More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1198 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4257  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  69.03 
 
 
498 aa  687    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.892606  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09210  adenosylhomocysteinase  75.3 
 
 
506 aa  747    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.53378  normal  0.263004 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4286  adenosylhomocysteinase  69.12 
 
 
495 aa  677    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.285488  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3079  adenosylhomocysteinase  72.51 
 
 
484 aa  719    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.439915 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3838  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  72.62 
 
 
487 aa  709    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.646938  normal  0.0268466 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2505  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  74.24 
 
 
478 aa  739    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7602  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  72.86 
 
 
485 aa  711    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.588423 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4356  adenosylhomocysteinase  73.27 
 
 
485 aa  729    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.39009  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3755  adenosylhomocysteinase  74.44 
 
 
478 aa  739    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.281872  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3102  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  72.51 
 
 
491 aa  726    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0285183  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1392  Adenosylhomocysteinase  71.49 
 
 
475 aa  718    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.23034 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1269  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  93.5 
 
 
492 aa  958    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000838657 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4717  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.68 
 
 
486 aa  664    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.149663 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0763  adenosylhomocysteinase  72.1 
 
 
475 aa  718    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.401892  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05310  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  80.93 
 
 
519 aa  820    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2526  adenosylhomocysteinase  75.45 
 
 
498 aa  763    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.127167  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4454  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  69.78 
 
 
478 aa  705    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.787736  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0112  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  70.39 
 
 
478 aa  712    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161463  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1372  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  68.64 
 
 
489 aa  676    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.815282  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13277  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  69.51 
 
 
495 aa  686    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.85823  normal  0.713037 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0903  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  71.63 
 
 
496 aa  690    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4610  adenosylhomocysteinase  72.97 
 
 
483 aa  719    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1336  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  68.43 
 
 
489 aa  675    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1837  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  72.78 
 
 
494 aa  712    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.739236 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1192  adenosylhomocysteinase  69.37 
 
 
488 aa  676    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27010  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  73.52 
 
 
485 aa  720    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.200698  normal  0.751146 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1234  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  73.86 
 
 
512 aa  743    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.217111  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1198  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  100 
 
 
492 aa  1010    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.654496  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3640  adenosylhomocysteinase  68.64 
 
 
489 aa  672    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0966  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  72.65 
 
 
496 aa  701    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.161816  normal  0.729382 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0468  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  69.04 
 
 
476 aa  676    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.682945 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1432  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  69.51 
 
 
476 aa  689    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1354  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  68.43 
 
 
489 aa  675    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.483366  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1746  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  68.23 
 
 
485 aa  676    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.916125 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4056  adenosylhomocysteinase  72.1 
 
 
476 aa  722    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6321  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  72.51 
 
 
490 aa  726    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.598676  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6751  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  68.51 
 
 
486 aa  676    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0161  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.88 
 
 
493 aa  631  1e-180  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.716929  normal  0.0316991 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0174  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.73 
 
 
491 aa  618  1e-176  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0163  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.73 
 
 
491 aa  618  1e-176  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0156  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.32 
 
 
491 aa  611  1e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2304  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.08 
 
 
473 aa  597  1e-169  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0039  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.51 
 
 
473 aa  592  1e-168  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1642  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.77 
 
 
471 aa  586  1e-166  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0807  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.13 
 
 
472 aa  587  1e-166  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0314  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.43 
 
 
480 aa  581  1.0000000000000001e-165  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1548  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.37 
 
 
471 aa  580  1e-164  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0349  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.43 
 
 
480 aa  580  1e-164  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.249495  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1641  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60 
 
 
472 aa  577  1.0000000000000001e-163  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.148655 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04338  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.43 
 
 
480 aa  575  1.0000000000000001e-163  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3134  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  58.7 
 
 
479 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2301  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.92 
 
 
473 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0671  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.84 
 
 
471 aa  572  1.0000000000000001e-162  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.130844  normal  0.0412083 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2580  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.76 
 
 
479 aa  574  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4291  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.78 
 
 
466 aa  571  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2095  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.92 
 
 
471 aa  571  1e-161  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18319  adenosylhomocysteinase  58.27 
 
 
481 aa  570  1e-161  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.476955  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3964  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.78 
 
 
466 aa  569  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0626  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.1 
 
 
481 aa  570  1e-161  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.549264  normal  0.0480596 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0049  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.96 
 
 
509 aa  567  1e-160  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3247  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.6 
 
 
466 aa  567  1e-160  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0138  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.35 
 
 
472 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.599517  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3576  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.53 
 
 
465 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1736  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  57.96 
 
 
496 aa  561  1.0000000000000001e-159  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.235533  hitchhiker  0.00421364 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0119  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.2 
 
 
477 aa  558  1e-158  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0802054 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2347  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  58.94 
 
 
479 aa  561  1e-158  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.142273  normal  0.0154508 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2015  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.33 
 
 
466 aa  556  1e-157  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.15803  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34856  predicted protein  59.63 
 
 
482 aa  556  1e-157  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0352845  normal  0.14171 
 
 
-
 
NC_004310  BR2097  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.53 
 
 
466 aa  556  1e-157  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.311406  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4075  adenosylhomocysteinase  59 
 
 
512 aa  557  1e-157  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.437105  normal  0.0365971 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0822  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.77 
 
 
466 aa  556  1e-157  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4897  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.39 
 
 
468 aa  553  1e-156  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4433  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.39 
 
 
468 aa  553  1e-156  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.513976 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1514  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.15 
 
 
463 aa  554  1e-156  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1069  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  58.94 
 
 
471 aa  552  1e-156  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0988998 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2964  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.35 
 
 
463 aa  554  1e-156  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.317218  normal  0.0707693 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0921  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  58.74 
 
 
471 aa  553  1e-156  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0166  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.15 
 
 
463 aa  554  1e-156  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.539917 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3426  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.6 
 
 
462 aa  550  1e-155  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2377  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  58.5 
 
 
485 aa  551  1e-155  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.913153  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3854  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  58.4 
 
 
474 aa  551  1e-155  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.612683 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1597  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  58.98 
 
 
471 aa  549  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0741  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  58.42 
 
 
466 aa  550  1e-155  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.88616  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5919  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.16 
 
 
476 aa  549  1e-155  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2392  adenosylhomocysteinase  58.5 
 
 
470 aa  545  1e-154  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.499407  normal  0.234977 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4943  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  58.98 
 
 
468 aa  548  1e-154  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0590429  normal  0.487152 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3286  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.55 
 
 
477 aa  546  1e-154  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.19663  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4153  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  58.37 
 
 
481 aa  547  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.370152  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0597  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.61 
 
 
476 aa  546  1e-154  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2682  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.73 
 
 
463 aa  547  1e-154  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3005  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  57.72 
 
 
464 aa  547  1e-154  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309685  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4545  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  58.37 
 
 
469 aa  547  1e-154  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1924  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  57.58 
 
 
475 aa  542  1e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000709982  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2752  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  57.96 
 
 
478 aa  543  1e-153  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0927232  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2835  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  57.98 
 
 
461 aa  542  1e-153  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3333  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  58.54 
 
 
474 aa  541  1e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01751  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.43 
 
 
476 aa  543  1e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4060  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.51 
 
 
475 aa  543  1e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0475286  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18351  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  57.84 
 
 
477 aa  542  1e-153  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0813931  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0499  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  58.1 
 
 
468 aa  543  1e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248655 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>