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for query gene Pput_4849 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



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Alignment on homolog gene
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E-value
Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5068  adenosylhomocysteinase  93.39 
 
 		 469 aa  897    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.724438  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0460  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  93.39 
 
 		 469 aa  902    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0968  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  73.31 
 
 		 474 aa  710    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0571313 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03570  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  87.26 
 
 		 465 aa  841    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0760213  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5280  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  96.8 
 
 		 469 aa  927    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0915  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  73.92 
 
 		 473 aa  705    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0414  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  76.09 
 
 		 470 aa  710    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.301828  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0534  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  78.96 
 
 		 465 aa  734    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0532  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  91.36 
 
 		 465 aa  879    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0469  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  76.61 
 
 		 467 aa  737    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.410988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0691  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  78.96 
 
 		 468 aa  734    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000631949  unclonable  0.000000000159146 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0489  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  97.65 
 
 		 469 aa  938    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1448  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  73.73 
 
 		 474 aa  712    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05620  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  90.19 
 
 		 469 aa  878    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5025  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  98.72 
 
 		 469 aa  964    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0449  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  91.9 
 
 		 469 aa  895    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3043  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  78.04 
 
 		 464 aa  741    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.365932  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4849  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  100 
 
 		 469 aa  972    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697439 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2003  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  56.4 
 
 		 441 aa  511  1e-143  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1998  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  56.18 
 
 		 441 aa  510  1e-143  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1675  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.26 
 
 		 430 aa  507  9.999999999999999e-143  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.146428  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2679  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  57.48 
 
 		 437 aa  500  1e-140  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.455308  n/a   
 
 
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NC_011365  Gdia_2130  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  58.39 
 
 		 432 aa  496  1e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.421073  normal  0.933423 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1228  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  57.14 
 
 		 435 aa  494  9.999999999999999e-139  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.389132  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03785  S-adenosylhomocysteine hydrolase  56.71 
 
 		 438 aa  492  9.999999999999999e-139  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.186899  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3331  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  57.08 
 
 		 441 aa  486  1e-136  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.276204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0052  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  55.65 
 
 		 434 aa  487  1e-136  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009727  CBUD_2132  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  55.43 
 
 		 438 aa  484  1e-135  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
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NC_013061  Phep_3674  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  56.28 
 
 		 438 aa  481  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND00240  adenosylhomocysteinase, putative  56.59 
 
 		 431 aa  476  1e-133  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.672849  n/a   
 
 
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NC_013730  Slin_4338  adenosylhomocysteinase  54.96 
 
 		 436 aa  474  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.588356  normal  0.419207 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1579  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  53.93 
 
 		 438 aa  474  1e-132  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0204825  n/a   
 
 
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NC_013037  Dfer_4522  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  54.98 
 
 		 438 aa  474  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0895169  normal  1 
 
 
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BN001308  ANIA_01263  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase (Eurofung)  54.85 
 
 		 449 aa  462  1e-129  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0454669  normal  0.150578 
 
 
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NC_009042  PICST_76463  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  54.64 
 
 		 449 aa  461  1e-129  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_1392  Adenosylhomocysteinase  50.89 
 
 		 475 aa  458  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.23034 
 
 
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NC_007577  PMT9312_1718  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52.67 
 
 		 472 aa  461  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008816  A9601_18351  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  53.35 
 
 		 477 aa  461  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0813931  n/a   
 
 
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NC_010513  Xfasm12_0349  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52.2 
 
 		 480 aa  455  1e-127  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.249495  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1875  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52.53 
 
 		 475 aa  456  1e-127  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0379318  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0314  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52.2 
 
 		 480 aa  456  1e-127  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0610  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52.99 
 
 		 435 aa  457  1e-127  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1192  adenosylhomocysteinase  50.4 
 
 		 488 aa  455  1e-127  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010803  Clim_1642  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.81 
 
 		 471 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002977  MCA0138  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52.38 
 
 		 472 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.599517  n/a   
 
 
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NC_008820  P9303_01751  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52.63 
 
 		 476 aa  453  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_011662  Tmz1t_3842  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52.62 
 
