More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0460 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5068  adenosylhomocysteinase  98.08 
 
 		 469 aa  956    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.724438  n/a   
 
 
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NC_007005  Psyr_0460  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  100 
 
 		 469 aa  972    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0968  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  72.88 
 
 		 474 aa  703    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0571313 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03570  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  86.45 
 
 		 465 aa  838    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0760213  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5280  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  94.88 
 
 		 469 aa  918    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0532  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  91.18 
 
 		 465 aa  874    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5025  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  94.24 
 
 		 469 aa  908    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009524  PsycPRwf_0915  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  72.63 
 
 		 473 aa  696    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0469  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  76 
 
 		 467 aa  738    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.410988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1448  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  73.31 
 
 		 474 aa  705    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0449  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  89.98 
 
 		 469 aa  874    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05620  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  90.83 
 
 		 469 aa  877    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0534  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  77.22 
 
 		 465 aa  719    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0691  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  76.06 
 
 		 468 aa  720    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000631949  unclonable  0.000000000159146 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3043  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  76.5 
 
 		 464 aa  728    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.365932  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4849  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  93.39 
 
 		 469 aa  903    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697439 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0489  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  93.82 
 
 		 469 aa  906    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0414  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  76.96 
 
 		 470 aa  710    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.301828  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2003  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  57.05 
 
 		 441 aa  515  1.0000000000000001e-145  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_006369  lpl1998  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  57.05 
 
 		 441 aa  514  1e-144  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_008789  Hhal_1675  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.57 
 
 		 430 aa  514  1e-144  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.146428  n/a   
 
 
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NC_007484  Noc_2679  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  57.92 
 
 		 437 aa  506  9.999999999999999e-143  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.455308  n/a   
 
 
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NC_011365  Gdia_2130  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  58.61 
 
 		 432 aa  503  1e-141  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.421073  normal  0.933423 
 
 
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NC_009484  Acry_1228  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  58.82 
 
 		 435 aa  503  1e-141  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.389132  n/a   
 
 
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NC_014230  CA2559_03785  S-adenosylhomocysteine hydrolase  56.93 
 
 		 438 aa  493  9.999999999999999e-139  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.186899  n/a   
 
 
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NC_010117  COXBURSA331_A0052  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  55.98 
 
 		 434 aa  492  9.999999999999999e-139  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008576  Mmc1_3331  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  56.65 
 
 		 441 aa  489  1e-137  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.276204  normal  1 
 
 
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NC_009727  CBUD_2132  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  55.98 
 
 		 438 aa  491  1e-137  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
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NC_006686  CND00240  adenosylhomocysteinase, putative  56.8 
 
 		 431 aa  481  1e-134  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.672849  n/a   
 
 
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NC_013730  Slin_4338  adenosylhomocysteinase  55.86 
 
 		 436 aa  480  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.588356  normal  0.419207 
 
 
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NC_013061  Phep_3674  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  56.03 
 
 		 438 aa  480  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013037  Dfer_4522  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  55.99 
 
 		 438 aa  477  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0895169  normal  1 
 
 
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NC_009441  Fjoh_1579  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  54.99 
 
 		 438 aa  478  1e-133  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0204825  n/a   
 
 
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BN001308  ANIA_01263  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase (Eurofung)  55.18 
 
 		 449 aa  468  1.0000000000000001e-131  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0454669  normal  0.150578 
 
 
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NC_009042  PICST_76463  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  54.76 
 
 		 449 aa  470  1.0000000000000001e-131  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_1392  Adenosylhomocysteinase  51.08 
 
 		 475 aa  463  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.23034 
 
 
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NC_009483  Gura_3005  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52.53 
 
 		 464 aa  462  1e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309685  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1875  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  53.11 
 
 		 475 aa  458  9.999999999999999e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0379318  n/a   
 
 
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NC_002977  MCA0138  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  53.36 
 
 		 472 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.599517  n/a   
 
 
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NC_010803  Clim_1642  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  53.02 
 
 		 471 aa  459  9.999999999999999e-129  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008255  CHU_0610  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  54.31 
 
 		 435 aa  460  9.999999999999999e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011060  Ppha_2095  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.59 
 
 		 471 aa  455  1e-127  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008820  P9303_01751  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52.57 
 
 		 476 aa  456  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_013510  Tcur_4056  adenosylhomocysteinase  50.1 
 
 		 476 aa  456  1e-127  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007404  Tbd_2519  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.59 
 
 		 514 aa  456  1e-127  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.595006 
 
 
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NC_007643  Rru_A3444  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  54.75 
 
