More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3755 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_09210  adenosylhomocysteinase  71.98 
 
 
506 aa  713    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.53378  normal  0.263004 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0966  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  79.16 
 
 
496 aa  776    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.161816  normal  0.729382 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3102  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  75.84 
 
 
491 aa  741    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0285183  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0763  adenosylhomocysteinase  77.52 
 
 
475 aa  773    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.401892  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1269  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  75.05 
 
 
492 aa  746    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000838657 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05310  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  74.49 
 
 
519 aa  734    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2505  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  83.05 
 
 
478 aa  824    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4056  adenosylhomocysteinase  79.62 
 
 
476 aa  788    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1234  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  71.89 
 
 
512 aa  698    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.217111  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3838  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  75.2 
 
 
487 aa  726    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.646938  normal  0.0268466 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3079  adenosylhomocysteinase  74.58 
 
 
484 aa  731    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.439915 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3755  adenosylhomocysteinase  100 
 
 
478 aa  983    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.281872  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6321  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  75.63 
 
 
490 aa  740    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.598676  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2526  adenosylhomocysteinase  74.08 
 
 
498 aa  728    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.127167  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0156  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  70.17 
 
 
491 aa  688    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4286  adenosylhomocysteinase  74.07 
 
 
495 aa  716    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.285488  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4454  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  77.82 
 
 
478 aa  783    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.787736  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1392  Adenosylhomocysteinase  78.36 
 
 
475 aa  785    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.23034 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7602  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  76.62 
 
 
485 aa  748    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.588423 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1372  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  72.9 
 
 
489 aa  706    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.815282  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4610  adenosylhomocysteinase  77.68 
 
 
483 aa  772    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13277  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  71.13 
 
 
495 aa  695    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.85823  normal  0.713037 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6751  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  72.78 
 
 
486 aa  716    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27010  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  76.89 
 
 
485 aa  744    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.200698  normal  0.751146 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1192  adenosylhomocysteinase  72.59 
 
 
488 aa  699    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1837  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  72.52 
 
 
494 aa  713    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.739236 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3640  adenosylhomocysteinase  73.38 
 
 
489 aa  712    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1336  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  72.69 
 
 
489 aa  705    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4717  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  71.91 
 
 
486 aa  694    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.149663 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0174  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  69.75 
 
 
491 aa  685    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0161  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  69.89 
 
 
493 aa  683    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.716929  normal  0.0316991 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1198  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  74.44 
 
 
492 aa  739    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.654496  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0163  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  69.75 
 
 
491 aa  685    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4257  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  71.61 
 
 
498 aa  704    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.892606  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0468  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  76.89 
 
 
476 aa  739    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.682945 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0903  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  78.74 
 
 
496 aa  766    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1432  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  74.84 
 
 
476 aa  738    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1354  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  72.69 
 
 
489 aa  705    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.483366  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1746  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  72.69 
 
 
485 aa  706    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.916125 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0112  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  77.62 
 
 
478 aa  781    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161463  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4356  adenosylhomocysteinase  76.1 
 
 
485 aa  765    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.39009  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4075  adenosylhomocysteinase  64.21 
 
 
512 aa  611  9.999999999999999e-175  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.437105  normal  0.0365971 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3134  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.13 
 
 
479 aa  608  1e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2304  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.39 
 
 
473 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0807  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.39 
 
 
472 aa  598  1e-170  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18319  adenosylhomocysteinase  61.81 
 
 
481 aa  595  1e-169  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.476955  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0039  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.67 
 
 
473 aa  597  1e-169  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1736  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.32 
 
 
496 aa  598  1e-169  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.235533  hitchhiker  0.00421364 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1641  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.84 
 
 
472 aa  593  1e-168  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.148655 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2301  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.26 
 
 
473 aa  593  1e-168  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1642  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.43 
 
 
471 aa  588  1e-167  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3964  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.79 
 
 
466 aa  585  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0671  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.59 
 
 
471 aa  582  1.0000000000000001e-165  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.130844  normal  0.0412083 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2580  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.73 
 
 
479 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1548  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.22 
 
 
471 aa  581  1e-164  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2095  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.34 
 
 
471 aa  579  1e-164  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34856  predicted protein  62.16 
 
 
482 aa  580  1e-164  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0352845  normal  0.14171 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3576  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.05 
 
 
465 aa  580  1e-164  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4291  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.37 
 
 
466 aa  580  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2347  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.41 
 
 
479 aa  580  1e-164  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.142273  normal  0.0154508 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0314  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.54 
 
 
480 aa  579  1e-164  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0822  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.95 
 
 
466 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3005  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.46 
 
 
464 aa  576  1.0000000000000001e-163  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309685  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0349  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.33 
 
 
480 aa  577  1.0000000000000001e-163  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.249495  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2097  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.53 
 
 
466 aa  571  1.0000000000000001e-162  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.311406  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2003  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.63 
 
 
441 aa  572  1.0000000000000001e-162  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1998  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.42 
 
 
441 aa  571  1.0000000000000001e-162  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0049  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.74 
 
 
509 aa  572  1.0000000000000001e-162  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0186  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.72 
 
 
465 aa  571  1.0000000000000001e-162  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.168402  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3854  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.34 
 
 
474 aa  572  1.0000000000000001e-162  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.612683 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18351  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.42 
 
 
477 aa  572  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0813931  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2015  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.32 
 
 
466 aa  571  1e-161  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.15803  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0102  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.51 
 
 
476 aa  569  1e-161  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.640394  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3247  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.53 
 
 
466 aa  571  1e-161  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2682  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.08 
 
 
463 aa  569  1e-161  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01751  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.39 
 
 
476 aa  571  1e-161  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5919  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.5 
 
 
476 aa  568  1e-161  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18141  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.42 
 
 
479 aa  569  1e-161  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.305772  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0138  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.47 
 
 
472 aa  566  1e-160  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.599517  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1069  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.04 
 
 
471 aa  566  1e-160  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0988998 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1718  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.42 
 
 
472 aa  566  1e-160  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2835  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.67 
 
 
461 aa  565  1e-160  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18171  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.55 
 
 
472 aa  565  1e-160  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0041  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.92 
 
 
465 aa  567  1e-160  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0210952  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0921  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.76 
 
 
471 aa  567  1e-160  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17511  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.71 
 
 
476 aa  566  1e-160  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.424526  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1875  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.21 
 
 
475 aa  561  1.0000000000000001e-159  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0379318  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0119  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.08 
 
 
477 aa  563  1.0000000000000001e-159  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0802054 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2842  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.75 
 
 
473 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0057  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.75 
 
 
473 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0146  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.05 
 
 
476 aa  564  1.0000000000000001e-159  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3919  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.75 
 
 
473 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3165  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.75 
 
 
473 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1701  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.75 
 
 
473 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0193  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.26 
 
 
470 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.551187  hitchhiker  0.00261817 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3838  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.75 
 
 
473 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3333  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.46 
 
 
474 aa  561  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2918  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.42 
 
 
473 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0117  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60 
 
 
472 aa  563  1.0000000000000001e-159  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00161182  normal  0.625216 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3417  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.75 
 
 
473 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>