More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2095 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0112  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.92 
 
 		 478 aa  638    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161463  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0138  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  69.68 
 
 		 472 aa  638    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.599517  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0626  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  69.3 
 
 		 481 aa  666    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.549264  normal  0.0480596 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0314  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  70.3 
 
 		 480 aa  687    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2505  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.55 
 
 		 478 aa  642    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1641  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  86.6 
 
 		 472 aa  842    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.148655 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0039  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  68.5 
 
 		 473 aa  659    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4610  adenosylhomocysteinase  66.05 
 
 		 483 aa  651    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0671  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  85.77 
 
 		 471 aa  841    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.130844  normal  0.0412083 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1548  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  86.2 
 
 		 471 aa  845    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3134  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  69.1 
 
 		 479 aa  652    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3005  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  68.39 
 
 		 464 aa  637    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309685  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2304  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.02 
 
 		 473 aa  639    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0807  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  86.62 
 
 		 472 aa  848    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2095  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  100 
 
 		 471 aa  978    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04338  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  68.34 
 
 		 480 aa  663    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2301  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  68.61 
 
 		 473 aa  644    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1642  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  88.11 
 
 		 471 aa  867    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0349  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  70.09 
 
 		 480 aa  684    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.249495  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4356  adenosylhomocysteinase  65.57 
 
 		 485 aa  648    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.39009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0921  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  89.6 
 
 		 471 aa  848    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1432  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.23 
 
 		 476 aa  657    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2347  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  70.82 
 
 		 479 aa  642    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.142273  normal  0.0154508 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01751  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.65 
 
 		 476 aa  636    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3854  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  71.12 
 
 		 474 aa  677    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.612683 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2580  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  71.24 
 
 		 479 aa  652    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1069  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  68.3 
 
 		 471 aa  655    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0988998 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0763  adenosylhomocysteinase  65.13 
 
 		 475 aa  632  1e-180  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.401892  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2392  adenosylhomocysteinase  66.88 
 
 		 470 aa  632  1e-180  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.499407  normal  0.234977 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0161  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.2 
 
 		 493 aa  633  1e-180  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.716929  normal  0.0316991 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0156  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.97 
 
 		 491 aa  629  1e-179  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0163  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.97 
 
 		 491 aa  630  1e-179  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0174  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.97 
 
 		 491 aa  629  1e-179  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4056  adenosylhomocysteinase  64.08 
 
 		 476 aa  627  1e-179  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1202  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.1 
 
 		 477 aa  625  1e-178  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0117  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.67 
 
 		 472 aa  625  1e-178  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00161182  normal  0.625216 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3444  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  68.52 
 
 		 467 aa  626  1e-178  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.893839  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4454  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.29 
 
 		 478 aa  627  1e-178  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.787736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27010  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.34 
 
 		 485 aa  625  1e-178  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.200698  normal  0.751146 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0468  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.45 
 
 		 476 aa  626  1e-178  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.682945 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17511  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.38 
 
 		 476 aa  626  1e-178  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.424526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20771  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.1 
 
 		 477 aa  625  1e-178  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.215343  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0093  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.74 
 
 		 474 aa  621  1e-177  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1392  Adenosylhomocysteinase  64.21 
 
 		 475 aa  622  1e-177  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.23034 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7602  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.37 
 
 		 485 aa  621  1e-177  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.588423 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0146  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.16 
 
 		 476 aa  622  1e-177  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2540  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.38 
 
 		 479 aa  624  1e-177  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0966  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.37 
 
 		 496 aa  622  1e-177  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.161816  normal  0.729382 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0041  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  68.17 
 
 		 465 aa  622  1e-177  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0210952  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0180  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.67 
 
 		 472 aa  618  1e-176  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0500426 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1875  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.74 
 
 		 475 aa  620  1e-176  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0379318  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0102  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.38 
 
 		 476 aa  620  1e-176  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.640394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3165  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.24 
 
 		 473 aa  620  1e-176  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2918  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.45 
 
 		 473 aa  617  1e-176  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3656  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.31 
 
 		 474 aa  619  1e-176  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0903  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.58 
 
 		 496 aa  620  1e-176  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3333  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.69 
 
 		 474 aa  620  1e-176  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18351  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.67 
 
 		 477 aa  618  1e-176  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0813931  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1346  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.74 
 
 		 465 aa  615  1e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2842  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.81 
 
 		 473 aa  616  1e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2895  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.02 
 
 		 470 aa  614  1e-175  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0057  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.81 
 
 		 473 aa  616  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1294  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  68.17 
 
 		 476 aa  617  1e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000000792408  hitchhiker  0.0000266691 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3919  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.81 
 
 		 473 aa  616  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1701  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.81 
 
 		 473 aa  616  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4623  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  68.17 
 
 		 463 aa  617  1e-175  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0170  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.6 
 
 		 472 aa  615  1e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.525466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2835  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.24 
 
 		 472 aa  615  1e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.187693  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3134  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.81 
 
 		 473 aa  616  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3838  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.81 
 
 		 473 aa  616  1e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2440  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.96 
 
 		 469 aa  616  1e-175  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0272  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.24 
 
 		 472 aa  615  1e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.786714  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0186  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.67 
 
 		 465 aa  617  1e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.168402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0254  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.24 
 
 		 472 aa  615  1e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3417  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.81 
 
 		 473 aa  616  1e-175  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0213  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.95 
 
 		 472 aa  611  9.999999999999999e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15851  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0597  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.23 
 
 		 476 aa  613  9.999999999999999e-175  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1718  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.81 
 
 		 472 aa  613  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3576  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.59 
 
 		 465 aa  613  9.999999999999999e-175  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2938  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.53 
 
 		 465 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0618  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.23 
 
 		 476 aa  612  9.999999999999999e-175  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.542253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3842  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.88 
 
 		 471 aa  608  1e-173  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.902922  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0199  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.38 
 
 		 472 aa  610  1e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.868266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2132  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.06 
 
 		 438 aa  610  1e-173  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3375  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.81 
 
 		 472 aa  611  1e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3102  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.39 
 
 		 491 aa  611  1e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0285183  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0741  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.46 
 
 		 466 aa  608  1e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.88616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6321  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.18 
 
 		 490 aa  609  1e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.598676  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0193  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.45 
 
 		 470 aa  608  1e-173  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.551187  hitchhiker  0.00261817 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4286  adenosylhomocysteinase  63.14 
 
 		 495 aa  610  1e-173  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.285488  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4943  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.67 
 
 		 468 aa  609  1e-173  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0590429  normal  0.487152 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1336  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.67 
 
 		 489 aa  608  1e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5919  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.6 
 
 		 476 aa  609  1e-173  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4257  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.42 
 
 		 498 aa  610  1e-173  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.892606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0186  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.38 
 
 		 472 aa  610  1e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.433145  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0052  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.06 
 
 		 434 aa  608  1e-173  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1354  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.67 
 
 		 489 aa  608  1e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.483366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1746  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.39 
 
 		 485 aa  608  1e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.916125 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0119  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.38 
 
 		 477 aa  611  1e-173  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0802054 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18141  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.39 
 
 		 479 aa  609  1e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.305772  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>