal  0.211169 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3754  adenosylhomocysteinase  55.64 
 
 
420 aa  472  1e-132  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0167  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  54.24 
 
 
415 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.636373 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0649  adenosylhomocysteinase  54.59 
 
 
417 aa  471  1.0000000000000001e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1735  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  53.51 
 
 
415 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0727  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  54 
 
 
437 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.107341  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2257  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  54.44 
 
 
429 aa  470  1.0000000000000001e-131  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.266862 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2168  adenosylhomocysteinase  53.28 
 
 
415 aa  465  9.999999999999999e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000002022  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0965  adenosylhomocysteinase  52.68 
 
 
416 aa  465  9.999999999999999e-131  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3251  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  56.05 
 
 
411 aa  464  1e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.234298 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2686  adenosylhomocysteinase  54.07 
 
 
425 aa  461  1e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0883  adenosylhomocysteinase  55.12 
 
 
414 aa  460  9.999999999999999e-129  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000768348  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0360  adenosylhomocysteinase  54.11 
 
 
417 aa  457  1e-127  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0357  adenosylhomocysteinase  52.16 
 
 
422 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1181  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  53.38 
 
 
411 aa  448  1e-125  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0617  adenosylhomocysteinase  53.74 
 
 
432 aa  449  1e-125  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1547  adenosylhomocysteinase  53.22 
 
 
403 aa  445  1.0000000000000001e-124  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17500  adenosylhomocysteinase  52.21 
 
 
414 aa  440  9.999999999999999e-123  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.778784  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0776  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.37 
 
 
404 aa  436  1e-121  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1035  adenosylhomocysteinase  53.28 
 
 
411 aa  435  1e-121  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.980475  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4355  adenosylhomocysteinase  51.68 
 
 
419 aa  434  1e-120  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.506408  normal  0.724655 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0753  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.37 
 
 
404 aa  434  1e-120  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1467  adenosylhomocysteinase  50.25 
 
 
408 aa  429  1e-119  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0567  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  53.68 
 
 
410 aa  424  1e-117  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.200661 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0756  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.12 
 
 
425 aa  405  1.0000000000000001e-112  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.43874 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0905  adenosylhomocysteinase  47.07 
 
 
413 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1484  adenosylhomocysteinase  45.1 
 
 
415 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1765  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.62 
 
 
399 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1411  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.25 
 
 
408 aa  395  1e-109  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0147  adenosylhomocysteinase  47.67 
 
 
429 aa  395  1e-109  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0136  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  49.25 
 
 
401 aa  396  1e-109  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1849  adenosylhomocysteinase  48.89 
 
 
427 aa  392  1e-108  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0956  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.86 
 
 
408 aa  393  1e-108  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.309777  normal  0.704835 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0964  adenosylhomocysteinase  52.75 
 
 
413 aa  393  1e-108  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00139525 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0660  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.23 
 
 
408 aa  391  1e-107  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0646  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  49.02 
 
 
408 aa  384  1e-105  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0468936  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1513  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  48.17 
 
 
425 aa  384  1e-105  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0059  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  47.91 
 
 
429 aa  382  1e-105  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00179042 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1485  adenosylhomocysteinase  43.9 
 
 
417 aa  370  1e-101  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1998  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  42.93 
 
 
416 aa  370  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.205607  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0228  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  43.54 
 
 
422 aa  350  2e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0050  adenosylhomocysteinase  45.48 
 
 
421 aa  344  2e-93  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2679  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  44.07 
 
 
437 aa  332  8e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.455308  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1675  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  43.34 
 
 
430 aa  330  2e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.146428  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2003  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  42.17 
 
 
441 aa  328  8e-89  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1998  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  42.17 
 
 
441 aa  328  9e-89  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0610  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  44.17 
 
 
435 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND00240  adenosylhomocysteinase, putative  43.27 
 
 
431 aa  325  1e-87  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.672849  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3331  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  43 
 
 
441 aa  322  7e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.276204  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3615  adenosylhomocysteinase  45.15 
 
 
450 aa  318  1e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3401  adenosylhomocysteinase  43.15 
 
 
406 aa  317  3e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1924  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  41.37 
 
 
475 aa  315  9e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000709982  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2132  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  41.29 
 
 
438 aa  314  1.9999999999999998e-84  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0052  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  41.29 
 
 
434 aa  313  3.9999999999999997e-84  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76463  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  42.17 
 
 
449 aa  311  1e-83  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1579  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  42.75 
 
 
438 aa  310  2e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0204825  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2392  adenosylhomocysteinase  41.03 
 
 
470 aa  310  4e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.499407  normal  0.234977 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>