More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1228 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



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Alignment on homolog gene

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Organism name

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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2003  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  72.6 
 
 
441 aa  674    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1998  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  72.37 
 
 
441 aa  673    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2679  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  73.36 
 
 
437 aa  670    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.455308  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4943  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  70.17 
 
 
468 aa  635    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0590429  normal  0.487152 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2130  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  85.28 
 
 
432 aa  769    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.421073  normal  0.933423 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0117  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  69.98 
 
 
472 aa  645    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00161182  normal  0.625216 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0186  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  70.19 
 
 
465 aa  640    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.168402  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4433  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  69.96 
 
 
468 aa  635    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.513976 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1228  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  100 
 
 
435 aa  904    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.389132  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3331  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  73.13 
 
 
441 aa  644    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.276204  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0589  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  69.81 
 
 
469 aa  645    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.792658  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2132  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  71.03 
 
 
438 aa  651    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0052  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  70.8 
 
 
434 aa  649    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0741  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  69.18 
 
 
466 aa  636    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.88616  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4897  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  69.96 
 
 
468 aa  635    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1675  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  75.88 
 
 
430 aa  673    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.146428  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0931  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  68.97 
 
 
468 aa  634    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0161754 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1589  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  68.88 
 
 
471 aa  633  1e-180  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1597  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  69.1 
 
 
471 aa  631  1e-180  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4545  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.96 
 
 
469 aa  634  1e-180  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1604  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  69.07 
 
 
468 aa  631  1e-180  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177686  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0499  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  68.75 
 
 
468 aa  629  1e-179  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248655 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2377  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  68.15 
 
 
485 aa  626  1e-178  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.913153  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3444  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.89 
 
 
467 aa  625  1e-178  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.893839  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4153  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.3 
 
 
481 aa  627  1e-178  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.370152  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2752  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  68.29 
 
 
478 aa  625  1e-178  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0927232  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5698  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  68.03 
 
 
473 aa  623  1e-177  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.457969  normal  0.268273 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0163  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.16 
 
 
472 aa  607  9.999999999999999e-173  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.358648 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4338  adenosylhomocysteinase  71.16 
 
 
436 aa  605  9.999999999999999e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.588356  normal  0.419207 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2842  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.53 
 
 
473 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0057  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.53 
 
 
473 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1701  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.53 
 
 
473 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3919  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.53 
 
 
473 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3838  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.53 
 
 
473 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4623  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.32 
 
 
463 aa  602  1.0000000000000001e-171  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3417  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.53 
 
 
473 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3134  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.53 
 
 
473 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4522  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  70 
 
 
438 aa  600  1e-170  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0895169  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0180  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.1 
 
 
472 aa  597  1e-170  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0500426 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3165  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.53 
 
 
473 aa  600  1e-170  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2003  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  68.33 
 
 
468 aa  599  1e-170  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.012931  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2674  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.95 
 
 
469 aa  599  1e-170  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3674  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  70.07 
 
 
438 aa  595  1e-169  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0610  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  69.77 
 
 
435 aa  595  1e-169  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3375  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.89 
 
 
472 aa  592  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0254  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.89 
 
 
472 aa  593  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2835  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.68 
 
 
472 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.187693  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3576  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.72 
 
 
465 aa  593  1e-168  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0272  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.68 
 
 
472 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.786714  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2918  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.25 
 
 
473 aa  592  1e-168  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2015  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.95 
 
 
466 aa  590  1e-167  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.15803  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2097  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.17 
 
 
466 aa  590  1e-167  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.311406  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0199  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.68 
 
 
472 aa  591  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.868266  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2440  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.51 
 
 
469 aa  590  1e-167  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0186  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.46 
 
 
472 aa  591  1e-167  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.433145  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0822  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.31 
 
 
466 aa  587  1e-166  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3333  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.52 
 
 
474 aa  585  1e-166  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3656  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.09 
 
 
474 aa  584  1e-166  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2392  adenosylhomocysteinase  62.88 
 
 
470 aa  585  1e-166  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.499407  normal  0.234977 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0138  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.1 
 
 
472 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.599517  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0093  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.3 
 
 
474 aa  584  1.0000000000000001e-165  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0213  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.15 
 
 
472 aa  581  1.0000000000000001e-165  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15851  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3247  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.81 
 
 
466 aa  582  1.0000000000000001e-165  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1294  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.64 
 
 
476 aa  581  1.0000000000000001e-165  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000000792408  hitchhiker  0.0000266691 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3964  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.38 
 
 
466 aa  581  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2895  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.5 
 
 
470 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4291  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.38 
 
 
466 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3758  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.89 
 
 
473 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0178  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.68 
 
 
473 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0170  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.58 
 
 
472 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.525466  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2835  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.07 
 
 
461 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2263  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.03 
 
 
470 aa  582  1.0000000000000001e-165  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0041  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.85 
 
 
465 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0210952  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4610  adenosylhomocysteinase  61.78 
 
 
483 aa  578  1e-164  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND00240  adenosylhomocysteinase, putative  67.05 
 
 
431 aa  578  1e-164  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.672849  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2505  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.97 
 
 
478 aa  580  1e-164  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3005  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.26 
 
 
464 aa  578  1e-164  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309685  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2540  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.29 
 
 
479 aa  578  1e-164  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3426  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.72 
 
 
462 aa  578  1e-164  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1875  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.42 
 
 
475 aa  576  1.0000000000000001e-163  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0379318  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1202  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.77 
 
 
477 aa  575  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1346  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.15 
 
 
465 aa  574  1.0000000000000001e-163  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2938  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.58 
 
 
465 aa  576  1.0000000000000001e-163  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20771  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.77 
 
 
477 aa  575  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.215343  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3615  adenosylhomocysteinase  65.45 
 
 
450 aa  572  1.0000000000000001e-162  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1548  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.6 
 
 
471 aa  572  1.0000000000000001e-162  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0119  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.85 
 
 
477 aa  573  1.0000000000000001e-162  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0802054 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01751  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.91 
 
 
476 aa  569  1e-161  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1641  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.23 
 
 
472 aa  568  1e-161  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.148655 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1514  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.5 
 
 
463 aa  569  1e-161  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0671  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.8 
 
 
471 aa  570  1e-161  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.130844  normal  0.0412083 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3286  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.33 
 
 
477 aa  568  1e-161  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.19663  normal 
 
 
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NC_009049  Rsph17029_0166  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.5 
 
 
463 aa  569  1e-161  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.539917 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0193  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.53 
 
 
470 aa  571  1e-161  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.551187  hitchhiker  0.00261817 
 
 
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NC_009428  Rsph17025_2964  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.85 
 
 
463 aa  568  1e-161  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.317218  normal  0.0707693 
 
 
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NC_008686  Pden_2682  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.79 
 
 
463 aa  568  1e-161  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1432  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.92 
 
 
476 aa  569  1e-161  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011662  Tmz1t_3842  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.88 
 
 
471 aa  570  1e-161  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.902922  n/a   
 
 
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NC_008782  Ajs_0618  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.97 
 
 
476 aa  568  1e-161  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.542253  normal 
 
 
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NC_009921  Franean1_0112  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.71 
 
 
478 aa  565  1e-160  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161463  normal 
 
 
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