More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1432 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6751  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.51 
 
 
486 aa  667    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3102  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  71.49 
 
 
491 aa  709    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0285183  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2526  adenosylhomocysteinase  68.16 
 
 
498 aa  672    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.127167  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0161  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.92 
 
 
493 aa  677    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.716929  normal  0.0316991 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2505  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  78.41 
 
 
478 aa  783    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4717  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  69.18 
 
 
486 aa  683    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.149663 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4056  adenosylhomocysteinase  75.47 
 
 
476 aa  764    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0763  adenosylhomocysteinase  74.84 
 
 
475 aa  750    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.401892  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4356  adenosylhomocysteinase  74.16 
 
 
485 aa  748    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.39009  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4075  adenosylhomocysteinase  65.24 
 
 
512 aa  638    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.437105  normal  0.0365971 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6321  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  71.49 
 
 
490 aa  710    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.598676  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1269  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  69.11 
 
 
492 aa  688    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000838657 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3838  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  69.53 
 
 
487 aa  665    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.646938  normal  0.0268466 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0156  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.44 
 
 
491 aa  675    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2095  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.23 
 
 
471 aa  641    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4454  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  75.05 
 
 
478 aa  754    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.787736  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1192  adenosylhomocysteinase  70.08 
 
 
488 aa  684    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05310  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  68.42 
 
 
519 aa  672    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0807  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.11 
 
 
472 aa  635    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1392  Adenosylhomocysteinase  76.52 
 
 
475 aa  764    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.23034 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1837  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  69.42 
 
 
494 aa  678    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.739236 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4610  adenosylhomocysteinase  74.53 
 
 
483 aa  743    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13277  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  69.25 
 
 
495 aa  691    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.85823  normal  0.713037 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3640  adenosylhomocysteinase  70.65 
 
 
489 aa  700    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4257  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  70.27 
 
 
498 aa  701    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.892606  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1336  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  70.38 
 
 
489 aa  694    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3755  adenosylhomocysteinase  74.84 
 
 
478 aa  738    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.281872  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0903  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  74.95 
 
 
496 aa  746    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7602  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  74.11 
 
 
485 aa  732    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.588423 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0112  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  75.26 
 
 
478 aa  761    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161463  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0174  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  68.28 
 
 
491 aa  683    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1372  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  70.59 
 
 
489 aa  695    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.815282  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1198  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  69.51 
 
 
492 aa  689    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.654496  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0966  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  73.89 
 
 
496 aa  741    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.161816  normal  0.729382 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0468  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  76.73 
 
 
476 aa  744    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.682945 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1234  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.27 
 
 
512 aa  657    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.217111  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1432  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  100 
 
 
476 aa  986    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1354  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  70.38 
 
 
489 aa  694    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.483366  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1746  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  70.38 
 
 
485 aa  697    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.916125 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09210  adenosylhomocysteinase  68.69 
 
 
506 aa  679    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.53378  normal  0.263004 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0163  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  68.28 
 
 
491 aa  683    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3079  adenosylhomocysteinase  67.92 
 
 
484 aa  676    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.439915 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4286  adenosylhomocysteinase  71.43 
 
 
495 aa  696    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.285488  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27010  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  73.17 
 
 
485 aa  712    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.200698  normal  0.751146 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1642  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.34 
 
 
471 aa  635    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1641  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.85 
 
 
472 aa  629  1e-179  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.148655 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1548  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.82 
 
 
471 aa  629  1e-179  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3005  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.05 
 
 
464 aa  629  1e-179  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309685  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3134  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.66 
 
 
479 aa  621  1e-177  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0138  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.74 
 
 
472 aa  618  1e-176  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.599517  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0671  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.19 
 
 
471 aa  620  1e-176  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.130844  normal  0.0412083 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1736  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.61 
 
 
496 aa  616  1e-175  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.235533  hitchhiker  0.00421364 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0822  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.05 
 
 
466 aa  615  1e-175  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0186  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.68 
 
 
465 aa  617  1e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.168402  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3576  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.23 
 
 
465 aa  615  1e-175  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2097  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.42 
 
 
466 aa  612  9.999999999999999e-175  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.311406  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0741  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.44 
 
 
466 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.88616  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1294  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.85 
 
 
476 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000000792408  hitchhiker  0.0000266691 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0039  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.79 
 
 
473 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3854  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.14 
 
 
474 aa  612  9.999999999999999e-175  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.612683 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3247  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.76 
 
 
466 aa  611  9.999999999999999e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3964  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.55 
 
 
466 aa  611  9.999999999999999e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2015  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.21 
 
 
466 aa  611  1e-173  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.15803  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1875  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.23 
 
 
475 aa  608  1e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0379318  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0117  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64 
 
 
472 aa  610  1e-173  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00161182  normal  0.625216 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2540  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.8 
 
 
479 aa  608  1e-173  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2938  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.05 
 
 
465 aa  608  1e-173  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1346  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.84 
 
 
465 aa  608  1e-173  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4545  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.87 
 
 
469 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2918  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.79 
 
 
473 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3444  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.36 
 
 
467 aa  604  9.999999999999999e-173  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.893839  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0049  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.21 
 
 
509 aa  604  9.999999999999999e-173  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1597  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.44 
 
 
471 aa  604  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1604  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.71 
 
 
468 aa  606  9.999999999999999e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177686  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0041  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.63 
 
 
465 aa  606  9.999999999999999e-173  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0210952  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4291  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.34 
 
 
466 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0499  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.71 
 
 
468 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248655 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3134  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.16 
 
 
473 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0199  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.74 
 
 
472 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.868266  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2842  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.16 
 
 
473 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4897  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.45 
 
 
468 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2895  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.81 
 
 
470 aa  601  1.0000000000000001e-171  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0057  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.16 
 
 
473 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3838  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.16 
 
 
473 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3165  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.16 
 
 
473 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3919  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.16 
 
 
473 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1701  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.16 
 
 
473 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0254  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.95 
 
 
472 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2752  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.02 
 
 
478 aa  602  1.0000000000000001e-171  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0927232  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2835  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.95 
 
 
472 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.187693  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0186  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.74 
 
 
472 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.433145  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0272  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.95 
 
 
472 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.786714  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2964  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.05 
 
 
463 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.317218  normal  0.0707693 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4433  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.45 
 
 
468 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.513976 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0921  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.35 
 
 
471 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0180  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.74 
 
 
472 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0500426 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3417  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.16 
 
 
473 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3375  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.74 
 
 
472 aa  601  1e-170  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4943  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.24 
 
 
468 aa  600  1e-170  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0590429  normal  0.487152 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2304  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.39 
 
 
473 aa  600  1e-170  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>