More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0469 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



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Alignment on homolog gene

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Organism name

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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010322  PputGB1_5025  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  76.18 
 
 
469 aa  733    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5068  adenosylhomocysteinase  76.82 
 
 
469 aa  730    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.724438  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0460  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  76 
 
 
469 aa  738    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0968  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  74.41 
 
 
474 aa  722    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0571313 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5280  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  74.68 
 
 
469 aa  722    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03570  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  76.61 
 
 
465 aa  728    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0760213  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0449  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  77.47 
 
 
469 aa  741    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0489  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  76.39 
 
 
469 aa  735    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0469  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  100 
 
 
467 aa  967    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.410988  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0915  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  73.23 
 
 
473 aa  717    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0414  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  76.05 
 
 
470 aa  703    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.301828  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1448  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  74.84 
 
 
474 aa  724    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0691  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  70.38 
 
 
468 aa  682    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000631949  unclonable  0.000000000159146 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0534  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  71.52 
 
 
465 aa  679    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05620  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  75.79 
 
 
469 aa  736    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3043  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  77.54 
 
 
464 aa  751    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.365932  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4849  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  76.61 
 
 
469 aa  738    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0697439 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0532  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  76.61 
 
 
465 aa  735    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1228  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.78 
 
 
435 aa  505  9.999999999999999e-143  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.389132  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2003  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  55.08 
 
 
441 aa  500  1e-140  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1998  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  54.86 
 
 
441 aa  499  1e-140  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03785  S-adenosylhomocysteine hydrolase  59.73 
 
 
438 aa  499  1e-140  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.186899  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2130  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  58.62 
 
 
432 aa  499  1e-140  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.421073  normal  0.933423 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2679  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  55.6 
 
 
437 aa  494  9.999999999999999e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.455308  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0052  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  56.66 
 
 
434 aa  492  9.999999999999999e-139  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2132  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  56.43 
 
 
438 aa  489  1e-137  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1675  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  57.3 
 
 
430 aa  486  1e-136  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.146428  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3674  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  55.65 
 
 
438 aa  476  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND00240  adenosylhomocysteinase, putative  55.1 
 
 
431 aa  473  1e-132  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.672849  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1579  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  57.94 
 
 
438 aa  474  1e-132  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0204825  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4338  adenosylhomocysteinase  55.65 
 
 
436 aa  472  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.588356  normal  0.419207 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3331  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  55.96 
 
 
441 aa  471  1.0000000000000001e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.276204  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4522  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  56.82 
 
 
438 aa  465  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0895169  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0610  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  55.48 
 
 
435 aa  462  1e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01263  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase (Eurofung)  54.06 
 
 
449 aa  459  9.999999999999999e-129  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0454669  normal  0.150578 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3615  adenosylhomocysteinase  55.6 
 
 
450 aa  458  9.999999999999999e-129  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1432  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.88 
 
 
476 aa  456  1e-127  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76463  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  54.42 
 
 
449 aa  456  1e-127  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2505  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.3 
 
 
478 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7602  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.59 
 
 
485 aa  452  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.588423 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2039  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  53.73 
 
 
442 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.970546  normal  0.403341 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4056  adenosylhomocysteinase  49.7 
 
 
476 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0468  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  49.7 
 
 
476 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.682945 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1392  Adenosylhomocysteinase  49.7 
 
 
475 aa  449  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.23034 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4257  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.88 
 
 
498 aa  448  1e-125  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.892606  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18171  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.88 
 
 
472 aa  449  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1548  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.56 
 
 
471 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0102  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52.93 
 
 
476 aa  446  1.0000000000000001e-124  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.640394  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4454  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.51 
 
 
478 aa  446  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.787736  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27010  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.51 
 
 
485 aa  446  1.0000000000000001e-124  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.200698  normal  0.751146 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2440  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52.08 
 
 
469 aa  446  1.0000000000000001e-124  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1746  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  49.31 
 
 
485 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.916125 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0314  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.62 
 
 
480 aa  442  1e-123  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0112  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.3 
 
 
478 aa  444  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161463  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1718  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.3 
 
 
472 aa  444  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2835  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.46 
 
 
461 aa  442  1e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2263  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52.19 
 
 
470 aa  442  1e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2095  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.1 
 
 
471 aa  442  1e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01751  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52.51 
 
 
476 aa  443  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18351  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.05 
 
 
477 aa  444  1e-123  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0813931  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4356  adenosylhomocysteinase  49.41 
 
 
485 aa  439  9.999999999999999e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.39009  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0807  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.19 
 
 
472 aa  441  9.999999999999999e-123  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1202  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.01 
 
 
477 aa  439  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0349  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  49.8 
 
 
480 aa  441  9.999999999999999e-123  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.249495  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0763  adenosylhomocysteinase  49.01 
 
 
475 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.401892  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1642  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  49.8 
 
 
471 aa  439  9.999999999999999e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4075  adenosylhomocysteinase  48.93 
 
 
512 aa  439  9.999999999999999e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.437105  normal  0.0365971 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1336  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  48.71 
 
 
489 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4717  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  48.91 
 
 
486 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.149663 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20771  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.01 
 
 
477 aa  439  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.215343  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4623  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52.93 
 
 
463 aa  439  9.999999999999999e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1192  adenosylhomocysteinase  48.42 
 
 
488 aa  440  9.999999999999999e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1354  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  48.71 
 
 
489 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.483366  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18141  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.84 
 
 
479 aa  440  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.305772  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17511  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.67 
 
 
476 aa  435  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.424526  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3640  adenosylhomocysteinase  48.52 
 
 
489 aa  436  1e-121  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3444  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.01 
 
 
467 aa  436  1e-121  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.893839  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0903  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  49.11 
 
 
496 aa  436  1e-121  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3755  adenosylhomocysteinase  48.62 
 
 
478 aa  435  1e-121  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.281872  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1069  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.21 
 
 
471 aa  437  1e-121  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0988998 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1372  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  48.51 
 
 
489 aa  437  1e-121  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.815282  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0966  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  48.81 
 
 
496 aa  436  1e-121  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.161816  normal  0.729382 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1198  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  47.86 
 
 
492 aa  436  1e-121  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.654496  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4610  adenosylhomocysteinase  49.42 
 
 
483 aa  437  1e-121  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3426  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.46 
 
 
462 aa  434  1e-120  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4153  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.79 
 
 
481 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.370152  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09210  adenosylhomocysteinase  47.63 
 
 
506 aa  434  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.53378  normal  0.263004 
 
 
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NC_009636  Smed_3247  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.46 
 
 
466 aa  432  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1837  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  49.2 
 
 
494 aa  432  1e-120  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.739236 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0741  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.67 
 
 
466 aa  431  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.88616  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0626  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  48.73 
 
 
481 aa  429  1e-119  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.549264  normal  0.0480596 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1514  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.77 
 
 
463 aa  430  1e-119  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007512  Plut_0671  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.83 
 
 
471 aa  430  1e-119  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.130844  normal  0.0412083 
 
 
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NC_007513  Syncc9902_0146  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.05 
 
 
476 aa  429  1e-119  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0186  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.98 
 
 
465 aa  429  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.168402  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1597  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51 
 
 
471 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_008048  Sala_0163  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.24 
 
 
472 aa  429  1e-119  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.358648 
 
 
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NC_011004  Rpal_4545  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.8 
 
 
469 aa  430  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009485  BBta_5698  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.88 
 
 
473 aa  428  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.457969  normal  0.268273 
 
 
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NC_011886  Achl_1269  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  47.67 
 
 
492 aa  429  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000838657 
 
 
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