More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0626 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1641  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  69.94 
 
 
472 aa  667    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.148655 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1642  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  70.73 
 
 
471 aa  681    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0807  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  69.51 
 
 
472 aa  670    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0349  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  84.82 
 
 
480 aa  855    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.249495  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0671  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  70.94 
 
 
471 aa  677    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.130844  normal  0.0412083 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1548  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.98 
 
 
471 aa  661    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0161  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.09 
 
 
493 aa  639    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.716929  normal  0.0316991 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1069  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  73.63 
 
 
471 aa  719    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0988998 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3854  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  75.21 
 
 
474 aa  730    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.612683 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0314  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  85.03 
 
 
480 aa  858    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0921  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  68.16 
 
 
471 aa  638    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2095  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  69.3 
 
 
471 aa  659    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04338  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  88.36 
 
 
480 aa  878    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0626  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  100 
 
 
481 aa  995    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.549264  normal  0.0480596 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0112  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.26 
 
 
478 aa  631  1e-180  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161463  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0163  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.14 
 
 
491 aa  634  1e-180  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0174  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.14 
 
 
491 aa  634  1e-180  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0156  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.51 
 
 
491 aa  630  1e-179  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4610  adenosylhomocysteinase  63.22 
 
 
483 aa  630  1e-179  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4056  adenosylhomocysteinase  62.84 
 
 
476 aa  625  1e-178  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4454  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.42 
 
 
478 aa  627  1e-178  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.787736  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0499  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.6 
 
 
468 aa  624  1e-177  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248655 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4153  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.77 
 
 
481 aa  621  1e-177  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.370152  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0039  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.52 
 
 
473 aa  624  1e-177  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4356  adenosylhomocysteinase  63.32 
 
 
485 aa  622  1e-177  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.39009  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0117  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.25 
 
 
472 aa  618  1e-176  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00161182  normal  0.625216 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2304  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.62 
 
 
473 aa  619  1e-176  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3134  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.74 
 
 
479 aa  615  1e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2580  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.09 
 
 
479 aa  615  1e-175  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1604  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.53 
 
 
468 aa  614  1e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177686  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0741  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.17 
 
 
466 aa  615  1e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.88616  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4545  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.32 
 
 
469 aa  614  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4943  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.38 
 
 
468 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0590429  normal  0.487152 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4897  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.38 
 
 
468 aa  611  9.999999999999999e-175  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4433  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.38 
 
 
468 aa  611  9.999999999999999e-175  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.513976 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0138  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.45 
 
 
472 aa  606  9.999999999999999e-173  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.599517  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18319  adenosylhomocysteinase  61.86 
 
 
481 aa  607  9.999999999999999e-173  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.476955  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2377  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.75 
 
 
485 aa  607  9.999999999999999e-173  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.913153  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0119  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.07 
 
 
477 aa  604  9.999999999999999e-173  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0802054 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3444  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.61 
 
 
467 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.893839  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3102  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.28 
 
 
491 aa  605  9.999999999999999e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0285183  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1597  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.68 
 
 
471 aa  604  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2835  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.89 
 
 
461 aa  604  9.999999999999999e-173  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0186  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.82 
 
 
465 aa  607  9.999999999999999e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.168402  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2347  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.23 
 
 
479 aa  606  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.142273  normal  0.0154508 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6321  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.49 
 
 
490 aa  607  9.999999999999999e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.598676  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2505  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.13 
 
 
478 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0049  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.61 
 
 
509 aa  603  1.0000000000000001e-171  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0966  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.62 
 
 
496 aa  602  1.0000000000000001e-171  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.161816  normal  0.729382 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5698  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.47 
 
 
473 aa  601  1.0000000000000001e-171  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.457969  normal  0.268273 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7602  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.75 
 
 
485 aa  600  1e-170  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.588423 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2526  adenosylhomocysteinase  59.39 
 
 
498 aa  600  1e-170  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.127167  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1924  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.26 
 
 
475 aa  600  1e-170  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000709982  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1589  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.47 
 
 
471 aa  600  1e-170  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3005  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.11 
 
 
464 aa  600  1e-170  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309685  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3576  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.75 
 
 
465 aa  599  1e-170  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2392  adenosylhomocysteinase  61.54 
 
 
470 aa  600  1e-170  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.499407  normal  0.234977 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0468  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.75 
 
 
476 aa  600  1e-170  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.682945 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27010  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.75 
 
 
485 aa  598  1e-170  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.200698  normal  0.751146 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0589  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.42 
 
 
469 aa  600  1e-170  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.792658  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0180  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.99 
 
 
472 aa  596  1e-169  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0500426 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4623  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.61 
 
 
463 aa  595  1e-169  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2674  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.39 
 
 
469 aa  595  1e-169  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4286  adenosylhomocysteinase  61.16 
 
 
495 aa  596  1e-169  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.285488  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0931  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.25 
 
 
468 aa  597  1e-169  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0161754 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2301  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.68 
 
 
473 aa  597  1e-169  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0597  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.32 
 
 
476 aa  597  1e-169  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2752  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.69 
 
 
478 aa  595  1e-169  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0927232  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4291  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.98 
 
 
466 aa  596  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3964  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.98 
 
 
466 aa  595  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0903  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.91 
 
 
496 aa  596  1e-169  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0618  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.52 
 
 
476 aa  596  1e-169  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.542253  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3426  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.03 
 
 
462 aa  597  1e-169  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1875  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.52 
 
 
475 aa  592  1e-168  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0379318  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2918  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.16 
 
 
473 aa  594  1e-168  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0763  adenosylhomocysteinase  60 
 
 
475 aa  592  1e-168  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.401892  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5919  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.86 
 
 
476 aa  593  1e-168  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1514  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.25 
 
 
463 aa  592  1e-168  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1294  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.18 
 
 
476 aa  592  1e-168  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000000792408  hitchhiker  0.0000266691 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3247  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.14 
 
 
466 aa  593  1e-168  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2835  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.37 
 
 
472 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.187693  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0166  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.25 
 
 
463 aa  592  1e-168  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.539917 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0272  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.37 
 
 
472 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.786714  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1392  Adenosylhomocysteinase  60.75 
 
 
475 aa  592  1e-168  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.23034 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0356  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.82 
 
 
464 aa  590  1e-167  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.31829  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3375  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.95 
 
 
472 aa  591  1e-167  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3165  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.95 
 
 
473 aa  590  1e-167  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0163  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.18 
 
 
472 aa  588  1e-167  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.358648 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2440  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.6 
 
 
469 aa  589  1e-167  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0186  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.75 
 
 
472 aa  590  1e-167  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.433145  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0041  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.14 
 
 
465 aa  589  1e-167  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0210952  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1432  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.33 
 
 
476 aa  590  1e-167  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2895  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.95 
 
 
470 aa  591  1e-167  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0199  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.75 
 
 
472 aa  590  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.868266  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0254  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.16 
 
 
472 aa  590  1e-167  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2015  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.54 
 
 
466 aa  585  1e-166  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.15803  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2097  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.54 
 
 
466 aa  585  1e-166  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.311406  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3919  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.75 
 
 
473 aa  586  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0822  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.54 
 
 
466 aa  587  1e-166  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3417  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.75 
 
 
473 aa  586  1e-166  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>