More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1069 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_2095  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  68.3 
 
 
471 aa  642    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1642  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  69.18 
 
 
471 aa  662    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1069  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  100 
 
 
471 aa  979    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0988998 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1641  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  68.97 
 
 
472 aa  650    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.148655 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0671  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  68.53 
 
 
471 aa  647    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.130844  normal  0.0412083 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1548  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.8 
 
 
471 aa  648    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0314  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  72.73 
 
 
480 aa  718    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0112  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.78 
 
 
478 aa  635    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161463  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0807  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  68.1 
 
 
472 aa  644    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3854  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  72.65 
 
 
474 aa  691    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.612683 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0349  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  72.94 
 
 
480 aa  720    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.249495  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0626  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  73.63 
 
 
481 aa  718    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.549264  normal  0.0480596 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04338  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  72.86 
 
 
480 aa  702    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4454  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.84 
 
 
478 aa  634  1e-180  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.787736  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0039  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.45 
 
 
473 aa  630  1e-179  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4056  adenosylhomocysteinase  64.63 
 
 
476 aa  625  1e-178  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0161  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.84 
 
 
493 aa  618  1e-176  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.716929  normal  0.0316991 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3005  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.52 
 
 
464 aa  619  1e-176  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309685  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0921  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  68.02 
 
 
471 aa  620  1e-176  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3426  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.6 
 
 
462 aa  619  1e-176  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0138  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.38 
 
 
472 aa  616  1e-175  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.599517  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4610  adenosylhomocysteinase  63.47 
 
 
483 aa  617  1e-175  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0763  adenosylhomocysteinase  63.81 
 
 
475 aa  615  1e-175  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.401892  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2304  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.22 
 
 
473 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4545  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.25 
 
 
469 aa  611  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4356  adenosylhomocysteinase  63.73 
 
 
485 aa  612  9.999999999999999e-175  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.39009  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0356  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.46 
 
 
464 aa  609  1e-173  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.31829  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0102  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.53 
 
 
476 aa  610  1e-173  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.640394  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3134  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.16 
 
 
479 aa  608  1e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0468  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.08 
 
 
476 aa  608  1e-173  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.682945 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01751  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.67 
 
 
476 aa  608  1e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0146  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.1 
 
 
476 aa  606  9.999999999999999e-173  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2580  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.95 
 
 
479 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2835  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.73 
 
 
461 aa  606  9.999999999999999e-173  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7602  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.58 
 
 
485 aa  607  9.999999999999999e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.588423 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3247  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.96 
 
 
466 aa  605  9.999999999999999e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1432  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.6 
 
 
476 aa  605  9.999999999999999e-173  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2505  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.24 
 
 
478 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1514  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.1 
 
 
463 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1294  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.67 
 
 
476 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000000792408  hitchhiker  0.0000266691 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4153  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.47 
 
 
481 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.370152  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0174  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.29 
 
 
491 aa  602  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1597  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.47 
 
 
471 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3576  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.95 
 
 
465 aa  602  1.0000000000000001e-171  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0163  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.29 
 
 
491 aa  602  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0166  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.1 
 
 
463 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.539917 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1875  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.52 
 
 
475 aa  598  1e-170  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0379318  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0093  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.38 
 
 
474 aa  598  1e-170  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1202  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.52 
 
 
477 aa  600  1e-170  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1924  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.64 
 
 
475 aa  599  1e-170  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000709982  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2964  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.67 
 
 
463 aa  600  1e-170  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.317218  normal  0.0707693 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3444  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.45 
 
 
467 aa  599  1e-170  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.893839  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5698  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.67 
 
 
473 aa  598  1e-170  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.457969  normal  0.268273 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2938  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.73 
 
 
465 aa  599  1e-170  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2392  adenosylhomocysteinase  63.46 
 
 
470 aa  599  1e-170  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.499407  normal  0.234977 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0049  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.53 
 
 
509 aa  599  1e-170  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1392  Adenosylhomocysteinase  62.29 
 
 
475 aa  599  1e-170  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.23034 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0499  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.03 
 
 
468 aa  599  1e-170  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248655 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2301  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.59 
 
 
473 aa  600  1e-170  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2918  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.24 
 
 
473 aa  598  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0041  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.73 
 
 
465 aa  598  1e-170  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0210952  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1346  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.52 
 
 
465 aa  599  1e-170  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20771  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.52 
 
 
477 aa  600  1e-170  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.215343  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5919  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.31 
 
 
476 aa  594  1e-169  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4433  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.67 
 
 
468 aa  594  1e-169  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.513976 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0822  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.89 
 
 
466 aa  594  1e-169  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3375  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.81 
 
 
472 aa  595  1e-169  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0156  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.87 
 
 
491 aa  597  1e-169  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1589  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.84 
 
 
471 aa  595  1e-169  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0119  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.67 
 
 
477 aa  597  1e-169  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0802054 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4897  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.67 
 
 
468 aa  594  1e-169  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0741  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.6 
 
 
466 aa  597  1e-169  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.88616  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0170  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.17 
 
 
472 aa  596  1e-169  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.525466  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2835  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.47 
 
 
472 aa  595  1e-169  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.187693  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0903  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.03 
 
 
496 aa  595  1e-169  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0186  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.81 
 
 
472 aa  596  1e-169  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.433145  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0272  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.47 
 
 
472 aa  595  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.786714  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2682  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.31 
 
 
463 aa  594  1e-169  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0117  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.83 
 
 
472 aa  596  1e-169  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00161182  normal  0.625216 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0254  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.47 
 
 
472 aa  595  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0199  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.81 
 
 
472 aa  597  1e-169  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.868266  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17511  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.95 
 
 
476 aa  593  1e-168  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.424526  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2015  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.68 
 
 
466 aa  593  1e-168  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.15803  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2097  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.89 
 
 
466 aa  594  1e-168  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.311406  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4943  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.67 
 
 
468 aa  593  1e-168  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0590429  normal  0.487152 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0213  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.32 
 
 
472 aa  592  1e-168  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15851  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2377  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.75 
 
 
485 aa  594  1e-168  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.913153  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0180  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.38 
 
 
472 aa  593  1e-168  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0500426 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2540  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.75 
 
 
479 aa  592  1e-168  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3165  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.9 
 
 
473 aa  592  1e-168  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0597  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.95 
 
 
476 aa  592  1e-168  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3842  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.3 
 
 
471 aa  593  1e-168  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.902922  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3333  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.96 
 
 
474 aa  592  1e-168  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27010  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.16 
 
 
485 aa  593  1e-168  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.200698  normal  0.751146 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1604  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.96 
 
 
468 aa  593  1e-168  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177686  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2440  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.4 
 
 
469 aa  592  1e-168  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18351  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.33 
 
 
477 aa  591  1e-168  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0813931  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2752  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.81 
 
 
478 aa  588  1e-167  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0927232  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0656  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.17 
 
 
473 aa  589  1e-167  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0735979 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2895  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.09 
 
 
470 aa  588  1e-167  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>