More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4943 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0356  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  70.04 
 
 		 464 aa  661    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.31829  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2015  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  72.44 
 
 		 466 aa  689    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.15803  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1875  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  69.18 
 
 		 475 aa  662    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0379318  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0138  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  69.16 
 
 		 472 aa  654    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.599517  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0093  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  68.8 
 
 		 474 aa  652    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2097  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  72.65 
 
 		 466 aa  690    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.311406  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0254  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.74 
 
 		 472 aa  642    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2842  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.81 
 
 		 473 aa  654    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3758  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.74 
 
 		 473 aa  640    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01751  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.09 
 
 		 476 aa  637    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3656  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  68.8 
 
 		 474 aa  652    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0186  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  82.8 
 
 		 465 aa  800    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.168402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3247  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  74.15 
 
 		 466 aa  706    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0186  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.37 
 
 		 470 aa  644    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4897  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  98.5 
 
 		 468 aa  957    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0213  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  68.03 
 
 		 472 aa  649    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15851  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3919  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.81 
 
 		 473 aa  654    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2519  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.37 
 
 		 514 aa  641    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.595006 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2377  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  82.98 
 
 		 485 aa  792    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.913153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4433  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  98.5 
 
 		 468 aa  957    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.513976 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0057  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.81 
 
 		 473 aa  654    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4545  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  84.58 
 
 		 469 aa  812    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0117  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  76.02 
 
 		 472 aa  746    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00161182  normal  0.625216 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1514  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  73 
 
 		 463 aa  686    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2895  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  69.02 
 
 		 470 aa  665    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3375  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.95 
 
 		 472 aa  645    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2392  adenosylhomocysteinase  68.47 
 
 		 470 aa  665    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.499407  normal  0.234977 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0049  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  72.65 
 
 		 509 aa  701    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1294  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  69.55 
 
 		 476 aa  660    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000000792408  hitchhiker  0.0000266691 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2918  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.31 
 
 		 473 aa  650    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3426  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  72.9 
 
 		 462 aa  678    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3444  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  77.04 
 
 		 467 aa  735    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.893839  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3134  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.81 
 
 		 473 aa  654    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3165  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.81 
 
 		 473 aa  652    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1604  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  91.24 
 
 		 468 aa  884    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177686  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3286  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.8 
 
 		 477 aa  634    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.19663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0931  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  82.54 
 
 		 468 aa  789    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0161754 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1589  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  82.94 
 
 		 471 aa  801    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2003  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  73.39 
 
 		 468 aa  681    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.012931  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0166  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  73 
 
 		 463 aa  686    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.539917 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1701  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.81 
 
 		 473 aa  654    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4074  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  71.34 
 
 		 461 aa  647    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.27026 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1346  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  70.04 
 
 		 465 aa  665    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3842  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  69.18 
 
 		 471 aa  650    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.902922  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4153  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  83.4 
 
 		 481 aa  800    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.370152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0193  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  69.4 
 
 		 470 aa  659    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.551187  hitchhiker  0.00261817 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0178  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.74 
 
 		 473 aa  640    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3838  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.81 
 
 		 473 aa  654    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1597  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  83.16 
 
 		 471 aa  802    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2752  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  86.27 
 
 		 478 aa  818    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0927232  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2674  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  71.27 
 
 		 469 aa  670    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0170  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  68.67 
 
 		 472 aa  655    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.525466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2964  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  73 
 
 		 463 aa  682    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.317218  normal  0.0707693 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2835  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  72.69 
 
 		 461 aa  689    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0163  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  73.4 
 
 		 472 aa  679    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.358648 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2835  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.95 
 
 		 472 aa  644    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.187693  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0741  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  95.7 
 
 		 466 aa  912    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.88616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5698  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  87.34 
 
 		 473 aa  832    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.457969  normal  0.268273 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3576  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  71.89 
 
 		 465 aa  696    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5919  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  68.59 
 
 		 476 aa  650    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2263  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  69.89 
 
 		 470 aa  656    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2440  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  70.94 
 
 		 469 aa  682    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0186  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.74 
 
 		 472 aa  644    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.433145  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0180  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.38 
 
 		 472 aa  648    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0500426 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0272  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.95 
 
 		 472 aa  644    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.786714  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3005  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  69.18 
 
 		 464 aa  673    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309685  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0199  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.74 
 
 		 472 aa  644    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.868266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0041  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  69.76 
 
 		 465 aa  664    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0210952  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4943  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  100 
 
 		 468 aa  971    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0590429  normal  0.487152 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2682  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  73.71 
 
 		 463 aa  687    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4291  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  73.29 
 
 		 466 aa  703    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0822  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  72.44 
 
 		 466 aa  689    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0119  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.59 
 
 		 477 aa  644    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0802054 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4623  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  75.81 
 
 		 463 aa  726    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0589  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  81.21 
 
 		 469 aa  783    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.792658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3964  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  73.5 
 
 		 466 aa  704    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3333  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  68.59 
 
 		 474 aa  652    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0618  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  68.66 
 
 		 476 aa  637    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.542253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3417  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.81 
 
 		 473 aa  654    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0656  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  68.45 
 
 		 473 aa  637    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0735979 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0499  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  91.24 
 
 		 468 aa  882    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248655 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2938  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  69.83 
 
 		 465 aa  664    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1202  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.31 
 
 		 477 aa  632  1e-180  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0146  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.82 
 
 		 476 aa  634  1e-180  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0102  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  68.03 
 
 		 476 aa  633  1e-180  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.640394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0597  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  68.02 
 
 		 476 aa  632  1e-180  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2130  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  69.08 
 
 		 432 aa  634  1e-180  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.421073  normal  0.933423 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1228  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  70.17 
 
 		 435 aa  632  1e-180  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.389132  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20771  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.31 
 
 		 477 aa  632  1e-180  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.215343  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4683  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.74 
 
 		 479 aa  629  1e-179  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.355652  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2540  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.62 
 
 		 479 aa  625  1e-178  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1718  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.17 
 
 		 481 aa  625  1e-178  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.415255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2002  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.74 
 
 		 481 aa  623  1e-177  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0314  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.96 
 
 		 480 aa  622  1e-177  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0349  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.74 
 
 		 480 aa  621  1e-177  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.249495  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4356  adenosylhomocysteinase  65.21 
 
 		 485 aa  623  1e-177  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.39009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4060  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.88 
 
 		 475 aa  620  1e-176  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0475286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18351  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.09 
 
 		 477 aa  618  1e-176  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0813931  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4132  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.4 
 
 		 479 aa  617  1e-175  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.901613 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18171  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.45 
 
 		 472 aa  616  1e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>