More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2505 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0903  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  82.11 
 
 		 496 aa  813    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7602  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  79.54 
 
 		 485 aa  791    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.588423 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3102  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  76.68 
 
 		 491 aa  765    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0285183  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13277  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  71.55 
 
 		 495 aa  707    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.85823  normal  0.713037 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1269  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  74.04 
 
 		 492 aa  737    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000838657 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4610  adenosylhomocysteinase  80.42 
 
 		 483 aa  808    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4356  adenosylhomocysteinase  79.04 
 
 		 485 aa  800    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.39009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4075  adenosylhomocysteinase  67.08 
 
 		 512 aa  650    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.437105  normal  0.0365971 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3838  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  75.61 
 
 		 487 aa  744    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.646938  normal  0.0268466 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2505  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  100 
 
 		 478 aa  988    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1234  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  73.09 
 
 		 512 aa  714    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.217111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0039  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.18 
 
 		 473 aa  635    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0174  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  71.01 
 
 		 491 aa  708    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3640  adenosylhomocysteinase  72.96 
 
 		 489 aa  720    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27010  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  80.46 
 
 		 485 aa  787    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.200698  normal  0.751146 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3134  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.48 
 
 		 479 aa  644    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0966  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  81.47 
 
 		 496 aa  812    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.161816  normal  0.729382 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1392  Adenosylhomocysteinase  83.61 
 
 		 475 aa  836    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.23034 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2526  adenosylhomocysteinase  73.82 
 
 		 498 aa  732    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.127167  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4286  adenosylhomocysteinase  75.73 
 
 		 495 aa  741    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.285488  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0156  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  70.59 
 
 		 491 aa  704    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4454  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  82.64 
 
 		 478 aa  839    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.787736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0112  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  82.22 
 
 		 478 aa  840    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161463  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05310  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  72.67 
 
 		 519 aa  722    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1736  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.05 
 
 		 496 aa  640    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.235533  hitchhiker  0.00421364 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3755  adenosylhomocysteinase  83.05 
 
 		 478 aa  824    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.281872  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0763  adenosylhomocysteinase  84.03 
 
 		 475 aa  837    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.401892  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4257  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  74.32 
 
 		 498 aa  750    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.892606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3079  adenosylhomocysteinase  75 
 
 		 484 aa  744    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.439915 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6321  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  76.68 
 
 		 490 aa  764    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.598676  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6751  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  72.15 
 
 		 486 aa  722    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1336  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  73.32 
 
 		 489 aa  723    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09210  adenosylhomocysteinase  71.57 
 
 		 506 aa  718    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.53378  normal  0.263004 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4717  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  72.12 
 
 		 486 aa  704    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.149663 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1192  adenosylhomocysteinase  72.8 
 
 		 488 aa  712    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0161  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  71.58 
 
 		 493 aa  719    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.716929  normal  0.0316991 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1198  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  74.24 
 
 		 492 aa  739    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.654496  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0468  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  80.67 
 
 		 476 aa  796    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.682945 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1432  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  78.41 
 
 		 476 aa  783    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1354  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  73.32 
 
 		 489 aa  723    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.483366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1746  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  72.9 
 
 		 485 aa  715    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.916125 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1837  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  72.73 
 
 		 494 aa  714    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.739236 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0163  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  71.01 
 
 		 491 aa  709    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1372  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  73.53 
 
 		 489 aa  724    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.815282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2304  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.34 
 
 		 473 aa  637    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4056  adenosylhomocysteinase  85.71 
 
 		 476 aa  863    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1641  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.45 
 
 		 472 aa  629  1e-179  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.148655 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1642  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.94 
 
 		 471 aa  629  1e-179  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0807  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.92 
 
 		 472 aa  631  1e-179  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18319  adenosylhomocysteinase  63.66 
 
 		 481 aa  630  1e-179  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.476955  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3576  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.62 
 
 		 465 aa  625  1e-178  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2095  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.55 
 
 		 471 aa  625  1e-178  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2301  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.94 
 
 		 473 aa  624  1e-177  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0671  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.94 
 
 		 471 aa  618  1e-176  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.130844  normal  0.0412083 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2580  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.69 
 
 		 479 aa  618  1e-176  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4545  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.34 
 
 		 469 aa  620  1e-176  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2015  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.34 
 
 		 466 aa  615  1e-175  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.15803  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2097  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.55 
 
 		 466 aa  616  1e-175  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.311406  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34856  predicted protein  64.52 
 
 		 482 aa  615  1e-175  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0352845  normal  0.14171 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1548  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.94 
 
 		 471 aa  617  1e-175  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3964  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.11 
 
 		 466 aa  616  1e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0822  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.89 
 
 		 466 aa  617  1e-175  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4291  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.89 
 
 		 466 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0186  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.64 
 
 		 465 aa  613  9.999999999999999e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.168402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3005  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.09 
 
 		 464 aa  611  9.999999999999999e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309685  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3247  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.76 
 
 		 466 aa  609  1e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1589  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.85 
 
 		 471 aa  608  1e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1597  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.06 
 
 		 471 aa  610  1e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0049  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.92 
 
 		 509 aa  609  1e-173  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0314  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.51 
 
 		 480 aa  608  1e-173  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2347  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.02 
 
 		 479 aa  610  1e-173  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.142273  normal  0.0154508 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2377  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.98 
 
 		 485 aa  605  9.999999999999999e-173  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.913153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0117  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.79 
 
 		 472 aa  606  9.999999999999999e-173  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00161182  normal  0.625216 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4153  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.18 
 
 		 481 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.370152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0921  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.35 
 
 		 471 aa  604  9.999999999999999e-173  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5698  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.44 
 
 		 473 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.457969  normal  0.268273 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04338  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.59 
 
 		 480 aa  603  1.0000000000000001e-171  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3854  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.87 
 
 		 474 aa  604  1.0000000000000001e-171  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.612683 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0349  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.09 
 
 		 480 aa  603  1.0000000000000001e-171  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.249495  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0138  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.05 
 
 		 472 aa  598  1e-170  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.599517  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2752  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.64 
 
 		 478 aa  599  1e-170  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0927232  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0499  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.87 
 
 		 468 aa  598  1e-170  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248655 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4943  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.6 
 
 		 468 aa  600  1e-170  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0590429  normal  0.487152 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4623  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.84 
 
 		 463 aa  598  1e-170  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1202  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.53 
 
 		 477 aa  595  1e-169  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0213  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.81 
 
 		 472 aa  595  1e-169  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15851  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1514  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.47 
 
 		 463 aa  596  1e-169  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1924  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.05 
 
 		 475 aa  595  1e-169  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000709982  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0102  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.39 
 
 		 476 aa  595  1e-169  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.640394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4897  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.05 
 
 		 468 aa  597  1e-169  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3444  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.58 
 
 		 467 aa  596  1e-169  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.893839  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4433  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.05 
 
 		 468 aa  597  1e-169  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.513976 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0166  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.47 
 
 		 463 aa  596  1e-169  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.539917 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2964  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.26 
 
 		 463 aa  594  1e-169  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.317218  normal  0.0707693 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0041  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.87 
 
 		 465 aa  596  1e-169  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0210952  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2682  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.92 
 
 		 463 aa  595  1e-169  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0741  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.05 
 
 		 466 aa  595  1e-169  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.88616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01751  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.56 
 
 		 476 aa  598  1e-169  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1604  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.81 
 
 		 468 aa  596  1e-169  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177686  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20771  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.53 
 
 		 477 aa  595  1e-169  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.215343  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>