 		 471 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.902922  n/a   
 
 
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NC_013159  Svir_27010  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.38 
 
 		 485 aa  454  1.0000000000000001e-126  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.200698  normal  0.751146 
 
 
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NC_007643  Rru_A3444  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  53.94 
 
 		 467 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.893839  n/a   
 
 
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NC_013235  Namu_4257  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.88 
 
 		 498 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.892606  normal  1 
 
 
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NC_009483  Gura_3005  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.21 
 
 		 464 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309685  n/a   
 
 
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NC_008347  Mmar10_2440  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52.42 
 
 		 469 aa  454  1.0000000000000001e-126  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009091  P9301_18171  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52.64 
 
 		 472 aa  453  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2938  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  53.04 
 
 		 465 aa  449  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_009338  Mflv_4717  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.89 
 
 		 486 aa  450  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.149663 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0102  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  53.68 
 
 		 476 aa  449  1e-125  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.640394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0112  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.29 
 
 		 478 aa  451  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4454  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  49.51 
 
 		 478 aa  451  1e-125  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.787736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0807  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.81 
 
 		 472 aa  450  1e-125  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7602  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.78 
 
 		 485 aa  450  1e-125  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.588423 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1346  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52.83 
 
 		 465 aa  448  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1336  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  49.9 
 
 		 489 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4056  adenosylhomocysteinase  49.51 
 
 		 476 aa  451  1e-125  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1432  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.4 
 
 		 476 aa  449  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1354  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  49.9 
 
 		 489 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.483366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1746  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.39 
 
 		 485 aa  450  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.916125 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18141  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.39 
 
 		 479 aa  451  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.305772  n/a   
 
 
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NC_010551  BamMC406_0199  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.82 
 
 		 472 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.868266  normal  1 
 
 
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NC_014165  Tbis_0763  adenosylhomocysteinase  50 
 
 		 475 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.401892  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2505  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  49.9 
 
 		 478 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010622  Bphy_2918  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.82 
 
 		 473 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2519  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.39 
 
 		 514 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.595006 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17511  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.93 
 
 		 476 aa  447  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.424526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1548  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.31 
 
 		 471 aa  445  1.0000000000000001e-124  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1294  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52.43 
 
 		 476 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000000792408  hitchhiker  0.0000266691 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0254  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.62 
 
 		 472 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3615  adenosylhomocysteinase  52.79 
 
 		 450 aa  446  1.0000000000000001e-124  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2095  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.01 
 
 		 471 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4545  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52.69 
 
 		 469 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5919  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.77 
 
 		 476 aa  447  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3755  adenosylhomocysteinase  49.6 
 
 		 478 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.281872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2835  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.42 
 
 		 472 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.187693  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0180  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.49 
 
 		 472 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0500426 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3576  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.92 
 
 		 465 aa  445  1.0000000000000001e-124  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2263  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52.32 
 
 		 470 aa  445  1.0000000000000001e-124  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1372  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  49.7 
 
 		 489 aa  448  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.815282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0186  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.82 
 
 		 472 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.433145  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0272  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.42 
 
 		 472 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.786714  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0041  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52.83 
 
 		 465 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0210952  n/a   
 
 
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NC_007434  BURPS1710b_0057  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.41 
 
 		 473 aa  444  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A3375  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.52 
 
 		 472 aa  444  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007513  Syncc9902_0146  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  53.04 
 
 		 476 aa  443  1e-123  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007925  RPC_4153  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.58 
 
 		 481 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.370152  normal  1 
 
 
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NC_007958  RPD_1597  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.9 
 
 		 471 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013132  Cpin_2039  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  53.81 
 
 		 442 aa  444  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.970546  normal  0.403341 
 
 
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NC_009953  Sare_0903  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.3 
 
 		 496 aa  442  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0463237 
 
 
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NC_010814  Glov_0356  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52.12 
 
 		 464 aa  443  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.31829  n/a   
 
 
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NC_008785  BMASAVP1_A3417  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.41 
 
 		 473 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012856  Rpic12D_3333  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.41 
 
 		 474 aa  441  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008819  NATL1_20771  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.81 
 
 		 477 aa  444  1e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.215343  normal  1 
 
 
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