More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2835 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3426  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  87.01 
 
 		 462 aa  837    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2015  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  77.66 
 
 		 466 aa  743    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.15803  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0138  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  68.98 
 
 		 472 aa  656    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.599517  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2097  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  77.87 
 
 		 466 aa  743    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.311406  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0589  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  70.56 
 
 		 469 aa  659    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.792658  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2842  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.95 
 
 		 473 aa  649    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01751  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.17 
 
 		 476 aa  642    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0199  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.81 
 
 		 472 aa  646    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.868266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3964  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  80.26 
 
 		 466 aa  766    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0822  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  78.31 
 
 		 466 aa  746    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3247  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  79.39 
 
 		 466 aa  758    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4291  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  79.61 
 
 		 466 aa  762    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1202  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.03 
 
 		 477 aa  639    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3134  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.95 
 
 		 473 aa  649    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0186  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  70.97 
 
 		 465 aa  669    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.168402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0057  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.95 
 
 		 473 aa  649    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0741  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  72.53 
 
 		 466 aa  679    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.88616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1514  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  82.65 
 
 		 463 aa  780    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3375  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.31 
 
 		 472 aa  644    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0102  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  68.11 
 
 		 476 aa  642    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.640394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0254  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.81 
 
 		 472 aa  647    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1604  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  70.75 
 
 		 468 aa  667    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177686  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2540  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.17 
 
 		 479 aa  639    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3444  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  70.84 
 
 		 467 aa  668    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.893839  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3919  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.95 
 
 		 473 aa  649    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3165  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.95 
 
 		 473 aa  647    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2895  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.03 
 
 		 470 aa  645    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4545  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  69.33 
 
 		 469 aa  645    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1589  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  69.68 
 
 		 471 aa  642    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2003  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  69.35 
 
 		 468 aa  652    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.012931  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4943  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  72.69 
 
 		 468 aa  677    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0590429  normal  0.487152 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1701  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.95 
 
 		 473 aa  649    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4074  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  87.36 
 
 		 461 aa  801    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.27026 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0931  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  70.78 
 
 		 468 aa  656    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0161754 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0117  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  68.61 
 
 		 472 aa  648    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00161182  normal  0.625216 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4153  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  69.79 
 
 		 481 aa  649    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.370152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3838  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.95 
 
 		 473 aa  649    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1597  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  70.11 
 
 		 471 aa  646    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2674  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  68.04 
 
 		 469 aa  649    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2835  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  100 
 
 		 461 aa  953    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0163  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  69.61 
 
 		 472 aa  652    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.358648 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2835  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.81 
 
 		 472 aa  647    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.187693  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0049  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  79.39 
 
 		 509 aa  757    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5698  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  70.75 
 
 		 473 aa  654    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.457969  normal  0.268273 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0166  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  82.65 
 
 		 463 aa  780    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.539917 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3576  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  78.62 
 
 		 465 aa  771    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2263  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.53 
 
 		 470 aa  643    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0180  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.9 
 
 		 472 aa  654    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0500426 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2440  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  72.39 
 
 		 469 aa  703    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0186  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.81 
 
 		 472 aa  647    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.433145  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4897  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  72.53 
 
 		 468 aa  678    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4433  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  72.53 
 
 		 468 aa  678    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.513976 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0272  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.81 
 
 		 472 aa  647    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.786714  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2918  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.59 
 
 		 473 aa  642    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4623  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  70.28 
 
 		 463 aa  662    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0499  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  71.49 
 
 		 468 aa  671    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248655 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2682  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  82.21 
 
 		 463 aa  780    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2964  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  83.51 
 
 		 463 aa  789    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.317218  normal  0.0707693 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2392  adenosylhomocysteinase  67.32 
 
 		 470 aa  663    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.499407  normal  0.234977 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3417  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.95 
 
 		 473 aa  649    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20771  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.03 
 
 		 477 aa  639    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.215343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2377  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  68.51 
 
 		 485 aa  632  1e-180  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.913153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0146  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.95 
 
 		 476 aa  631  1e-180  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0178  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.03 
 
 		 473 aa  634  1e-180  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3758  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.38 
 
 		 473 aa  630  1e-179  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1346  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.81 
 
 		 465 aa  625  1e-178  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2752  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  68.39 
 
 		 478 aa  627  1e-178  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0927232  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3005  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.52 
 
 		 464 aa  625  1e-178  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309685  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2938  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.03 
 
 		 465 aa  625  1e-178  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5919  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.67 
 
 		 476 aa  621  1e-177  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1875  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.38 
 
 		 475 aa  621  1e-177  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0379318  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17511  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.51 
 
 		 476 aa  620  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.424526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18171  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.58 
 
 		 472 aa  619  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0041  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.16 
 
 		 465 aa  620  1e-176  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0210952  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18351  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65 
 
 		 477 aa  620  1e-176  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0813931  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1294  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.94 
 
 		 476 aa  615  1e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000000792408  hitchhiker  0.0000266691 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1718  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.78 
 
 		 472 aa  616  1e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0356  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.87 
 
 		 464 aa  617  1e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.31829  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18141  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.57 
 
 		 479 aa  615  1e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.305772  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0119  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.02 
 
 		 477 aa  614  9.999999999999999e-175  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0802054 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0170  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.79 
 
 		 472 aa  614  9.999999999999999e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.525466  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4683  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.95 
 
 		 479 aa  612  9.999999999999999e-175  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.355652  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0597  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.24 
 
 		 476 aa  612  9.999999999999999e-175  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0656  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.1 
 
 		 473 aa  613  9.999999999999999e-175  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0735979 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0213  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.36 
 
 		 472 aa  609  1e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15851  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3842  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.86 
 
 		 471 aa  608  1e-173  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.902922  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0618  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.03 
 
 		 476 aa  608  1e-173  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.542253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2519  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.18 
 
 		 514 aa  605  9.999999999999999e-173  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.595006 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3286  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.45 
 
 		 477 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.19663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4060  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.38 
 
 		 475 aa  605  9.999999999999999e-173  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0475286  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3333  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.87 
 
 		 474 aa  605  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0093  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.87 
 
 		 474 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3854  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.52 
 
 		 474 aa  601  1.0000000000000001e-171  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.612683 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3656  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.66 
 
 		 474 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0193  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.43 
 
 		 470 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.551187  hitchhiker  0.00261817 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1718  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.66 
 
 		 481 aa  601  1.0000000000000001e-171  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.415255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0186  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.87 
 
 		 470 aa  599  1e-170  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4132  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.39 
 
 		 479 aa  598  1e-170  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.901613 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0314  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.89 
 
 		 480 aa  598  1e-170  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0349  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.68 
 
 		 480 aa  596  1e-169  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.249495  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>