More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3854 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0314  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  73.74 
 
 
480 aa  742    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1642  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  70.91 
 
 
471 aa  679    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0349  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  73.32 
 
 
480 aa  738    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.249495  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1641  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  71.55 
 
 
472 aa  676    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.148655 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0161  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.74 
 
 
493 aa  648    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.716929  normal  0.0316991 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0671  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  71.12 
 
 
471 aa  671    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.130844  normal  0.0412083 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1548  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  69.68 
 
 
471 aa  667    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2095  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  71.12 
 
 
471 aa  673    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0156  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.46 
 
 
491 aa  648    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0807  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  71.34 
 
 
472 aa  673    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3854  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  100 
 
 
474 aa  987    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.612683 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0163  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.08 
 
 
491 aa  651    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04338  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  76.17 
 
 
480 aa  739    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1069  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  72.65 
 
 
471 aa  692    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0988998 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0921  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  71.34 
 
 
471 aa  652    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0174  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.01 
 
 
491 aa  653    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0626  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  75.21 
 
 
481 aa  729    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.549264  normal  0.0480596 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1432  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.14 
 
 
476 aa  624  1e-177  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4610  adenosylhomocysteinase  64.45 
 
 
483 aa  624  1e-177  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0112  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.92 
 
 
478 aa  619  1e-176  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161463  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0966  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.14 
 
 
496 aa  615  1e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.161816  normal  0.729382 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4056  adenosylhomocysteinase  63.5 
 
 
476 aa  615  1e-175  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4356  adenosylhomocysteinase  63.02 
 
 
485 aa  617  1e-175  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.39009  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2505  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.87 
 
 
478 aa  613  9.999999999999999e-175  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4454  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.1 
 
 
478 aa  613  9.999999999999999e-175  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.787736  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2835  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.52 
 
 
461 aa  614  9.999999999999999e-175  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3576  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.44 
 
 
465 aa  612  9.999999999999999e-175  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3005  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.79 
 
 
464 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309685  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0903  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.71 
 
 
496 aa  608  1e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1392  Adenosylhomocysteinase  63.5 
 
 
475 aa  608  1e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.23034 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2304  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.01 
 
 
473 aa  607  9.999999999999999e-173  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0039  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.77 
 
 
473 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3134  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.09 
 
 
479 aa  606  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2301  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.08 
 
 
473 aa  604  9.999999999999999e-173  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0186  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.09 
 
 
465 aa  603  1.0000000000000001e-171  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.168402  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7602  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.73 
 
 
485 aa  602  1.0000000000000001e-171  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.588423 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0597  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.85 
 
 
476 aa  602  1.0000000000000001e-171  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0117  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.35 
 
 
472 aa  602  1.0000000000000001e-171  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00161182  normal  0.625216 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2015  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.45 
 
 
466 aa  598  1e-170  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.15803  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2097  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.45 
 
 
466 aa  598  1e-170  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.311406  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0741  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.95 
 
 
466 aa  599  1e-170  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.88616  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1924  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.9 
 
 
475 aa  599  1e-170  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000709982  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0763  adenosylhomocysteinase  62.03 
 
 
475 aa  599  1e-170  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.401892  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4545  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.44 
 
 
469 aa  598  1e-170  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0618  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.36 
 
 
476 aa  598  1e-170  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.542253  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0138  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.42 
 
 
472 aa  595  1e-169  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.599517  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0822  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.24 
 
 
466 aa  597  1e-169  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0589  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.62 
 
 
469 aa  595  1e-169  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.792658  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4153  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.45 
 
 
481 aa  595  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.370152  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3426  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.01 
 
 
462 aa  596  1e-169  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0499  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.18 
 
 
468 aa  596  1e-169  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248655 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1604  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.39 
 
 
468 aa  596  1e-169  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177686  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0213  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.95 
 
 
472 aa  591  1e-168  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15851  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0931  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.79 
 
 
468 aa  591  1e-168  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0161754 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1597  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.02 
 
 
471 aa  592  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5919  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.84 
 
 
476 aa  592  1e-168  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2580  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.96 
 
 
479 aa  593  1e-168  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2392  adenosylhomocysteinase  62.29 
 
 
470 aa  593  1e-168  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.499407  normal  0.234977 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4623  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.95 
 
 
463 aa  592  1e-168  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0468  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.39 
 
 
476 aa  591  1e-168  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.682945 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01751  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.92 
 
 
476 aa  592  1e-168  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0119  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.89 
 
 
477 aa  594  1e-168  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0802054 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3333  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.68 
 
 
474 aa  591  1e-168  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0093  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.38 
 
 
474 aa  589  1e-167  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2674  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.79 
 
 
469 aa  589  1e-167  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4433  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.87 
 
 
468 aa  588  1e-167  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.513976 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5698  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.48 
 
 
473 aa  590  1e-167  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.457969  normal  0.268273 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4683  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.54 
 
 
479 aa  588  1e-167  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.355652  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4897  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.87 
 
 
468 aa  588  1e-167  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0170  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.44 
 
 
472 aa  588  1e-167  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.525466  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4943  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.87 
 
 
468 aa  588  1e-167  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0590429  normal  0.487152 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3656  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.68 
 
 
474 aa  588  1e-167  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0041  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.15 
 
 
465 aa  589  1e-167  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0210952  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1875  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.07 
 
 
475 aa  585  1e-166  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0379318  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1202  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.28 
 
 
477 aa  587  1e-166  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2377  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.33 
 
 
485 aa  584  1e-166  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.913153  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1514  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.16 
 
 
463 aa  584  1e-166  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0102  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.43 
 
 
476 aa  585  1e-166  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.640394  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1294  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.2 
 
 
476 aa  586  1e-166  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000000792408  hitchhiker  0.0000266691 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3444  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.38 
 
 
467 aa  587  1e-166  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.893839  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1589  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.59 
 
 
471 aa  586  1e-166  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0052  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.03 
 
 
434 aa  585  1e-166  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0193  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.69 
 
 
470 aa  585  1e-166  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.551187  hitchhiker  0.00261817 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0166  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.16 
 
 
463 aa  584  1e-166  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.539917 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2964  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.16 
 
 
463 aa  586  1e-166  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.317218  normal  0.0707693 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2132  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.24 
 
 
438 aa  588  1e-166  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2347  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.96 
 
 
479 aa  585  1e-166  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.142273  normal  0.0154508 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20771  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.28 
 
 
477 aa  587  1e-166  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.215343  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3964  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.58 
 
 
466 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3640  adenosylhomocysteinase  60.04 
 
 
489 aa  581  1.0000000000000001e-165  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0356  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.71 
 
 
464 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.31829  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4257  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.29 
 
 
498 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.892606  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3286  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.46 
 
 
477 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.19663  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3247  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.58 
 
 
466 aa  581  1.0000000000000001e-165  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4132  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.83 
 
 
479 aa  582  1.0000000000000001e-165  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.901613 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1336  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.1 
 
 
489 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1372  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.89 
 
 
489 aa  581  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.815282  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2682  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.01 
 
 
463 aa  582  1.0000000000000001e-165  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1354  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.1 
 
 
489 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.483366  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0163  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.31 
 
 
472 aa  580  1e-164  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.358648 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>