 		 467 aa  456  1e-127  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.893839  n/a   
 
 
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NC_013235  Namu_4257  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.28 
 
 		 498 aa  455  1e-127  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.892606  normal  1 
 
 
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NC_011059  Paes_0807  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  53.02 
 
 		 472 aa  457  1e-127  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013159  Svir_27010  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.68 
 
 		 485 aa  457  1e-127  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.200698  normal  0.751146 
 
 
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NC_008609  Ppro_0041  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  54.05 
 
 		 465 aa  456  1e-127  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0210952  n/a   
 
 
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NC_008816  A9601_18351  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  53.54 
 
 		 477 aa  457  1e-127  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0813931  n/a   
 
 
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NC_014158  Tpau_1192  adenosylhomocysteinase  49.71 
 
 		 488 aa  456  1e-127  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010513  Xfasm12_0349  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52.21 
 
 		 480 aa  453  1.0000000000000001e-126  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.249495  n/a   
 
 
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NC_010577  XfasM23_0314  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52.21 
 
 		 480 aa  454  1.0000000000000001e-126  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_4356  adenosylhomocysteinase  50.48 
 
 		 485 aa  453  1.0000000000000001e-126  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.39009  normal  1 
 
 
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NC_007514  Cag_1548  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52.79 
 
 		 471 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007516  Syncc9605_0102  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  53.83 
 
 		 476 aa  454  1.0000000000000001e-126  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.640394  normal  1 
 
 
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NC_007517  Gmet_1294  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  53.24 
 
 		 476 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000000792408  hitchhiker  0.0000266691 
 
 
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NC_007577  PMT9312_1718  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  53.61 
 
 		 472 aa  455  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012918  GM21_2938  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  53.74 
 
 		 465 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_014148  Plim_3615  adenosylhomocysteinase  54.29 
 
 		 450 aa  454  1.0000000000000001e-126  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_0112  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.39 
 
 		 478 aa  452  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161463  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_7602  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.97 
 
 		 485 aa  453  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.588423 
 
 
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NC_011146  Gbem_1346  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  53.54 
 
 		 465 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008146  Mmcs_1336  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.3 
 
 		 489 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008254  Meso_3576  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52.41 
 
 		 465 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2440  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52.3 
 
 		 469 aa  453  1.0000000000000001e-126  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3842  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52.72 
 
 		 471 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.902922  n/a   
 
 
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NC_008699  Noca_1432  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.4 
 
 		 476 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1354  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.3 
 
 		 489 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.483366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1746  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.98 
 
 		 485 aa  455  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.916125 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18141  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  53.33 
 
 		 479 aa  453  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.305772  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2842  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.58 
 
 		 473 aa  451  1e-125  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2505  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  49.9 
 
 		 478 aa  448  1e-125  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4717  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.89 
 
 		 486 aa  451  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.149663 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0057  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.58 
 
 		 473 aa  451  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0763  adenosylhomocysteinase  50.39 
 
 		 475 aa  448  1e-125  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.401892  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3375  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.28 
 
 		 472 aa  448  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0671  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52.32 
 
 		 471 aa  449  1e-125  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.130844  normal  0.0412083 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2039  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  54.74 
 
 		 442 aa  451  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.970546  normal  0.403341 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0254  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.08 
 
 		 472 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3165  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.58 
 
 		 473 aa  449  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4454  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  49.8 
 
 		 478 aa  451  1e-125  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.787736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1701  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.58 
 
 		 473 aa  451  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4545  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  53.91 
 
 		 469 aa  450  1e-125  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3838  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.58 
 
 		 473 aa  451  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0199  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.29 
 
 		 472 aa  449  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.868266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3134  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.58 
 
 		 473 aa  451  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2835  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.89 
 
 		 472 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.187693  n/a   
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_3919  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.58 
 
 		 473 aa  451  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2263  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  53.13 
 
 		 470 aa  449  1e-125  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1372  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.1 
 
 		 489 aa  451  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.815282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2918  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.58 
 
 		 473 aa  449  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0272  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.89 
 
 		 472 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.786714  n/a   
 
 
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NC_009091  P9301_18171  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52.83 
 
 		 472 aa  451  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010084  Bmul_0180  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.68 
 
 		 472 aa  451  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0500426 
 
 
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NC_008785  BMASAVP1_A3417  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.58 
 
 		 473 aa  451  1e-125  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010002  Daci_5919  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.97 
 
 		 476 aa  449  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009953  Sare_0903  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.49 
 
 		 496 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0463237 
 
 
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NC_010831  Cphamn1_1641  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52.2 
 
 		 472 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.148655 
 
 
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